ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009808	AAG	4	2197	2208	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325511
2	NC_009808	AAG	4	3015	3026	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325511
3	NC_009808	AAG	4	7363	7374	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009808	TCT	4	8419	8429	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009808	TAA	4	14891	14902	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009808	TTC	4	24027	24038	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325521
7	NC_009808	GCA	4	28936	28947	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_009808	CTA	4	29095	29106	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_009808	TAT	4	29712	29723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_009808	ATT	4	30535	30545	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009808	AGA	4	32490	32501	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009808	TTG	4	36244	36254	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	171259276
13	NC_009808	TTC	4	36689	36700	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171259276
14	NC_009808	TAA	4	38105	38116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009808	GCA	4	42217	42228	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	157325530
16	NC_009808	TTA	4	43889	43900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009808	ATA	4	44182	44192	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009808	ATA	4	56611	56622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157325537
19	NC_009808	ATT	4	60901	60911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009808	TCT	4	61134	61144	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_009808	ATT	4	61500	61510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009808	TGA	4	62095	62106	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009808	TCT	4	67536	67547	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009808	AAT	4	69417	69427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009808	GAA	4	70263	70273	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009808	CAT	4	73446	73456	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	157325554
27	NC_009808	AGA	5	73832	73846	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157325554
28	NC_009808	ATA	4	74244	74255	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	157325554
29	NC_009808	TCT	4	76392	76403	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325554
30	NC_009808	TAT	5	84529	84543	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	157325554
31	NC_009808	TTC	4	100323	100334	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325593
32	NC_009808	ATA	4	110146	110156	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	157325593
33	NC_009808	GAA	4	110593	110604	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325593
34	NC_009808	AGA	4	111210	111221	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325593
35	NC_009808	TAC	4	112299	112310	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	157325593
36	NC_009808	ATA	4	113686	113697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157325593
37	NC_009808	AGA	5	115149	115163	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157325593
38	NC_009808	AGA	5	115236	115250	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157325593
39	NC_009808	GAA	4	115654	115665	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325593
40	NC_009808	AAT	4	120725	120736	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157325593
41	NC_009808	ATA	4	122910	122920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	157325593
42	NC_009808	TCT	4	134555	134566	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325593
43	NC_009808	TAT	4	136525	136536	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	157325593
44	NC_009808	TAG	4	137910	137921	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	157325593
45	NC_009808	TTC	4	138994	139005	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325593
46	NC_009808	TAT	4	140063	140073	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	157325593
47	NC_009808	GAA	4	149885	149896	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325593
48	NC_009808	CAA	4	157691	157702	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	157325596

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast