ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chlorokybus atmophyticus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009630	CAACC	11	577	631	55	40 %	0 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
2	NC_009630	TGG	4	1361	1372	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009630	TAAATC	3	4290	4307	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_009630	AGCAGA	7	4329	4370	42	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009630	AGC	9	4353	4379	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_009630	TGCA	4	4402	4417	16	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009630	CTTT	3	4838	4849	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	15040649
8	NC_009630	CATTC	7	5434	5468	35	20 %	40 %	0 %	40 %	8 %	Non-Coding
9	NC_009630	GCAT	3	5521	5532	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009630	CAAAG	17	7072	7156	85	60 %	0 %	20 %	20 %	2 %	Non-Coding
11	NC_009630	CAA	4	7421	7432	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009630	T	18	8441	8458	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_009630	A	15	8723	8737	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_009630	TGCAA	4	8982	9001	20	40 %	20 %	20 %	20 %	5 %	15040651
15	NC_009630	TCCAG	7	9002	9036	35	20 %	20 %	20 %	40 %	8 %	15040651
16	NC_009630	TAAGTT	8	10314	10361	48	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	2 %	15040649
17	NC_009630	TAT	4	10709	10719	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009630	AGTGC	3	11287	11301	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
19	NC_009630	TAAA	3	11436	11446	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009630	AAT	4	11476	11487	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009630	AAAT	3	11504	11514	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009630	TGCA	7	12860	12885	26	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
23	NC_009630	ATC	4	13134	13144	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_009630	AGT	4	13512	13522	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009630	CAGTG	5	14264	14288	25	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009630	GCAT	3	14536	14551	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
27	NC_009630	C	14	14680	14693	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
28	NC_009630	AGATGC	5	14887	14916	30	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	6 %	Non-Coding
29	NC_009630	TGCA	3	15158	15169	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009630	TGCAT	4	15391	15414	24	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	15040649
31	NC_009630	TGCAT	9	15604	15648	45	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	15040649
32	NC_009630	GATA	3	16069	16079	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_009630	TAA	4	16176	16188	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_009630	TAGA	3	16189	16199	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_009630	ATAA	3	16322	16333	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_009630	AG	6	17301	17312	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_009630	ATTCAA	4	17715	17738	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009630	AGAT	3	17927	17937	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	15040649
39	NC_009630	ATAAAA	3	19681	19698	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_009630	CTTTA	5	19872	19896	25	20 %	60 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
41	NC_009630	ATA	4	21436	21446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_009630	AAAGT	4	23178	23197	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_009630	CATG	5	25277	25296	20	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
44	NC_009630	TTTAC	4	25419	25438	20	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
45	NC_009630	TTCC	7	25569	25596	28	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
46	NC_009630	CAG	4	25814	25826	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_009630	GCA	18	25873	25926	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
48	NC_009630	AAAG	3	26467	26478	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	15040649
49	NC_009630	AAG	4	26718	26728	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_009630	GCA	4	28159	28169	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009630	TAATC	4	28430	28448	19	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
52	NC_009630	ATAAA	4	28608	28627	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_009630	ATTT	3	28738	28750	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	15040645
54	NC_009630	AATT	3	28897	28908	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15040645
55	NC_009630	T	13	29312	29324	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_009630	TGCAT	11	30393	30447	55	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
57	NC_009630	CACTG	3	31042	31056	15	20 %	20 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009630	CTGGG	4	31077	31101	25	0 %	20 %	60 %	20 %	8 %	Non-Coding
59	NC_009630	AAGTAG	3	31341	31359	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_009630	TAAG	3	31378	31388	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_009630	A	13	31960	31972	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	15040645
