ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Chlorokybus atmophyticus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009630CAACC115776315540 %0 %0 %60 %7 %Non-Coding
2NC_009630CATTC7543454683520 %40 %0 %40 %8 %Non-Coding
3NC_009630CAAAG17707271568560 %0 %20 %20 %2 %Non-Coding
4NC_009630TGCAA4898290012040 %20 %20 %20 %5 %15040651
5NC_009630TCCAG7900290363520 %20 %20 %40 %8 %15040651
6NC_009630AGTGC311287113011520 %20 %40 %20 %6 %Non-Coding
7NC_009630CAGTG514264142882520 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
8NC_009630TGCAT415391154142420 %40 %20 %20 %8 %15040649
9NC_009630TGCAT915604156484520 %40 %20 %20 %8 %15040649
10NC_009630CTTTA519872198962520 %60 %0 %20 %4 %Non-Coding
11NC_009630AAAGT423178231972060 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
12NC_009630TTTAC425419254382020 %60 %0 %20 %5 %Non-Coding
13NC_009630TAATC428430284481940 %40 %0 %20 %10 %Non-Coding
14NC_009630ATAAA428608286272080 %20 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_009630TGCAT1130393304475520 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
16NC_009630CACTG331042310561520 %20 %20 %40 %0 %Non-Coding
17NC_009630CTGGG43107731101250 %20 %60 %20 %8 %Non-Coding
18NC_009630GGGGA332324323371420 %0 %80 %0 %7 %Non-Coding
19NC_009630TAAAG432551325702060 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
20NC_009630TATTC432606326252020 %60 %0 %20 %5 %Non-Coding
21NC_009630CAGTG432948329672020 %20 %40 %20 %5 %Non-Coding
22NC_009630ATTTT335667356811520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
23NC_009630ACTTT336665366791520 %60 %0 %20 %6 %15040650
24NC_009630CATTG538724387482520 %40 %20 %20 %8 %Non-Coding
25NC_009630CATTC938739387834520 %40 %0 %40 %8 %Non-Coding
26NC_009630AAGTT440829408482040 %40 %20 %0 %10 %Non-Coding
27NC_009630AATGG1342734427986540 %20 %40 %0 %9 %Non-Coding
28NC_009630TGCAG346553465661420 %20 %40 %20 %7 %Non-Coding
29NC_009630TTTAC447091471102020 %60 %0 %20 %10 %Non-Coding
30NC_009630GATTA347582475961540 %40 %20 %0 %0 %Non-Coding
31NC_009630TTAGT356734567481520 %60 %20 %0 %0 %Non-Coding
32NC_009630TGCAA358269582831540 %20 %20 %20 %6 %Non-Coding
33NC_009630TAATC458821588391940 %40 %0 %20 %10 %Non-Coding
34NC_009630ATAGA960544605874460 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
35NC_009630CTGCA27606556078913520 %20 %20 %40 %8 %Non-Coding
36NC_009630CACTG560658606822520 %20 %20 %40 %4 %Non-Coding
37NC_009630CTGCA560685607092520 %20 %20 %40 %4 %Non-Coding
38NC_009630CTGGG36071060724150 %20 %60 %20 %0 %Non-Coding
39NC_009630AGTAA860915609554160 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
40NC_009630ATGCA461355613742040 %20 %20 %20 %5 %Non-Coding
41NC_009630CAGCG462291623102020 %0 %40 %40 %5 %Non-Coding
42NC_009630ACTAA465697657162060 %20 %0 %20 %5 %Non-Coding
43NC_009630CTTTA367442674561520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
44NC_009630TGCAG2067966680649920 %20 %40 %20 %8 %15040650
45NC_009630GCCCA468079680982020 %0 %20 %60 %10 %15040650
46NC_009630TGCAT368329683431520 %40 %20 %20 %6 %15040648
47NC_009630ACTTT370147701611520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
48NC_009630CATTG572144721682520 %40 %20 %20 %8 %15040646
49NC_009630CAGTG472271722902020 %20 %40 %20 %5 %15040646
50NC_009630TGCAT573603736272520 %40 %20 %20 %8 %Non-Coding
51NC_009630TGCAG35770737724717520 %20 %40 %20 %0 %15040646
52NC_009630CTGCA380662806761520 %20 %20 %40 %0 %Non-Coding
53NC_009630GCACT27839688410213520 %20 %20 %40 %0 %Non-Coding
54NC_009630CTAGG684213842423020 %20 %40 %20 %6 %Non-Coding
55NC_009630CATTG1885386854759020 %40 %20 %20 %6 %Non-Coding
56NC_009630AAGTA685582856113060 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
57NC_009630TTTAG1085683857335120 %60 %20 %0 %5 %Non-Coding
58NC_009630AATGC988118881624540 %20 %20 %20 %8 %Non-Coding
59NC_009630GCATT388378883921520 %40 %20 %20 %0 %Non-Coding
60NC_009630TAGGC990193902374520 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
61NC_009630CTAAG390357903701440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
62NC_009630GCAAT591186912102540 %20 %20 %20 %8 %Non-Coding
63NC_009630GGAAT1691186912658040 %20 %40 %0 %8 %Non-Coding
64NC_009630TGCAT793521935553520 %40 %20 %20 %8 %Non-Coding
65NC_009630TCCAT1593526936007520 %40 %0 %40 %9 %Non-Coding
66NC_009630AAAAT395648956611480 %20 %0 %0 %7 %15040646
