ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lucilia sericata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009733	TAA	4	104	114	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009733	TTA	4	233	243	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009733	TAAA	3	242	253	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009733	AATA	4	254	269	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_009733	TAA	4	282	293	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009733	TTAA	3	326	337	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009733	TA	9	398	414	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_009733	TA	6	448	458	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_009733	AT	6	485	496	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_009733	T	24	535	558	24	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
11	NC_009733	TAAT	4	683	698	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_009733	TTA	4	867	879	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_009733	AT	8	907	924	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_009733	AT	19	926	962	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009733	ATA	4	1039	1050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009733	A	12	1047	1058	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009733	A	27	1083	1109	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009733	TTCAT	3	1934	1947	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	154800399
19	NC_009733	ATTTT	3	2033	2046	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	154800399
20	NC_009733	ATT	4	2135	2146	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	154800399
21	NC_009733	TTTCA	3	2290	2303	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	154800399
22	NC_009733	AGG	4	3197	3208	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	154800400
23	NC_009733	ATT	5	4351	4364	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	154800401
24	NC_009733	TAA	4	4812	4822	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	154800401
25	NC_009733	TTTAT	3	6055	6068	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	154800404
26	NC_009733	TTAA	3	6586	6597	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	154800404
27	NC_009733	TA	6	6600	6610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009733	TTAA	3	6896	6906	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	154800405
29	NC_009733	ATTTTA	3	6944	6961	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	154800405
30	NC_009733	CTTT	3	7241	7251	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_009733	ATT	4	7500	7510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	154800406
32	NC_009733	AAT	4	7628	7640	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	154800406
33	NC_009733	TAAA	3	7720	7731	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	154800406
34	NC_009733	AAAG	3	8018	8029	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	154800406
35	NC_009733	AAG	4	8135	8146	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	154800406
36	NC_009733	TTA	4	8306	8317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	154800406
37	NC_009733	ATA	6	8411	8427	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	154800406
38	NC_009733	TGAA	3	8499	8509	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	154800406
39	NC_009733	AAG	4	8555	8566	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	154800406
40	NC_009733	CTAA	3	8594	8606	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	154800406
41	NC_009733	AAAT	3	8650	8660	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	154800406
42	NC_009733	TAA	4	8849	8861	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	154800406
43	NC_009733	GTAAAA	3	9290	9307	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	154800407
44	NC_009733	AAT	4	9412	9423	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	154800407
45	NC_009733	TCTAAT	3	9813	9830	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	154800407
46	NC_009733	AAAT	3	10137	10147	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	154800407
47	NC_009733	AAAAT	3	10226	10239	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	154800407
48	NC_009733	TAA	4	10266	10277	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	154800407
49	NC_009733	TAA	5	10281	10294	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	154800407
50	NC_009733	TAA	5	10479	10493	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	154800407
51	NC_009733	TAAA	5	10712	10730	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	154800408
52	NC_009733	TTTTAT	3	11032	11049	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	154800409
53	NC_009733	TTTA	3	11188	11199	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	154800409
54	NC_009733	ATT	4	11245	11257	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	154800409
55	NC_009733	TAA	4	11277	11288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	154800409
56	NC_009733	TACT	3	11842	11853	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	154800410
57	NC_009733	AGT	4	12500	12511	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	154800410
58	NC_009733	TTAA	3	12621	12631	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	154800410
59	NC_009733	TAAA	3	13198	13209	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	154800411
60	NC_009733	TAA	4	13213	13224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	154800411
61	NC_009733	TAA	4	13635	13647	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	154800411
62	NC_009733	AAT	4	13654	13666	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	154800411
63	NC_009733	TATAT	3	13756	13769	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_009733	TAT	4	14120	14131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_009733	AAT	4	14147	14158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_009733	TAAA	3	14217	14227	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_009733	TTAA	3	14504	14514	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_009733	TAA	4	14545	14557	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_009733	TATT	3	14624	14635	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009733	TTAA	5	14690	14710	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_009733	ATT	4	14979	14990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_009733	ACT	4	15552	15563	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_009733	ATT	4	15846	15858	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_009733	AAAT	3	15860	15871	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lucilia sericata mitochondrion