62	NC_009630	GGGGA	3	32324	32337	14	20 %	0 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_009630	TAAAG	4	32551	32570	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_009630	TATTC	4	32606	32625	20	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
65	NC_009630	TGCA	9	32848	32882	35	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
66	NC_009630	CAGTG	4	32948	32967	20	20 %	20 %	40 %	20 %	5 %	Non-Coding
67	NC_009630	AGC	4	33452	33463	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_009630	CTG	4	33496	33506	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_009630	TTTA	3	34261	34272	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15040650
70	NC_009630	ATTT	3	35593	35605	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_009630	ATTTT	3	35667	35681	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_009630	GCT	4	36092	36104	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_009630	ACTTT	3	36665	36679	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	15040650
74	NC_009630	CAT	4	38118	38128	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	15040647
75	NC_009630	ATA	4	38197	38208	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15040647
76	NC_009630	CATTG	5	38724	38748	25	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	Non-Coding
77	NC_009630	CATTC	9	38739	38783	45	20 %	40 %	0 %	40 %	8 %	Non-Coding
78	NC_009630	CGCT	3	39143	39153	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_009630	TTTCAC	3	39504	39520	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
80	NC_009630	ATT	4	39611	39622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_009630	TAAA	3	40181	40192	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_009630	AAGTT	4	40829	40848	20	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
83	NC_009630	TAA	4	40991	41002	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_009630	ATGC	3	41431	41441	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_009630	AATGG	13	42734	42798	65	40 %	20 %	40 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_009630	TAGA	3	43007	43018	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_009630	TGCA	8	45816	45846	31	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
88	NC_009630	TGC	4	46045	46057	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
89	NC_009630	TGCAG	3	46553	46566	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
90	NC_009630	TTTAC	4	47091	47110	20	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
91	NC_009630	GATTA	3	47582	47596	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009630	AATCGA	3	50179	50196	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
93	NC_009630	TAAT	4	50291	50309	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_009630	CTCGAT	3	55371	55388	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
95	NC_009630	GCAT	13	56111	56163	53	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_009630	CTTC	3	56433	56444	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_009630	TTAGT	3	56734	56748	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009630	AAGA	3	57446	57456	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	15040648
99	NC_009630	TGCAA	3	58269	58283	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
100	NC_009630	TGCA	8	58304	58333	30	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
101	NC_009630	GCA	4	58742	58754	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
102	NC_009630	CAG	4	58776	58787	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_009630	TAATC	4	58821	58839	19	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
104	NC_009630	ATA	4	59538	59548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009630	CAG	4	60133	60144	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_009630	ATAGA	9	60544	60587	44	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_009630	CTGCA	27	60655	60789	135	20 %	20 %	20 %	40 %	8 %	Non-Coding
108	NC_009630	CACTG	5	60658	60682	25	20 %	20 %	20 %	40 %	4 %	Non-Coding
109	NC_009630	CTGCA	5	60685	60709	25	20 %	20 %	20 %	40 %	4 %	Non-Coding
110	NC_009630	CTGGG	3	60710	60724	15	0 %	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009630	ATTA	3	60849	60860	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_009630	AGTAA	8	60915	60955	41	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_009630	ATGCA	4	61355	61374	20	40 %	20 %	20 %	20 %	5 %	Non-Coding
114	NC_009630	ATTT	3	61736	61747	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009630	CAGCG	4	62291	62310	20	20 %	0 %	40 %	40 %	5 %	Non-Coding
116	NC_009630	ACCCAA	13	62922	62999	78	50 %	0 %	0 %	50 %	1 %	Non-Coding
117	NC_009630	ATAG	3	63000	63011	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_009630	ACTAA	4	65697	65716	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
119	NC_009630	TGC	4	66786	66796	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_009630	GAG	4	67152	67163	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	15040648
121	NC_009630	CTTTA	3	67442	67456	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
122	NC_009630	TGCAG	20	67966	68064	99	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	15040650
123	NC_009630	GCCCA	4	68079	68098	20	20 %	0 %	20 %	60 %	10 %	15040650
124	NC_009630	CT	7	68128	68140	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	15040650
125	NC_009630	CTAAAA	3	68173	68190	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	0 %	15040650
126	NC_009630	AGTT	3	68260	68271	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	15040650
127	NC_009630	TGCAT	3	68329	68343	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	15040648
128	NC_009630	A	16	68358	68373	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	15040648
129	NC_009630	A	12	68590	68601	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	15040648
130	NC_009630	TCGGTC	4	68901	68924	24	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	4 %	15040648
131	NC_009630	GGAA	3	69067	69078	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	15040648
132	NC_009630	ACTTT	3	70147	70161	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
133	NC_009630	CTG	4	70275	70285	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_009630	TGCA	6	70324	70347	24	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
135	NC_009630	AATT	5	70695	70713	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
136	NC_009630	AGAA	3	71546	71556	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	15040646
137	NC_009630	CATTG	5	72144	72168	25	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	15040646
138	NC_009630	CAGTG	4	72271	72290	20	20 %	20 %	40 %	20 %	5 %	15040646
139	NC_009630	TTTCTT	3	73445	73463	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	15040646
140	NC_009630	ATT	4	73496	73507	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15040646
141	NC_009630	TGCAT	5	73603	73627	25	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	Non-Coding
142	NC_009630	CATC	3	74475	74485	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
143	NC_009630	TTA	4	74775	74786	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_009630	ATGC	8	74918	74948	31	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
145	NC_009630	TTTA	3	75647	75658	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15040651
146	NC_009630	TGCA	3	75878	75889	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	15040651
147	NC_009630	TTCT	3	76547	76559	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	15040646
148	NC_009630	ATT	4	76720	76731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15040646
149	NC_009630	ACCT	3	76858	76869	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	15040646
150	NC_009630	TGCAG	35	77073	77247	175	20 %	20 %	40 %	20 %	0 %	15040646
151	NC_009630	TGC	4	79961	79972	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
152	NC_009630	TGCA	4	79990	80004	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
153	NC_009630	TGCA	4	80138	80153	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
154	NC_009630	CTGCA	3	80662	80676	15	20 %	20 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009630	TAC	4	83783	83794	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
156	NC_009630	GCACT	27	83968	84102	135	20 %	20 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009630	CTAGG	6	84213	84242	30	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
158	NC_009630	TTTATT	3	84500	84518	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	15040650
159	NC_009630	GAA	4	84627	84638	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	15040650
160	NC_009630	TTTGTC	3	84663	84680	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	15040650
161	NC_009630	T	12	85017	85028	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	15040650
162	NC_009630	CTG	4	85362	85373	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
163	NC_009630	CATTG	18	85386	85475	90	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
164	NC_009630	AAGTA	6	85582	85611	30	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
165	NC_009630	TTTAG	10	85683	85733	51	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
166	NC_009630	TATT	3	87063	87074	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
167	NC_009630	AATGC	9	88118	88162	45	40 %	20 %	20 %	20 %	8 %	Non-Coding
168	NC_009630	GCATT	3	88378	88392	15	20 %	40 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009630	TGCA	6	88532	88554	23	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
170	NC_009630	TAGGC	9	90193	90237	45	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
171	NC_009630	CTAAG	3	90357	90370	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
172	NC_009630	GCAAT	5	91186	91210	25	40 %	20 %	20 %	20 %	8 %	Non-Coding
173	NC_009630	GGAAT	16	91186	91265	80	40 %	20 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
174	NC_009630	TCAA	3	91291	91301	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
175	NC_009630	ATCT	3	91815	91825	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
176	NC_009630	TGCAT	7	93521	93555	35	20 %	40 %	20 %	20 %	8 %	Non-Coding
177	NC_009630	TCCAT	15	93526	93600	75	20 %	40 %	0 %	40 %	9 %	Non-Coding
178	NC_009630	GCA	5	94082	94095	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
179	NC_009630	AAAAT	3	95648	95661	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	15040646
180	NC_009630	CAAA	3	95680	95690	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	15040646
181	NC_009630	AG	6	96364	96374	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
182	NC_009630	CAG	4	96556	96567	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
183	NC_009630	ATCT	3	97352	97364	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
184	NC_009630	ACTAA	7	98000	98034	35	60 %	20 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
