ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009808AATA44204351675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_009808AAGT3122812381150 %25 %25 %0 %9 %157325510
3NC_009808ACTA3477947891150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
4NC_009808TTGT366436654120 %75 %25 %0 %0 %Non-Coding
5NC_009808GTCA3863786471125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
6NC_009808AAAT3869287031275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_009808ATTT3924392531125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_009808ATTT3945894691225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_009808ATAA4995399671575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
10NC_009808TAAA310291103021275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_009808CAAT414081140961650 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
12NC_009808TGAT317081170921225 %50 %25 %0 %8 %157325520
13NC_009808AATG318451184621250 %25 %25 %0 %8 %157325520
14NC_009808TTCT33265432664110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
15NC_009808TATG332734327441125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
16NC_009808GAAA333928339391275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
17NC_009808GAAA335839358501275 %0 %25 %0 %8 %171259276
18NC_009808AAAT337294373041175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_009808AAGA341413414241275 %0 %25 %0 %8 %157325530
20NC_009808AATG341812418231250 %25 %25 %0 %8 %157325530
21NC_009808TTTA343547435581225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_009808GAAA446053460681675 %0 %25 %0 %6 %157325531
23NC_009808AAGA349318493301375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
24NC_009808GAAA349394494051275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
25NC_009808CAAA351425514361275 %0 %0 %25 %8 %157325533
26NC_009808TATT351523515331125 %75 %0 %0 %9 %157325534
27NC_009808TGCA357911579231325 %25 %25 %25 %7 %157325538
28NC_009808AAAT358721587311175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_009808TTAA358916589271250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_009808ATTT359282592921125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_009808ATTC361487614971125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
32NC_009808TAAA362744627541175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
33NC_009808AGAT365835658461250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
34NC_009808CTAG367430674401125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
35NC_009808TTGA368480684901125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
36NC_009808TAAA469132691471675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
37NC_009808AAAT370307703181275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_009808TTTC37141571426120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
39NC_009808TTCC37208972099110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
40NC_009808TAAA479043790581675 %25 %0 %0 %6 %157325554
41NC_009808AATA384673846841275 %25 %0 %0 %0 %157325554
42NC_009808TAGT385216852261125 %50 %25 %0 %9 %157325554
43NC_009808CAAT385521855311150 %25 %0 %25 %9 %157325554
44NC_009808ACTA386329863391150 %25 %0 %25 %9 %157325554
45NC_009808TTAC386964869741125 %50 %0 %25 %9 %157325554
46NC_009808ATAA388387883971175 %25 %0 %0 %9 %157325554
47NC_009808ATTC390071900821225 %50 %0 %25 %8 %157325554
48NC_009808AGAA391984919951275 %0 %25 %0 %8 %157325554
49NC_009808TGTT39893698946110 %75 %25 %0 %9 %157325554
50NC_009808ATCC31039261039371225 %25 %0 %50 %8 %157325593
51NC_009808TTCT3104186104196110 %75 %0 %25 %9 %157325593
52NC_009808TCTA31043081043191225 %50 %0 %25 %8 %157325593
53NC_009808AAGG31044431044531150 %0 %50 %0 %9 %157325593
54NC_009808GAGG31071771071881225 %0 %75 %0 %8 %157325593
55NC_009808AGGT31073831073941225 %25 %50 %0 %8 %157325593
56NC_009808TAAG31085031085131150 %25 %25 %0 %9 %157325593
57NC_009808CTTT3109947109958120 %75 %0 %25 %8 %157325593
58NC_009808AAAT31104891104991175 %25 %0 %0 %9 %157325593
59NC_009808CTTT3113026113036110 %75 %0 %25 %9 %157325593
60NC_009808AAAT31142461142571275 %25 %0 %0 %8 %157325593
61NC_009808GGAA31164451164561250 %0 %50 %0 %8 %157325593
62NC_009808TCAA31169051169161250 %25 %0 %25 %8 %157325593
63NC_009808ATAG41216191216341650 %25 %25 %0 %6 %157325593
64NC_009808AATT31224461224571250 %50 %0 %0 %8 %157325593
65NC_009808ATTT31227001227101125 %75 %0 %0 %9 %157325593
66NC_009808ATTC31240121240241325 %50 %0 %25 %7 %157325593
67NC_009808GAAA31250581250691275 %0 %25 %0 %8 %157325593
68NC_009808ATGA31269471269581250 %25 %25 %0 %8 %157325593
69NC_009808TTGA31333031333141225 %50 %25 %0 %8 %157325593
70NC_009808TTCC3133763133774120 %50 %0 %50 %8 %157325593
71NC_009808TAAA31364251364351175 %25 %0 %0 %9 %157325593
72NC_009808ATTT31397201397301125 %75 %0 %0 %9 %157325593
73NC_009808TAAA41406781406921575 %25 %0 %0 %6 %157325593
74NC_009808CTTA31417061417161125 %50 %0 %25 %9 %157325593
75NC_009808CCTT3145766145776110 %50 %0 %50 %9 %157325593
76NC_009808GGAT31462821462931225 %25 %50 %0 %8 %157325593
77NC_009808ATCT31516021516131225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
78NC_009808CGAT31547431547551325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
79NC_009808AGAT31561181561291250 %25 %25 %0 %0 %157325596
80NC_009808GAAA31576541576651275 %0 %25 %0 %8 %157325596
81NC_009808TTCT3158224158235120 %75 %0 %25 %8 %157325596
82NC_009808TGAA31601361601471250 %25 %25 %0 %8 %157325596