ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phaeosphaeria nodorum SN15 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009746	TA	8	14	29	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_009746	GAAGT	3	342	356	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_009746	AATG	3	1083	1093	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009746	AAGT	3	1186	1197	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009746	ATA	4	1350	1361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009746	TTTA	3	1469	1480	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009746	AATA	3	1863	1875	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_009746	A	13	1895	1907	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_009746	TA	6	2828	2838	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_009746	GTCC	3	3917	3927	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009746	T	14	4210	4223	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_009746	T	14	4282	4295	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_009746	C	27	5255	5281	27	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009746	GTAT	3	6033	6044	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009746	ATT	4	6799	6810	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009746	ATAAA	3	6896	6909	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009746	TAT	4	10428	10438	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009746	TGT	4	10607	10617	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009746	T	12	10649	10660	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009746	C	14	10693	10706	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009746	AT	6	10744	10755	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15649436
22	NC_009746	TAA	4	11006	11017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15649436
23	NC_009746	TTTATT	3	11052	11069	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	15649436
24	NC_009746	TTA	4	11244	11256	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15649436
25	NC_009746	AG	6	12780	12790	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	15649436
26	NC_009746	AT	6	14495	14505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009746	TA	6	14569	14579	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009746	TA	6	15276	15286	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009746	TTAT	3	15423	15434	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_009746	GTATA	3	17289	17302	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	15649436
31	NC_009746	TATT	3	19438	19448	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_009746	A	12	19526	19537	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_009746	TA	8	19902	19916	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_009746	ATAA	3	20313	20325	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_009746	TTAC	3	20659	20669	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	15649437
36	NC_009746	TAT	5	20937	20951	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	15649437
37	NC_009746	A	12	22970	22981	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_009746	AAAATA	3	23307	23323	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	15649437
39	NC_009746	TA	6	23526	23536	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649437
40	NC_009746	TTAA	3	23864	23876	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	15649437
41	NC_009746	AAACA	3	24881	24895	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	15649437
42	NC_009746	CTA	4	25254	25264	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	15649437
43	NC_009746	A	18	25619	25636	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_009746	CTATA	3	27375	27388	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	15649437
45	NC_009746	TTA	4	27475	27486	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15649437
46	NC_009746	A	14	28640	28653	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_009746	AT	7	28723	28736	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_009746	TTAA	3	29557	29569	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_009746	TA	6	29666	29676	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649437
50	NC_009746	TTTA	4	30191	30206	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	15649437
51	NC_009746	GTTT	3	30474	30484	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	15649437
52	NC_009746	TA	6	31044	31054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649437
53	NC_009746	TA	6	31620	31630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649437
54	NC_009746	CTA	4	31872	31882	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	15649437
55	NC_009746	T	14	32315	32328	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_009746	TTTA	3	34789	34799	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15649437
57	NC_009746	TAA	4	34819	34830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15649437
58	NC_009746	TTA	4	35067	35077	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15649437
59	NC_009746	TTG	4	35727	35738	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	15649437
60	NC_009746	AAAT	3	35969	35980	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_009746	TAAA	3	36867	36877	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15649437
62	NC_009746	TAAAA	3	37608	37622	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_009746	AAAC	3	38367	38377	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	15649437
64	NC_009746	AAAT	3	38381	38391	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15649437
65	NC_009746	TAAA	3	38820	38830	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15649438
66	NC_009746	TTTCT	3	39077	39090	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	15649438
67	NC_009746	TAA	4	39234	39244	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15649438
68	NC_009746	TAAA	3	40053	40064	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	15649438
69	NC_009746	ATA	4	40276	40287	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15649438
70	NC_009746	TTA	4	40338	40349	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_009746	GAT	4	40468	40479	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15649438
72	NC_009746	TGAA	3	40606	40616	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	15649438
73	NC_009746	TTAT	3	41276	41286	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15649438
74	NC_009746	ATT	4	42137	42148	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15649438
75	NC_009746	TAT	4	42163	42175	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15649438
76	NC_009746	T	13	42581	42593	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_009746	TAA	4	43208	43219	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_009746	TAAG	3	44024	44034	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_009746	TAA	4	45406	45418	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_009746	ATT	4	45724	45735	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_009746	TA	6	46787	46797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649438
82	NC_009746	AT	6	47063	47073	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15649438
83	NC_009746	TAT	4	47111	47122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15649438
84	NC_009746	TAAA	3	47169	47179	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15649438
85	NC_009746	A	14	49464	49477	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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