185	NC_009630	ACTAA	3	98975	98989	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009630	ATTT	3	102536	102547	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15040645
187	NC_009630	TTTAT	3	102561	102575	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
188	NC_009630	GTGCA	4	103084	103103	20	20 %	20 %	40 %	20 %	10 %	Non-Coding
189	NC_009630	AGC	4	103131	103142	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
190	NC_009630	CTGCA	14	103430	103499	70	20 %	20 %	20 %	40 %	8 %	Non-Coding
191	NC_009630	TTAGAA	8	105134	105182	49	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
192	NC_009630	TGC	4	105902	105912	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
193	NC_009630	CAGTC	3	106330	106344	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
194	NC_009630	GCAT	3	107333	107344	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
195	NC_009630	GAG	4	107427	107437	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
196	NC_009630	GCACT	3	107505	107519	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
197	NC_009630	ATTT	3	107864	107874	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15040646
198	NC_009630	GATT	3	107979	107989	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	15040646
199	NC_009630	CTGCA	4	109864	109883	20	20 %	20 %	20 %	40 %	10 %	15040646
200	NC_009630	TGCAG	4	109880	109899	20	20 %	20 %	40 %	20 %	5 %	15040646
201	NC_009630	TGCA	16	111983	112045	63	25 %	25 %	25 %	25 %	1 %	Non-Coding
202	NC_009630	TGCAG	5	112250	112274	25	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
203	NC_009630	AGTGC	3	112288	112302	15	20 %	20 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
204	NC_009630	TATG	3	112899	112910	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	15040646
205	NC_009630	GAC	4	113723	113734	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	15040646
206	NC_009630	CAGCC	15	114475	114549	75	20 %	0 %	20 %	60 %	5 %	15040646
207	NC_009630	CAG	4	115516	115527	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	15040646
208	NC_009630	ATT	4	115950	115962	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15040646
209	NC_009630	ATGC	4	116129	116144	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	15040646
210	NC_009630	GCAAT	8	116643	116682	40	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	15040646
211	NC_009630	TGG	4	117028	117038	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	15040646
212	NC_009630	CCTG	3	118147	118157	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
213	NC_009630	AAAC	3	118644	118654	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
214	NC_009630	AACT	3	118702	118712	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
215	NC_009630	AGTAG	3	119160	119174	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
216	NC_009630	ATA	4	120566	120577	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
217	NC_009630	CAAA	3	120607	120617	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	15040648
218	NC_009630	TGC	4	122948	122960	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
219	NC_009630	AGTAA	4	124020	124039	20	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
220	NC_009630	TTTAC	3	124105	124119	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
221	NC_009630	TGCAG	4	126142	126160	19	20 %	20 %	40 %	20 %	5 %	Non-Coding
222	NC_009630	GCA	4	126287	126298	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
223	NC_009630	AGC	4	126493	126503	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
224	NC_009630	AAAG	3	128281	128292	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
225	NC_009630	AAAG	3	128743	128753	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	15040647
226	NC_009630	AGTAA	14	130658	130727	70	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
227	NC_009630	ACCT	3	131113	131124	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
228	NC_009630	TGC	4	131328	131339	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
229	NC_009630	AATA	3	131511	131522	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
230	NC_009630	TCTA	3	131982	131993	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
231	NC_009630	CAG	4	132024	132034	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
232	NC_009630	TGCAG	3	132243	132257	15	20 %	20 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_009630	GTATA	4	132420	132444	25	40 %	40 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
234	NC_009630	TGCAG	4	132605	132624	20	20 %	20 %	40 %	20 %	5 %	Non-Coding
235	NC_009630	TAA	4	132755	132766	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15040648
236	NC_009630	AGTAG	4	133218	133237	20	40 %	20 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
237	NC_009630	CAGTC	3	133437	133451	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
238	NC_009630	TGCA	3	134104	134115	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
239	NC_009630	ATGCA	3	134662	134675	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
240	NC_009630	GCA	5	134926	134939	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
241	NC_009630	CTGGG	3	135024	135038	15	0 %	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
242	NC_009630	GCA	5	136516	136530	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
243	NC_009630	GCTGG	4	136905	136929	25	0 %	20 %	60 %	20 %	8 %	Non-Coding
