ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Illicium oligandrum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009600	CAG	4	1525	1536	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	149390422
2	NC_009600	ATA	4	5225	5236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009600	AAT	4	7703	7714	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009600	GAA	5	9528	9542	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	149390426
5	NC_009600	GAA	4	11532	11542	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_009600	GAT	4	17699	17711	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	149390431
7	NC_009600	TGT	4	18554	18564	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	149390432
8	NC_009600	ATG	4	20819	20829	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	149390432
9	NC_009600	CAA	4	30690	30700	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_009600	ATG	4	34854	34866	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_009600	GCT	4	36504	36514	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	149390437
12	NC_009600	ATG	4	41717	41727	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	149390441
13	NC_009600	CTA	4	43280	43291	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	149390442
14	NC_009600	ACC	5	43293	43306	14	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	149390442
15	NC_009600	ATG	4	43941	43951	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	149390442
16	NC_009600	TTA	4	45218	45229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009600	TAT	4	46731	46742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	149390443
18	NC_009600	AGT	4	48893	48904	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390444
19	NC_009600	TAT	7	49696	49716	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009600	CTT	4	67572	67584	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_009600	TAT	4	69349	69359	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009600	TCT	4	71522	71533	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009600	AAG	4	74159	74170	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390502
24	NC_009600	ATT	4	76181	76192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	149390502
25	NC_009600	ATT	4	81678	81688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	149390502
26	NC_009600	ATT	5	84467	84480	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	149390502
27	NC_009600	ATT	4	86133	86143	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	149390502
28	NC_009600	CTT	4	88236	88247	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	149390502
29	NC_009600	GAT	4	93037	93048	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390502
30	NC_009600	TGA	4	94818	94829	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390502
31	NC_009600	TAC	4	101841	101852	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	149390502
32	NC_009600	AAG	4	114570	114581	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390502
33	NC_009600	TAC	4	118243	118253	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	149390502
34	NC_009600	TAT	4	118408	118418	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	149390502
35	NC_009600	CAA	4	121319	121329	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	149390502
36	NC_009600	ATT	4	130211	130222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	149390502
37	NC_009600	GTA	4	144759	144770	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390502

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Illicium oligandrum chloroplast