67NC_009630ACTAA798000980343560 %20 %0 %20 %8 %Non-Coding
68NC_009630ACTAA398975989891560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
69NC_009630TTTAT31025611025751520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_009630GTGCA41030841031032020 %20 %40 %20 %10 %Non-Coding
71NC_009630CTGCA141034301034997020 %20 %20 %40 %8 %Non-Coding
72NC_009630CAGTC31063301063441520 %20 %20 %40 %6 %Non-Coding
73NC_009630GCACT31075051075191520 %20 %20 %40 %6 %Non-Coding
74NC_009630CTGCA41098641098832020 %20 %20 %40 %10 %15040646
75NC_009630TGCAG41098801098992020 %20 %40 %20 %5 %15040646
76NC_009630TGCAG51122501122742520 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
77NC_009630AGTGC31122881123021520 %20 %40 %20 %0 %Non-Coding
78NC_009630CAGCC151144751145497520 %0 %20 %60 %5 %15040646
79NC_009630GCAAT81166431166824040 %20 %20 %20 %7 %15040646
80NC_009630AGTAG31191601191741540 %20 %40 %0 %6 %Non-Coding
81NC_009630AGTAA41240201240392060 %20 %20 %0 %10 %Non-Coding
82NC_009630TTTAC31241051241191520 %60 %0 %20 %0 %Non-Coding
83NC_009630TGCAG41261421261601920 %20 %40 %20 %5 %Non-Coding
84NC_009630AGTAA141306581307277060 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
85NC_009630TGCAG31322431322571520 %20 %40 %20 %0 %Non-Coding
86NC_009630GTATA41324201324442540 %40 %20 %0 %8 %Non-Coding
87NC_009630TGCAG41326051326242020 %20 %40 %20 %5 %Non-Coding
88NC_009630AGTAG41332181332372040 %20 %40 %0 %5 %Non-Coding
89NC_009630CAGTC31334371334511520 %20 %20 %40 %6 %Non-Coding
90NC_009630ATGCA31346621346751440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
91NC_009630CTGGG3135024135038150 %20 %60 %20 %0 %Non-Coding
92NC_009630GCTGG4136905136929250 %20 %60 %20 %8 %Non-Coding
93NC_009630TGGAA121387091387686040 %20 %40 %0 %3 %Non-Coding
94NC_009630AGTGC51389321389562520 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
95NC_009630CTGCA31406211406351520 %20 %20 %40 %6 %Non-Coding
96NC_009630TTATT31474541474681520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
97NC_009630CCCAG31502361502541920 %0 %20 %60 %5 %Non-Coding
98NC_009630TGCAC31514461514591420 %20 %20 %40 %7 %Non-Coding
99NC_009630TACAG31517961518101540 %20 %20 %20 %0 %Non-Coding
100NC_009630CAGTG41533471533662020 %20 %40 %20 %10 %Non-Coding
101NC_009630CAGTC81533901534294020 %20 %20 %40 %7 %Non-Coding
102NC_009630CCAGT31534341534481520 %20 %20 %40 %6 %Non-Coding
103NC_009630AGTTT31560061560201520 %60 %20 %0 %6 %Non-Coding
104NC_009630AAAGT51588901589142560 %20 %20 %0 %8 %Non-Coding
105NC_009630CAGCC31596551596691520 %0 %20 %60 %0 %Non-Coding
106NC_009630CAGCC31596751596891520 %0 %20 %60 %0 %Non-Coding
107NC_009630CAGCC31596951597091520 %0 %20 %60 %0 %Non-Coding
108NC_009630CAGTG101597051597545020 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
109NC_009630GTGCA31610951611091520 %20 %40 %20 %6 %Non-Coding
110NC_009630ACTGA91621631622074540 %20 %20 %20 %6 %Non-Coding
111NC_009630AGTAA31644111644261660 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
112NC_009630AGTAA41645431645622060 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
113NC_009630CTAAT31698291698421440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
114NC_009630GTGCT4170923170943210 %40 %40 %20 %9 %Non-Coding
115NC_009630CTGGG4171713171732200 %20 %60 %20 %10 %Non-Coding
116NC_009630GGGCT6171743171772300 %20 %60 %20 %6 %Non-Coding
117NC_009630TACAA111759421759955460 %20 %0 %20 %5 %Non-Coding
118NC_009630TTTAC51847911848152520 %60 %0 %20 %4 %Non-Coding
119NC_009630GACTG31848981849121520 %20 %40 %20 %0 %Non-Coding
120NC_009630TTTAT31854881855011420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
121NC_009630GCATT81873001873394020 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
122NC_009630ATTGC81879171879564020 %40 %20 %20 %10 %Non-Coding
123NC_009630CAGCC61886861887153020 %0 %20 %60 %6 %Non-Coding
124NC_009630CAGCC41887211887402020 %0 %20 %60 %10 %Non-Coding
125NC_009630CAGTG61887561887853020 %20 %40 %20 %6 %Non-Coding
126NC_009630CAGTG31887911888051520 %20 %40 %20 %0 %Non-Coding
127NC_009630TTGCT3189320189334150 %60 %20 %20 %6 %Non-Coding
128NC_009630TTTTA31901591901721420 %80 %0 %0 %7 %15040647
129NC_009630ATGCA4019087919107719940 %20 %20 %20 %1 %Non-Coding
130NC_009630CGAGT51918511918752520 %20 %40 %20 %8 %Non-Coding
131NC_009630TGCCC4200959200978200 %20 %20 %60 %0 %Non-Coding