ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Vanderwaltozyma polyspora mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009638	TAA	8	135	158	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15045640
2	NC_009638	ATA	8	182	205	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15045640
3	NC_009638	AAATT	3	434	448	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	15045640
4	NC_009638	TA	6	468	478	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009638	ATTAAT	3	479	495	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_009638	TA	7	614	626	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_009638	AAT	4	627	637	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_009638	TA	6	642	652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_009638	AT	6	667	677	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_009638	TA	7	683	695	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_009638	ATA	4	703	715	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_009638	ATA	6	719	735	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_009638	ATA	4	743	753	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_009638	AT	7	763	777	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_009638	ATA	7	811	831	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_009638	TA	7	832	844	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009638	TAATA	3	847	860	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009638	TATTAA	4	866	889	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009638	AT	6	915	927	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_009638	AAT	4	980	990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_009638	AT	6	1003	1014	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_009638	TAT	5	1030	1044	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_009638	GGTATT	3	1156	1173	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	15045640
24	NC_009638	TTTA	3	1316	1327	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15045640
25	NC_009638	TAAAT	3	1334	1348	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_009638	AATAT	3	1403	1416	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_009638	ATA	4	1475	1487	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_009638	TA	10	1505	1524	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_009638	AT	7	1534	1546	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_009638	ATAA	3	1554	1565	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_009638	ATA	4	1567	1579	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_009638	TAT	5	1794	1807	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_009638	AAT	5	1808	1821	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_009638	ATT	4	1834	1845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_009638	TAA	4	1960	1972	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_009638	ATTA	3	2072	2083	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009638	ATA	5	2114	2127	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_009638	AT	9	2148	2164	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_009638	TAT	4	2257	2269	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_009638	TA	7	2285	2299	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_009638	AT	7	2308	2321	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_009638	ATATT	6	2367	2395	29	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_009638	AAT	4	2396	2406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_009638	AT	6	2405	2416	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_009638	ATA	4	2438	2450	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_009638	TAA	4	2458	2469	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_009638	AT	6	2497	2507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_009638	ATA	4	2516	2526	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_009638	TAA	4	2529	2539	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_009638	ATA	4	2579	2590	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_009638	TAA	4	2711	2723	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_009638	TTA	5	2782	2796	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_009638	ATA	4	2791	2802	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_009638	AT	7	2811	2824	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_009638	AT	8	2852	2868	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_009638	ATA	4	2876	2888	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_009638	AT	8	2912	2926	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_009638	AT	6	2934	2944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_009638	TTATA	3	2945	2959	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_009638	AT	12	2963	2985	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_009638	TATAA	4	2987	3007	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_009638	TA	7	3019	3034	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_009638	TAA	5	3159	3174	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_009638	ATT	4	3287	3298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15045640
65	NC_009638	ATT	4	3732	3743	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15045640
66	NC_009638	GGA	4	4211	4222	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009638	ATA	5	4229	4244	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_009638	TA	7	4338	4350	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_009638	AAT	8	4351	4373	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_009638	AT	6	4372	4385	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_009638	TA	7	4389	4401	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_009638	TA	6	4417	4427	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_009638	ATA	4	4435	4447	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_009638	TAT	4	4448	4458	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_009638	ATA	5	4492	4505	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_009638	AT	6	4612	4622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_009638	ATA	5	4727	4740	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_009638	ATA	4	4844	4856	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_009638	TAA	4	4933	4944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_009638	TTA	4	4942	4953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_009638	TAAT	6	4945	4969	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_009638	TATAAT	3	5001	5017	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_009638	TA	7	5022	5034	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_009638	TTA	4	5036	5048	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_009638	TA	7	5047	5059	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_009638	TA	7	5087	5100	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_009638	TAAA	4	5208	5223	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_009638	ATAAT	3	5224	5237	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_009638	AT	6	5432	5442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_009638	AGGT	3	5496	5506	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_009638	ATA	4	5663	5674	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_009638	TAT	4	5751	5761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_009638	TA	11	5772	5793	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_009638	CAG	4	5823	5834	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_009638	AT	7	5891	5904	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_009638	TAAT	3	5995	6005	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_009638	TAT	5	6326	6341	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_009638	AT	6	6344	6354	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_009638	AT	7	6428	6443	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_009638	TA	11	6458	6479	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_009638	TA	7	6560	6573	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_009638	TAT	5	6729	6744	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_009638	ATTAT	3	6745	6758	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_009638	AT	10	6765	6785	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009638	TAT	4	6783	6795	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_009638	TAA	4	7056	7067	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_009638	TA	7	7070	7082	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_009638	TAT	4	7085	7095	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_009638	CA	6	7200	7211	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
110	NC_009638	ATTA	3	7254	7265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_009638	TAATA	3	7266	7279	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_009638	TAT	4	7361	7373	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_009638	AT	8	7382	7396	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_009638	TTA	4	7397	7408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_009638	TA	10	7452	7471	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
116	NC_009638	ATA	9	7522	7546	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_009638	ATA	5	7551	7565	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_009638	ATA	6	7586	7602	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_009638	TA	6	7647	7658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_009638	AT	13	7764	7788	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_009638	TA	6	8034	8044	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_009638	TA	6	8613	8623	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_009638	ATT	5	8676	8690	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_009638	AT	6	8720	8730	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_009638	TAAT	4	8731	8745	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_009638	AAAT	3	8780	8791	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_009638	TAA	4	8916	8928	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_009638	TAATAT	3	9477	9494	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_009638	AT	6	9588	9598	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_009638	AT	8	9640	9656	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_009638	TA	12	9667	9689	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_009638	AT	6	9691	9701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_009638	AT	6	9705	9716	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_009638	TTA	4	9754	9764	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_009638	TCA	4	9810	9821	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_009638	AT	9	9876	9892	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_009638	ATA	5	9918	9932	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_009638	ATA	5	9993	10007	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_009638	TAAG	3	10066	10077	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_009638	ATTA	3	10396	10408	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_009638	TAA	4	10448	10459	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_009638	TAAA	5	10472	10490	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
143	NC_009638	TA	7	10678	10692	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_009638	TA	12	10705	10726	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_009638	ATTAT	3	10771	10784	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_009638	AT	6	10868	10878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_009638	TA	6	10886	10896	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_009638	AT	7	10937	10949	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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150	NC_009638	TA	6	11010	11020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_009638	ATT	4	11067	11078	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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155	NC_009638	ATTT	4	11373	11388	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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263	NC_009638	TAATTA	3	19371	19388	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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268	NC_009638	TAAT	3	19722	19736	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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270	NC_009638	TA	6	19896	19907	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
271	NC_009638	TA	8	19990	20005	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
272	NC_009638	ATA	8	20168	20191	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
273	NC_009638	AT	6	20250	20260	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
274	NC_009638	ATA	4	20263	20273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
275	NC_009638	TA	6	20381	20393	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
276	NC_009638	AT	6	20416	20426	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
277	NC_009638	ATA	4	20436	20446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
278	NC_009638	ATA	4	20478	20490	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
279	NC_009638	TA	7	20485	20499	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
280	NC_009638	ATA	4	20503	20513	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
281	NC_009638	TAATA	3	20515	20528	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
282	NC_009638	AT	8	20533	20547	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
283	NC_009638	TAAT	3	20854	20865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
284	NC_009638	ATAA	3	20914	20925	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
285	NC_009638	AT	8	20980	20995	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
286	NC_009638	TA	6	21016	21027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
287	NC_009638	AAAAT	3	21088	21101	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
288	NC_009638	ATA	4	21132	21142	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
289	NC_009638	ATT	4	21143	21155	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
290	NC_009638	AT	8	21168	21182	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
291	NC_009638	ATA	6	21226	21242	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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294	NC_009638	AT	6	21299	21309	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
295	NC_009638	AT	6	21372	21385	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
296	NC_009638	TA	7	21405	21419	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	15045641
297	NC_009638	AAAT	3	21455	21465	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15045641
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299	NC_009638	N	100	21585	21684	100	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Vanderwaltozyma polyspora mitochondrion