Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Leptosira terrestris chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009681AAG4218621971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
2NC_009681ATA4332433351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_009681TAT4397739881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_009681ACA4556855791266.67 %0 %0 %33.33 %8 %153805559
5NC_009681TAA4849785081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_009681CTA4901290231233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_009681ATA412626126381366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_009681ATA413340133521366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_009681ATT415120151311233.33 %66.67 %0 %0 %8 %153805563
10NC_009681TAA418354183651266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_009681CTT41994719958120 %66.67 %0 %33.33 %8 %153805564
12NC_009681TAT420488204981133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_009681GAA422681226921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %153805565
14NC_009681GCA422833228441233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %153805565
15NC_009681TTA424891249021233.33 %66.67 %0 %0 %8 %153805566
16NC_009681TAT427865278771333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_009681TTG42949429504110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
18NC_009681AAC434069340801266.67 %0 %0 %33.33 %8 %153805572
19NC_009681AAT435493355041266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_009681TGA436997370081233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %153805573
21NC_009681ATA440627406371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_009681CAA441799418101266.67 %0 %0 %33.33 %8 %153805576
23NC_009681TAA451055510661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_009681TGG45474254753120 %33.33 %66.67 %0 %8 %153805578
25NC_009681GCT45755057561120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %153805578
26NC_009681TAT457843578551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_009681TTA461194612041133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_009681ATT461382613921133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_009681ATT562716627301533.33 %66.67 %0 %0 %6 %153805579
30NC_009681TAA463013630241266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_009681TTA564378643921533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_009681TGT46557065581120 %66.67 %33.33 %0 %8 %153805581
33NC_009681CTT46706567077130 %66.67 %0 %33.33 %7 %153805581
34NC_009681TCT46715567165110 %66.67 %0 %33.33 %9 %153805581
35NC_009681TAA570730707441566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
36NC_009681ATA473834738461366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
37NC_009681AAT475565755751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_009681ATT477528775391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %171259264
39NC_009681ATA480517805291366.67 %33.33 %0 %0 %7 %153805639
40NC_009681ATA482328823401366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_009681TGT48245382463110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
42NC_009681ATA484886848971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_009681ATT486192862031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %153805591
44NC_009681GTG58657586589150 %33.33 %66.67 %0 %6 %153805591
45NC_009681CTG49166091671120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %153805593
46NC_009681TTC49379893808110 %66.67 %0 %33.33 %9 %153805594
47NC_009681ATA493954939641166.67 %33.33 %0 %0 %9 %153805594
48NC_009681ATT496876968871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_009681TAT497123971331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %153805597
50NC_009681ATT498984989941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_009681TCA41041311041421233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %153805599
52NC_009681TAA41064591064711366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
53NC_009681ATA41074901075001166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_009681TAT41074991075091133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_009681AAT41104391104491166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_009681TAG41110381110501333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %153805601
57NC_009681ATA41121571121691366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
58NC_009681TTA41128301128411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %153805602
59NC_009681ATT41159081159181133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_009681ATT51162261162411633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
61NC_009681TAA41175601175721366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
62NC_009681TTA41197811197911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_009681ATA51202221202361566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
64NC_009681TAA41202441202551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_009681TAA41205421205541366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_009681TAT41234981235091233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
67NC_009681ATA41265361265471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_009681TGG4128360128370110 %33.33 %66.67 %0 %9 %153805610
69NC_009681GAA41316831316941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_009681TAA41329041329151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_009681AAG41351341351451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %171259265
72NC_009681CTG4136265136276120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
73NC_009681ATA51375301375441566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
74NC_009681TTA41375421375531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_009681ATA41380561380671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_009681TGT4142672142684130 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
77NC_009681ATT41430901431001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_009681ATG41446931447031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %153805615
79NC_009681TAA81462941463162366.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_009681TAT41467401467501133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_009681TAA41479681479781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
82NC_009681TTA41479871479981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_009681ATT41502371502491333.33 %66.67 %0 %0 %7 %153805619
84NC_009681TGC4156650156661120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
85NC_009681ATA41599361599461166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_009681TAA41601161601261166.67 %33.33 %0 %0 %9 %153805628
87NC_009681ATT41645921646021133.33 %66.67 %0 %0 %9 %153805630
88NC_009681GAT41671341671451233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %153805631
89NC_009681TCT4167554167566130 %66.67 %0 %33.33 %7 %153805631
90NC_009681AAC51750991751131566.67 %0 %0 %33.33 %6 %153805633
91NC_009681TCA41810971811081233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
92NC_009681ACA41926941927041166.67 %0 %0 %33.33 %9 %153805646
93NC_009681ATT41927731927841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %153805646