ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Vampyroteuthis infernalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009689	TA	6	447	457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153124858
2	NC_009689	TTAT	3	1372	1383	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	153124859
3	NC_009689	TAT	4	1572	1583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153124860
4	NC_009689	ATT	4	1979	1989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	153124860
5	NC_009689	TAT	4	1995	2006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153124860
6	NC_009689	ATT	4	2068	2080	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	153124860
7	NC_009689	TAA	4	2250	2261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153124860
8	NC_009689	TTAAT	3	2348	2363	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	153124860
9	NC_009689	ATTTTA	5	4181	4210	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	153124862
10	NC_009689	ATT	5	4304	4317	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	153124862
11	NC_009689	TAA	4	4761	4772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153124862
12	NC_009689	ATAAAT	4	4940	4962	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153124863
13	NC_009689	AAT	4	4960	4971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153124863
14	NC_009689	GATA	3	5002	5012	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	153124864
15	NC_009689	ATT	4	5162	5173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153124864
16	NC_009689	TAAT	3	5241	5251	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153124864
17	NC_009689	ATTT	3	5565	5576	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	153124864
18	NC_009689	ATA	4	5800	5812	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153124865
19	NC_009689	TAAAT	3	5813	5827	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	153124865
20	NC_009689	AATT	3	5948	5959	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	153124865
21	NC_009689	AT	6	6005	6015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153124865
22	NC_009689	ATT	4	6223	6233	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	153124865
23	NC_009689	TAT	4	6375	6386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153124865
24	NC_009689	TAT	4	6633	6644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	153124865
25	NC_009689	AAT	4	6760	6772	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153124865
26	NC_009689	CAA	4	6923	6934	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	153124865
27	NC_009689	ATTT	3	7079	7089	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	153124865
28	NC_009689	ATATA	3	7406	7419	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	153124865
29	NC_009689	AATAT	3	7420	7433	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	153124865
30	NC_009689	ACTAAA	3	7667	7685	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	153124866
31	NC_009689	AAT	8	7694	7716	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	153124866
32	NC_009689	AAT	4	7745	7757	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153124866
33	NC_009689	TA	6	7771	7782	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	153124866
34	NC_009689	ATT	4	7986	7997	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	153124866
35	NC_009689	AT	6	8377	8389	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	153124866
36	NC_009689	TA	7	8486	8498	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	153124866
37	NC_009689	TAA	4	8536	8548	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153124866
38	NC_009689	A	14	8581	8594	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	153124866
39	NC_009689	A	12	8602	8613	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	153124866
40	NC_009689	TATTT	4	8655	8679	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	153124866
41	NC_009689	ATTAA	3	8870	8884	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	153124866
42	NC_009689	AAAT	3	9407	9418	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	153124868
43	NC_009689	AAAT	3	9655	9665	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	153124868
44	NC_009689	TAA	4	9763	9773	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	153124868
45	NC_009689	TAC	4	9901	9911	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	153124868
46	NC_009689	AAAAC	3	9940	9953	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	153124868
47	NC_009689	A	13	10210	10222	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	153124868
48	NC_009689	AAT	4	10560	10570	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	153124869
49	NC_009689	TTA	4	10573	10583	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	153124869
50	NC_009689	A	26	10715	10740	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	153124869
51	NC_009689	AT	6	10793	10804	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	153124869
52	NC_009689	AAAT	3	10858	10868	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	153124869
53	NC_009689	ATA	4	11102	11114	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	153124870
54	NC_009689	TACT	3	11253	11263	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	153124870
55	NC_009689	AAT	4	11716	11726	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	153124870
56	NC_009689	TAA	4	12074	12085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_009689	TAAA	3	12604	12614	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_009689	AT	6	12899	12909	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_009689	TTAA	3	13019	13030	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_009689	CATA	4	13078	13093	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
61	NC_009689	AAAT	3	13225	13236	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009689	AATATA	3	13259	13276	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009689	ATA	7	13707	13727	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_009689	TCTT	3	14096	14107	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_009689	ATTT	3	14601	14612	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_009689	TTAATA	3	14796	14814	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
67	NC_009689	AATT	3	14856	14867	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_009689	AT	7	15153	15165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_009689	TATAT	3	15305	15318	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_009689	ATA	4	15386	15397	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_009689	ATTT	3	15412	15422	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_009689	AT	8	15430	15445	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_009689	TTTA	3	15447	15457	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_009689	A	14	15513	15526	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_009689	TAT	5	15544	15558	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_009689	AAAT	3	15560	15571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009689	AT	7	15596	15609	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Vampyroteuthis infernalis mitochondrion