244	NC_009630	AGC	5	137792	137805	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
245	NC_009630	CATG	3	138417	138432	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
246	NC_009630	TGGAA	12	138709	138768	60	40 %	20 %	40 %	0 %	3 %	Non-Coding
247	NC_009630	AGTGC	5	138932	138956	25	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
248	NC_009630	ATCT	3	139067	139079	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	15040647
249	NC_009630	TAAT	3	140334	140345	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
250	NC_009630	CTGCA	3	140621	140635	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
251	NC_009630	TTG	4	141083	141094	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
252	NC_009630	TGCA	4	141207	141221	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
253	NC_009630	TTA	4	143060	143071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
254	NC_009630	TTAG	3	143235	143246	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
255	NC_009630	CAATGT	13	143936	144013	78	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	2 %	Non-Coding
256	NC_009630	G	14	144017	144030	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
257	NC_009630	TGCA	3	144646	144657	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
258	NC_009630	TTTC	3	144929	144939	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
259	NC_009630	TTATAT	3	144971	144988	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009630	TGC	4	145190	145201	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
261	NC_009630	TAT	4	147256	147267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15040647
262	NC_009630	TTATT	3	147454	147468	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
263	NC_009630	ATCTAC	3	148122	148139	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
264	NC_009630	CCCAG	3	150236	150254	19	20 %	0 %	20 %	60 %	5 %	Non-Coding
265	NC_009630	CAG	4	150248	150260	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
266	NC_009630	TTTC	3	150410	150421	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	15040646
267	NC_009630	GCA	4	151332	151342	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
268	NC_009630	TGCAC	3	151446	151459	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
269	NC_009630	TACAG	3	151796	151810	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009630	AT	6	152634	152644	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15040648
271	NC_009630	ATGC	9	153130	153165	36	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
272	NC_009630	CAGTG	4	153347	153366	20	20 %	20 %	40 %	20 %	10 %	Non-Coding
273	NC_009630	CAGTC	8	153390	153429	40	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
274	NC_009630	CCAGT	3	153434	153448	15	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
275	NC_009630	AAG	4	154054	154064	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
276	NC_009630	ACCT	3	154577	154588	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
277	NC_009630	AGTTT	3	156006	156020	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
278	NC_009630	AGC	5	156410	156424	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
279	NC_009630	AGC	4	156428	156439	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
280	NC_009630	AGC	4	156464	156475	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
281	NC_009630	GCA	4	156569	156580	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
282	NC_009630	ATA	6	158322	158340	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
283	NC_009630	ATTT	3	158381	158391	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
284	NC_009630	ATGC	4	158586	158601	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
285	NC_009630	AAAGT	5	158890	158914	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
286	NC_009630	TGC	4	159341	159351	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
287	NC_009630	CAGCC	3	159655	159669	15	20 %	0 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009630	CAGCC	3	159675	159689	15	20 %	0 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009630	CAGCC	3	159695	159709	15	20 %	0 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009630	CAGTG	10	159705	159754	50	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
291	NC_009630	AGC	4	160344	160354	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
292	NC_009630	GTGCA	3	161095	161109	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
293	NC_009630	ATA	4	161851	161862	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
294	NC_009630	GCT	4	162121	162132	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
295	NC_009630	ACTGA	9	162163	162207	45	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
296	NC_009630	T	14	164306	164319	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	15040648
297	NC_009630	ATA	4	164352	164363	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
298	NC_009630	AGTAA	3	164411	164426	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
299	NC_009630	AGTAA	4	164543	164562	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
300	NC_009630	TTAC	3	166384	166394	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
301	NC_009630	AAAC	3	166430	166441	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
302	NC_009630	CTTATG	3	166867	166884	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	15040651
303	NC_009630	TTAT	3	167113	167124	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15040647
