ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Cycas taitungensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009618	A	14	1730	1743	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009618	CATT	3	2978	2989	12	25 %	50 %	0 %	25 %	150251437
3	NC_009618	C	12	5105	5116	12	0 %	0 %	0 %	100 %	150251438
4	NC_009618	TCTA	3	5206	5217	12	25 %	50 %	0 %	25 %	150251438
5	NC_009618	ATAG	3	5219	5230	12	50 %	25 %	25 %	0 %	150251438
6	NC_009618	A	16	5267	5282	16	100 %	0 %	0 %	0 %	150251438
7	NC_009618	T	15	5376	5390	15	0 %	100 %	0 %	0 %	150251438
8	NC_009618	T	14	5828	5841	14	0 %	100 %	0 %	0 %	150251438
9	NC_009618	A	32	8162	8193	32	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009618	T	20	10000	10019	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009618	A	15	11592	11606	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009618	T	12	14093	14104	12	0 %	100 %	0 %	0 %	150251444
13	NC_009618	T	21	15364	15384	21	0 %	100 %	0 %	0 %	150251446
14	NC_009618	TA	6	15549	15560	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009618	AT	6	15687	15698	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009618	C	14	17560	17573	14	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_009618	TA	13	29723	29748	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009618	A	14	33584	33597	14	100 %	0 %	0 %	0 %	150251456
19	NC_009618	A	27	34002	34028	27	100 %	0 %	0 %	0 %	150251457
20	NC_009618	ATAG	3	38031	38042	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009618	T	16	49136	49151	16	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009618	C	16	49203	49218	16	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_009618	T	12	58704	58715	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009618	GA	6	69429	69440	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009618	T	13	69657	69669	13	0 %	100 %	0 %	0 %	150251488
26	NC_009618	T	12	69733	69744	12	0 %	100 %	0 %	0 %	150251488
27	NC_009618	A	16	69792	69807	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009618	TTCT	3	70873	70884	12	0 %	75 %	0 %	25 %	150251491
29	NC_009618	T	16	71020	71035	16	0 %	100 %	0 %	0 %	150251492
30	NC_009618	T	18	71732	71749	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009618	A	27	74203	74229	27	100 %	0 %	0 %	0 %	150251522
32	NC_009618	T	14	75200	75213	14	0 %	100 %	0 %	0 %	150251522
33	NC_009618	TTCC	3	84230	84241	12	0 %	50 %	0 %	50 %	150251522
34	NC_009618	T	19	85646	85664	19	0 %	100 %	0 %	0 %	150251522
35	NC_009618	T	19	85955	85973	19	0 %	100 %	0 %	0 %	150251522
36	NC_009618	C	19	87881	87899	19	0 %	0 %	0 %	100 %	150251522
37	NC_009618	T	12	87901	87912	12	0 %	100 %	0 %	0 %	150251522
38	NC_009618	T	12	89913	89924	12	0 %	100 %	0 %	0 %	150251522
39	NC_009618	T	16	104042	104057	16	0 %	100 %	0 %	0 %	150251557
40	NC_009618	AGGT	3	111279	111290	12	25 %	25 %	50 %	0 %	150251557
41	NC_009618	ATAG	3	114865	114876	12	50 %	25 %	25 %	0 %	150251557
42	NC_009618	TATC	3	114878	114889	12	25 %	50 %	0 %	25 %	150251557
43	NC_009618	T	16	117320	117335	16	0 %	100 %	0 %	0 %	150251557
44	NC_009618	T	12	117337	117348	12	0 %	100 %	0 %	0 %	150251557
45	NC_009618	TAGA	3	118365	118376	12	50 %	25 %	25 %	0 %	150251557
46	NC_009618	T	14	119558	119571	14	0 %	100 %	0 %	0 %	150251557
47	NC_009618	ATA	4	123685	123696	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150251557
48	NC_009618	A	21	125086	125106	21	100 %	0 %	0 %	0 %	150251557
49	NC_009618	ATAG	3	129806	129817	12	50 %	25 %	25 %	0 %	150251557
50	NC_009618	T	16	135490	135505	16	0 %	100 %	0 %	0 %	150251557
51	NC_009618	ATAG	3	138370	138381	12	50 %	25 %	25 %	0 %	150251557
52	NC_009618	TATC	3	138383	138394	12	25 %	50 %	0 %	25 %	150251557
53	NC_009618	CTAC	3	141970	141981	12	25 %	25 %	0 %	50 %	150251557
54	NC_009618	A	16	149205	149220	16	100 %	0 %	0 %	0 %	150251557

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Cycas taitungensis chloroplast