ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sepia esculenta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009690	AAT	5	480	494	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	153123922
2	NC_009690	TTAT	3	1911	1922	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	153123923
3	NC_009690	ATA	4	1990	2000	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	153123923
4	NC_009690	TATAA	3	2343	2356	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	153123924
5	NC_009690	CTTC	3	2368	2378	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	153123924
6	NC_009690	TTTA	4	3085	3100	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	153123924
7	NC_009690	TCTT	3	3321	3332	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	153123924
8	NC_009690	TATT	3	3452	3462	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	153123924
9	NC_009690	TAT	5	3689	3703	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	153123925
10	NC_009690	TA	6	3712	3722	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153123925
11	NC_009690	AT	6	4331	4341	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009690	TTAA	3	4408	4418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153123926
13	NC_009690	CAA	4	4461	4471	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	153123926
14	NC_009690	TAAT	3	4645	4657	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	153123927
15	NC_009690	AAATA	3	5454	5468	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	153123928
16	NC_009690	TAT	4	7046	7056	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009690	AT	6	7229	7239	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009690	TAA	4	7394	7405	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009690	TTAA	3	7463	7475	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_009690	CTAATA	3	7585	7601	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
21	NC_009690	TAA	4	8277	8288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009690	CTA	4	8302	8313	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009690	TTTATA	3	8360	8376	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_009690	AATATT	3	8510	8528	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_009690	ATA	4	8557	8570	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_009690	TA	6	8695	8705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009690	TA	9	8985	9002	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_009690	TA	7	9273	9285	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_009690	TA	7	9362	9375	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_009690	A	12	9405	9416	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_009690	ATA	4	10142	10154	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153123930
32	NC_009690	ATTT	3	10236	10247	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	153123930
33	NC_009690	TAA	4	10452	10463	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	153123930
34	NC_009690	TCAA	3	10748	10758	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	153123930
35	NC_009690	TAT	4	10993	11004	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153123930
36	NC_009690	GATA	3	11451	11461	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	153123930
37	NC_009690	AAAT	3	11529	11540	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	153123930
38	NC_009690	ACTT	3	11716	11726	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	153123930
39	NC_009690	ATT	6	11768	11785	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	153123930
40	NC_009690	TAAA	3	11799	11811	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	153123930
41	NC_009690	ACA	4	12105	12116	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	153123931
42	NC_009690	TA	7	12130	12142	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	153123931
43	NC_009690	TA	6	12845	12855	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153123931
44	NC_009690	TTA	4	13186	13197	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153123931
45	NC_009690	AAT	4	13334	13345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153123932
46	NC_009690	CAAAA	3	13928	13941	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	153123933
47	NC_009690	AAAT	3	14012	14022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	153123933
48	NC_009690	AAAAC	3	14297	14310	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	153123933
49	NC_009690	A	12	14567	14578	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	153123933
50	NC_009690	ATT	4	14959	14970	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153123934
51	NC_009690	AAAT	5	15052	15070	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	153123934
52	NC_009690	AT	6	15142	15152	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153123934
53	NC_009690	ATAACC	3	15286	15304	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10 %	153123934
54	NC_009690	TA	7	15912	15924	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_009690	TA	7	16001	16014	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_009690	A	13	16044	16056	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sepia esculenta mitochondrion