ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Leptosira terrestris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009681	AT	6	3369	3379	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009681	TA	6	3756	3767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009681	AT	8	6318	6335	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_009681	TA	7	6511	6523	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_009681	TA	6	6532	6543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009681	AT	6	6545	6556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009681	AT	6	8558	8570	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_009681	AT	8	8981	8995	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_009681	AT	7	9637	9649	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_009681	AT	7	10934	10949	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_009681	TA	6	11173	11183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009681	AT	8	11211	11225	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_009681	TA	6	11534	11544	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_009681	TA	23	12511	12554	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009681	AT	7	12610	12624	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_009681	AT	7	13045	13058	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009681	AT	7	13087	13100	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009681	TA	8	14218	14233	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_009681	TA	6	15864	15875	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009681	AT	7	16680	16693	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_009681	TA	6	17079	17090	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_009681	AT	8	17513	17527	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_009681	AT	6	18070	18080	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_009681	TA	6	18234	18244	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009681	AT	11	18870	18893	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009681	AT	6	18895	18908	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009681	TA	9	20595	20611	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_009681	TA	6	20693	20704	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009681	AT	8	20722	20736	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_009681	AT	18	21901	21933	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_009681	AT	6	24223	24234	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_009681	TA	6	24279	24289	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_009681	AT	6	25494	25505	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_009681	AT	6	26734	26744	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_009681	TA	6	26801	26811	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_009681	AT	6	26888	26898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_009681	AT	7	26907	26919	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_009681	TA	7	26959	26971	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_009681	AT	6	27914	27924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_009681	AT	6	27962	27975	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_009681	AT	7	27977	27989	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_009681	AT	7	28413	28426	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_009681	AT	6	29332	29342	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_009681	AT	6	31442	31453	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_009681	AT	6	31557	31568	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_009681	AT	6	31717	31728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_009681	TA	10	31770	31790	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_009681	AC	6	33294	33304	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_009681	TA	6	33417	33429	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_009681	TA	6	34866	34876	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009681	AT	7	35085	35098	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_009681	CT	6	35555	35566	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_009681	AT	8	35565	35581	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_009681	AT	11	35589	35611	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_009681	TA	6	37516	37527	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_009681	TA	6	38594	38604	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_009681	AT	6	40431	40442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_009681	TA	6	40773	40783	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_009681	AT	6	41001	41011	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_009681	AC	6	47913	47923	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	153805576
61	NC_009681	TA	6	48478	48488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153805576
62	NC_009681	AT	8	49954	49969	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_009681	TA	6	50028	50038	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_009681	TA	7	50254	50266	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_009681	AT	6	51445	51456	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_009681	AT	6	51985	51996	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_009681	AT	9	52198	52214	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_009681	AT	8	52224	52240	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_009681	TA	6	52584	52594	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_009681	AT	9	52866	52883	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_009681	AT	11	52913	52935	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_009681	AT	6	57643	57655	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_009681	TA	7	57791	57803	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_009681	AT	9	58275	58291	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_009681	AT	7	58741	58753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_009681	AT	7	60120	60133	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_009681	TA	10	60138	60156	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_009681	TA	6	61234	61245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_009681	AT	8	64070	64085	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_009681	AT	7	64527	64539	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_009681	AT	6	68569	68580	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_009681	AT	11	68586	68607	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_009681	TC	6	69492	69503	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_009681	AT	17	69574	69605	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_009681	AT	7	69711	69723	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_009681	AT	8	69943	69958	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_009681	AT	6	70376	70387	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_009681	TA	12	71032	71055	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_009681	AT	11	71882	71902	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	153805638
90	NC_009681	AT	7	73361	73374	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_009681	AT	6	74335	74345	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_009681	TA	6	74354	74364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_009681	TA	7	75366	75379	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_009681	AT	11	75727	75747	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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96	NC_009681	AT	6	77706	77717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_009681	AT	6	78755	78766	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_009681	AT	6	78826	78839	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009681	AT	7	79159	79172	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_009681	AT	7	79196	79209	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_009681	TA	14	79425	79450	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_009681	AT	7	79660	79675	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_009681	AT	9	80990	81009	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_009681	AT	6	81049	81059	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009681	AT	7	81502	81514	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_009681	AT	6	82699	82709	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_009681	AT	11	82761	82781	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_009681	AT	8	83715	83731	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_009681	AT	6	85023	85034	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_009681	AT	9	85867	85884	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_009681	TA	6	88629	88639	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_009681	TA	6	88898	88908	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_009681	AT	8	88985	89000	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_009681	AG	7	88999	89012	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_009681	TA	6	89663	89673	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_009681	TA	6	89679	89690	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_009681	TA	6	89858	89868	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_009681	AT	9	89985	90001	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_009681	AT	6	94306	94319	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_009681	TA	6	94480	94491	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	153805641
121	NC_009681	AT	7	94856	94870	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_009681	AT	6	94881	94895	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
123	NC_009681	AT	10	95282	95303	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_009681	AT	18	95410	95443	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_009681	TA	6	97006	97018	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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127	NC_009681	TA	7	99335	99347	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_009681	TA	6	99504	99514	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_009681	TA	6	100154	100164	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_009681	TA	6	100194	100205	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_009681	AT	12	100427	100448	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_009681	AT	6	102085	102096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009681	AT	6	102806	102817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_009681	AT	6	103014	103025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_009681	TA	6	103430	103443	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_009681	TA	6	103459	103472	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_009681	TA	7	103520	103533	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_009681	AT	7	105235	105250	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009681	TA	7	105405	105417	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_009681	AT	6	105536	105546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_009681	AT	10	105961	105981	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_009681	AT	12	106224	106246	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_009681	TA	6	107011	107021	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_009681	TA	9	107305	107321	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
145	NC_009681	TA	6	108531	108542	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	153805600
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Leptosira terrestris chloroplast