ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cuscuta gronovii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009765	TCT	4	497	507	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	171259333
2	NC_009765	AT	6	1313	1323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009765	TACA	3	1450	1460	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009765	TTTA	3	1513	1523	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009765	AAAT	3	1839	1850	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009765	AATT	3	2134	2145	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009765	AATT	3	2893	2904	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_009765	ATTT	3	3501	3511	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	156618895
9	NC_009765	T	14	5168	5181	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	156618896
10	NC_009765	TAAA	3	6118	6128	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009765	AACG	3	6220	6231	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009765	TAA	4	6826	6836	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	156618898
13	NC_009765	T	13	8285	8297	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009765	TCTTTT	3	9069	9086	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
15	NC_009765	TAAA	3	9358	9369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009765	CTTA	3	10427	10437	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009765	GAAA	3	10871	10882	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_009765	GAAA	3	12898	12909	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	171259334
19	NC_009765	TTA	4	12938	12949	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171259334
20	NC_009765	GC	6	13223	13233	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	171259334
21	NC_009765	AG	6	13989	13999	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009765	A	14	14819	14832	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_009765	AATA	3	16307	16317	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	156618906
24	NC_009765	AAAT	3	17056	17066	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	156618906
25	NC_009765	TAT	4	21800	21810	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009765	ATTT	3	22148	22158	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009765	TGCA	3	26387	26399	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	156618912
28	NC_009765	T	14	27508	27521	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009765	GAT	4	28921	28932	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	156618913
30	NC_009765	TAT	4	29316	29327	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	156618913
31	NC_009765	ATTT	3	29621	29631	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_009765	T	13	30629	30641	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009765	ATTT	3	31445	31455	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_009765	GT	6	32727	32738	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_009765	TAA	4	32803	32814	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_009765	AATG	3	33624	33634	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	156618920
37	NC_009765	T	12	33934	33945	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009765	TA	6	34197	34207	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_009765	A	12	34825	34836	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_009765	TAAA	3	35072	35082	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_009765	TAAA	3	35732	35742	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	156618925
42	NC_009765	TAT	4	36350	36360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_009765	ATA	7	36416	36437	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_009765	AATA	6	36426	36449	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_009765	ACA	4	37262	37273	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	156618927
46	NC_009765	TAA	4	37476	37487	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	156618927
47	NC_009765	CAAA	3	37847	37858	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	156618927
48	NC_009765	A	15	38232	38246	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	156618927
49	NC_009765	AATG	3	38434	38445	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	156618927
50	NC_009765	ATTG	3	38517	38528	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	156618927
51	NC_009765	TA	6	38643	38653	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	156618927
52	NC_009765	ATAAA	3	39055	39069	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	156618927
53	NC_009765	GCTGG	3	39392	39405	14	0 %	20 %	60 %	20 %	7 %	156618927
54	NC_009765	TATT	3	39721	39732	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	156618927
55	NC_009765	CTT	4	40682	40692	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	156618927
56	NC_009765	AAAT	3	41033	41045	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	156618927
57	NC_009765	ACTT	3	41093	41103	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	156618927
58	NC_009765	ATT	5	41832	41846	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	156618927
59	NC_009765	AAT	4	42203	42215	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	156618927
60	NC_009765	ATTT	3	43415	43426	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	156618927
61	NC_009765	TAAAA	3	44654	44667	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	156618927
62	NC_009765	TTTG	3	44691	44701	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	156618927
63	NC_009765	TA	6	45030	45040	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	156618927
64	NC_009765	T	18	45793	45810	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	156618927
65	NC_009765	AT	6	46127	46138	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	156618927
66	NC_009765	T	17	46143	46159	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	156618927
67	NC_009765	TTTC	3	46167	46177	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	156618927
68	NC_009765	TA	6	46652	46662	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	156618927
69	NC_009765	AAAG	3	47197	47207	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	156618927
70	NC_009765	TTGA	3	47677	47687	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	156618927
71	NC_009765	GAAGTG	3	49456	49473	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	156618927
72	NC_009765	TTA	4	49710	49722	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	156618927
73	NC_009765	TAG	4	51657	51668	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	156618927
74	NC_009765	AAAT	3	54278	54289	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	156618927
75	NC_009765	T	13	57979	57991	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	156618927
76	NC_009765	TAG	4	60764	60774	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	156618953
77	NC_009765	ACAA	3	61843	61854	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	156618953
78	NC_009765	GAGG	3	62365	62376	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	156618953
79	NC_009765	AGGT	3	62571	62582	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	156618953
80	NC_009765	TAAG	3	63696	63706	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	156618953
81	NC_009765	ATT	4	65538	65549	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	156618953
82	NC_009765	TTA	4	65841	65853	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	156618953
83	NC_009765	ATTT	3	67399	67410	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	156618953
84	NC_009765	TAAA	3	68344	68355	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	156618953
85	NC_009765	AAAT	3	68445	68455	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	156618953
86	NC_009765	T	12	69819	69830	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	156618953
87	NC_009765	TTCT	3	70749	70759	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	156618953
88	NC_009765	CAAA	3	70885	70895	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	156618953
89	NC_009765	ATT	4	71884	71895	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	156618953
90	NC_009765	TCA	4	72042	72052	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	156618953
91	NC_009765	CTTA	3	74012	74022	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	156618953
92	NC_009765	CTA	4	76944	76954	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	156618953
93	NC_009765	AGAT	3	81678	81689	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	156618952
94	NC_009765	A	12	85679	85690	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	156618952
95	NC_009765	ACT	4	86049	86060	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	156618952

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cuscuta gronovii chloroplast