304	NC_009630	TTA	4	168713	168723	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15040647
305	NC_009630	ATT	4	168749	168761	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15040647
306	NC_009630	GCA	5	169720	169734	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
307	NC_009630	CTAAT	3	169829	169842	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
308	NC_009630	GCAT	4	170145	170160	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
309	NC_009630	AAAC	3	170473	170483	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
310	NC_009630	CTG	4	170726	170737	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
311	NC_009630	GTGCT	4	170923	170943	21	0 %	40 %	40 %	20 %	9 %	Non-Coding
312	NC_009630	CTGGG	4	171713	171732	20	0 %	20 %	60 %	20 %	10 %	Non-Coding
313	NC_009630	GGGCT	6	171743	171772	30	0 %	20 %	60 %	20 %	6 %	Non-Coding
314	NC_009630	TGCA	5	172394	172414	21	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
315	NC_009630	AGA	4	173385	173396	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	15040647
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317	NC_009630	TACA	3	174922	174932	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
318	NC_009630	AGCC	3	175503	175514	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
319	NC_009630	TGCA	3	175663	175674	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
320	NC_009630	TACAA	11	175942	175995	54	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
321	NC_009630	TGC	4	176641	176652	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
322	NC_009630	AT	6	177378	177388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
323	NC_009630	TGCA	5	177987	178006	20	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
324	NC_009630	GCAT	3	178297	178312	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
325	NC_009630	TGCA	3	178505	178516	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
326	NC_009630	TAC	4	180195	180206	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
327	NC_009630	CCT	4	180544	180556	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
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329	NC_009630	CGAT	3	180884	180895	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
330	NC_009630	TGCA	3	182689	182700	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
331	NC_009630	ATGC	12	182925	182971	47	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
332	NC_009630	AAAT	3	183063	183074	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
333	NC_009630	AAAT	3	183457	183469	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
334	NC_009630	TGAAAT	3	184003	184021	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	15040650
335	NC_009630	ATAC	3	184601	184612	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
336	NC_009630	ATTT	4	184748	184763	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
337	NC_009630	TTTAC	5	184791	184815	25	20 %	60 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
338	NC_009630	GACTG	3	184898	184912	15	20 %	20 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
339	NC_009630	TTTAT	3	185488	185501	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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341	NC_009630	GCTT	3	187078	187088	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
342	NC_009630	GCATT	8	187300	187339	40	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
343	NC_009630	ATTGC	8	187917	187956	40	20 %	40 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
344	NC_009630	GCA	4	188489	188500	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
345	NC_009630	TGCA	3	188530	188541	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
346	NC_009630	CAGCC	6	188686	188715	30	20 %	0 %	20 %	60 %	6 %	Non-Coding
347	NC_009630	CAGCC	4	188721	188740	20	20 %	0 %	20 %	60 %	10 %	Non-Coding
348	NC_009630	CAGTG	6	188756	188785	30	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
349	NC_009630	CAGTG	3	188791	188805	15	20 %	20 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
350	NC_009630	TTGCT	3	189320	189334	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
351	NC_009630	TTTTA	3	190159	190172	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	15040647
352	NC_009630	ATGCA	40	190879	191077	199	40 %	20 %	20 %	20 %	1 %	Non-Coding
353	NC_009630	TGC	4	191115	191126	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
354	NC_009630	CATC	3	191460	191471	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
355	NC_009630	CGAGT	5	191851	191875	25	20 %	20 %	40 %	20 %	8 %	Non-Coding
356	NC_009630	TCGG	3	195134	195145	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	15040646
357	NC_009630	ATC	4	196953	196964	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15040646
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360	NC_009630	TAAA	3	200416	200426	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15040646
361	NC_009630	TCT	4	200717	200728	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15040646
362	NC_009630	TGCCC	4	200959	200978	20	0 %	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
363	NC_009630	GCAT	6	201287	201310	24	25 %	25 %	25 %	25 %	4 %	Non-Coding
364	NC_009630	TTTA	3	201508	201518	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chlorokybus atmophyticus mitochondrion