ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009808	A	12	246	257	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009808	AATA	4	420	435	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_009808	AAGT	3	1228	1238	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	157325510
4	NC_009808	AAG	4	2197	2208	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325511
5	NC_009808	AAG	4	3015	3026	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157325511
6	NC_009808	TATTTA	3	3711	3729	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_009808	A	12	4564	4575	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_009808	TTAAAT	3	4639	4657	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_009808	ACTA	3	4779	4789	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_009808	TA	9	6291	6307	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_009808	TTGT	3	6643	6654	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009808	TAGGT	3	6712	6726	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_009808	AAAAC	3	6756	6770	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
14	NC_009808	TTGAA	3	7227	7241	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_009808	AAG	4	7363	7374	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009808	A	17	8002	8018	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_009808	A	15	8251	8265	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_009808	TCT	4	8419	8429	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009808	GTCA	3	8637	8647	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009808	AAAT	3	8692	8703	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009808	ATTT	3	9243	9253	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009808	ATTT	3	9458	9469	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009808	ATAA	4	9953	9967	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_009808	TATTTT	3	10165	10182	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_009808	ATTCGA	3	10235	10253	19	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
26	NC_009808	TAAA	3	10291	10302	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_009808	T	17	13525	13541	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_009808	CAAT	4	14081	14096	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
29	NC_009808	TAA	4	14891	14902	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_009808	A	15	16036	16050	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_009808	TTATT	4	16100	16118	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_009808	TGAT	3	17081	17092	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	157325520
33	NC_009808	TTTGA	3	17548	17562	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	157325520
34	NC_009808	AATG	3	18451	18462	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	157325520
35	NC_009808	T	15	19085	19099	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	157325520
36	NC_009808	AAATA	3	23117	23130	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	157325521
37	NC_009808	A	14	23494	23507	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	157325521
38	NC_009808	TTC	4	24027	24038	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325521
39	NC_009808	T	12	26869	26880	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	157325522
40	NC_009808	GCA	4	28936	28947	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_009808	CTA	4	29095	29106	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_009808	TAT	4	29712	29723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_009808	A	12	30513	30524	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_009808	ATT	4	30535	30545	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_009808	T	12	30862	30873	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_009808	T	22	31434	31455	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_009808	A	14	31730	31743	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_009808	A	13	32439	32451	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_009808	AGA	4	32490	32501	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_009808	TTCT	3	32654	32664	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009808	TATG	3	32734	32744	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_009808	TTCATT	3	33375	33393	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
53	NC_009808	GAAA	3	33928	33939	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_009808	GAAA	3	35839	35850	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	171259276
55	NC_009808	TTG	4	36244	36254	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	171259276
56	NC_009808	TTC	4	36689	36700	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171259276
57	NC_009808	AG	6	37056	37066	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_009808	AAAT	3	37294	37304	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_009808	TC	6	37671	37681	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	157325527
60	NC_009808	TA	7	37907	37919	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_009808	TAA	4	38105	38116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_009808	TAGGAA	3	38135	38153	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_009808	AAGA	3	41413	41424	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	157325530
64	NC_009808	AATG	3	41812	41823	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	157325530
65	NC_009808	GCA	4	42217	42228	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	157325530
66	NC_009808	TG	6	42254	42264	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	157325530
67	NC_009808	TTTA	3	43547	43558	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_009808	TTA	4	43889	43900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_009808	ATA	4	44182	44192	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_009808	GAAA	4	46053	46068	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	157325531
71	NC_009808	CTTTGA	3	46919	46935	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
72	NC_009808	TAAAA	4	47265	47284	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_009808	AT	6	49172	49183	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_009808	AAGA	3	49318	49330	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_009808	GAAA	3	49394	49405	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009808	TC	6	50348	50358	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_009808	T	15	50652	50666	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_009808	CAAA	3	51425	51436	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	157325533
79	NC_009808	TATT	3	51523	51533	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	157325534
80	NC_009808	ATA	4	56611	56622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157325537
81	NC_009808	TTAGG	3	56751	56764	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_009808	TATTAG	3	56897	56914	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_009808	TGCA	3	57911	57923	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	157325538
84	NC_009808	CTTCT	4	58547	58565	19	0 %	60 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
85	NC_009808	AAAT	3	58721	58731	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_009808	TTAA	3	58916	58927	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_009808	ATTT	3	59282	59292	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_009808	GAGCAG	7	60242	60283	42	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	7 %	157325539
89	NC_009808	ATT	4	60901	60911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_009808	TCT	4	61134	61144	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_009808	ATTC	3	61487	61497	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_009808	ATT	4	61500	61510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_009808	TGA	4	62095	62106	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_009808	TAAA	3	62744	62754	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_009808	TA	6	64128	64138	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_009808	TA	6	64323	64333	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	157325543
97	NC_009808	A	16	65682	65697	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_009808	GAAAA	3	65734	65749	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_009808	ATAGA	4	65750	65768	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
100	NC_009808	AGAT	3	65835	65846	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_009808	CTAG	3	67430	67440	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_009808	AGAGAA	3	67470	67488	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
103	NC_009808	TCT	4	67536	67547	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_009808	TTGA	3	68480	68490	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009808	AT	6	69118	69129	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_009808	TAAA	4	69132	69147	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_009808	AAT	4	69417	69427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_009808	ATTTC	3	69905	69918	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
109	NC_009808	GAA	4	70263	70273	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_009808	AAAT	3	70307	70318	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_009808	TTTC	3	71415	71426	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009808	A	12	71619	71630	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_009808	TTCC	3	72089	72099	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
114	NC_009808	TTCTT	3	72145	72158	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
115	NC_009808	CAT	4	73446	73456	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	157325554
116	NC_009808	AGA	5	73832	73846	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157325554
117	NC_009808	ATA	4	74244	74255	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	157325554
118	NC_009808	A	14	74555	74568	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	157325554
119	NC_009808	TCT	4	76392	76403	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	157325554
120	NC_009808	TAAA	4	79043	79058	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	157325554
121	NC_009808	AT	7	79674	79686	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	157325554
122	NC_009808	AATTG	3	80295	80308	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	157325554
123	NC_009808	GTTTT	3	80693	80707	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	157325554
124	NC_009808	AT	6	84428	84439	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	157325554
125	NC_009808	TAT	5	84529	84543	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	157325554
126	NC_009808	AATA	3	84673	84684	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	157325554
127	NC_009808	A	12	85103	85114	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	157325554
128	NC_009808	TAGT	3	85216	85226	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	157325554
129	NC_009808	CAAT	3	85521	85531	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	157325554
130	NC_009808	ACTA	3	86329	86339	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	157325554
131	NC_009808	TTAC	3	86964	86974	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	157325554
132	NC_009808	AT	6	88143	88154	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	157325554
133	NC_009808	ATAA	3	88387	88397	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	157325554
134	NC_009808	TAAAA	3	88412	88426	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	157325554
135	NC_009808	TAAAA	7	88527	88561	35	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	157325554
136	NC_009808	ATTC	3	90071	90082	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	157325554
137	NC_009808	AGAA	3	91984	91995	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	157325554
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202	NC_009808	ATTTT	3	161742	161756	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
203	NC_009808	ATTTT	3	161792	161806	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
204	NC_009808	CATAT	3	162008	162022	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast