ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cuscuta reflexa chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009766	ATT	4	5292	5303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009766	GTT	4	5845	5855	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009766	TAA	4	8428	8442	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_009766	GTT	4	9117	9128	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	156618812
5	NC_009766	TAA	4	10612	10624	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_009766	TTA	5	10724	10738	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_009766	ATA	4	12006	12016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_009766	ATT	4	12881	12893	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_009766	TTC	4	19793	19804	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	156618817
10	NC_009766	ATA	4	23766	23778	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_009766	TAA	4	27350	27361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009766	TTG	4	29435	29445	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	156618822
13	NC_009766	TAT	4	30032	30043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009766	GCA	4	35154	35165	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	156618826
15	NC_009766	TTA	4	36813	36825	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_009766	TAA	4	45650	45660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	156618833
17	NC_009766	AAT	4	49009	49019	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	156618837
18	NC_009766	CCG	4	52101	52111	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	156618838
19	NC_009766	TTA	4	53098	53109	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	156618839
20	NC_009766	TGT	4	56052	56062	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_009766	ACT	4	59179	59191	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_009766	AAT	4	61587	61598	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	156618847
23	NC_009766	ATA	5	75847	75860	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	156618847
24	NC_009766	ATA	4	75885	75898	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	156618847
25	NC_009766	TTA	4	89729	89741	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	156618875
26	NC_009766	CTT	4	95941	95951	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	156618875
27	NC_009766	ATT	4	99925	99936	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	156618875
28	NC_009766	GTT	4	103483	103494	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	156618875
29	NC_009766	ATA	4	111248	111260	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	156618875

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cuscuta reflexa chloroplast