Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Illicium oligandrum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009600AT63653771350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
2NC_009600CAAT33783891250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_009600CAG4152515361233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %149390422
4NC_009600AAGT3163116411150 %25 %25 %0 %9 %149390422
5NC_009600AG6239824091250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
6NC_009600GATC3442544351125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
7NC_009600AGAT3514151521250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
8NC_009600ATA4522552361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_009600A135348536013100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_009600TCTCT358335846140 %60 %0 %40 %7 %149390424
11NC_009600C1459085921140 %0 %0 %100 %0 %149390424
12NC_009600A196062608019100 %0 %0 %0 %5 %149390424
13NC_009600ACTC3609161011125 %25 %0 %50 %9 %149390424
14NC_009600CTTT364756486120 %75 %0 %25 %8 %149390424
15NC_009600T1668686883160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_009600AACTA3708570991560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
17NC_009600ATAG3745674671250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
18NC_009600AAT4770377141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_009600TGTTT377417755150 %80 %20 %0 %6 %Non-Coding
20NC_009600T1383328344130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_009600AGGG3876087701125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
22NC_009600A139085909713100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_009600GAA5952895421566.67 %0 %33.33 %0 %6 %149390426
24NC_009600A169541955616100 %0 %0 %0 %6 %149390426
25NC_009600AG6959196011150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
26NC_009600GA6960496151250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
27NC_009600TATT3975397641225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_009600A13101241013613100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_009600A12102701028112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_009600T161122611241160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
31NC_009600T121149311504120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_009600GAA411532115421166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
33NC_009600T131402014032130 %100 %0 %0 %7 %149390428
34NC_009600ATAA414518145331675 %25 %0 %0 %6 %149390428
35NC_009600A12145281453912100 %0 %0 %0 %0 %149390428
36NC_009600ATTT314832148421125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_009600T141493714950140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
38NC_009600GAAA315080150911275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
39NC_009600CAAG315193152031150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
40NC_009600TTTC31561015621120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
41NC_009600AATA315805158171375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
42NC_009600GAT417699177111333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %149390431
43NC_009600A13182271823913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
44NC_009600AATC318413184241250 %25 %0 %25 %8 %149390432
45NC_009600TGT41855418564110 %66.67 %33.33 %0 %9 %149390432
46NC_009600T132041720429130 %100 %0 %0 %7 %149390432
47NC_009600ATG420819208291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149390432
48NC_009600ATTCC324105241181420 %40 %0 %40 %7 %149390433
49NC_009600GAAT324605246151150 %25 %25 %0 %9 %149390433
50NC_009600GAAA328112281241375 %0 %25 %0 %7 %149390434
51NC_009600TA629383293961450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
52NC_009600TAAA329934299461375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
53NC_009600CAA430690307001166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_009600CTAT331974319861325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
55NC_009600CATTT432022320412020 %60 %0 %20 %10 %Non-Coding
56NC_009600AACT332088320981150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
57NC_009600AATAAC332353323701866.67 %16.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
58NC_009600T153358833602150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
59NC_009600TGTA334550345611225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
60NC_009600TA734569345821450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_009600ATG434854348661333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
62NC_009600T143528335296140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
63NC_009600TTTATA335323353411933.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
64NC_009600TA735345353581450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
65NC_009600GCT43650436514110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %149390437
66NC_009600GAAA337344373551275 %0 %25 %0 %8 %149390438
67NC_009600ATTA338508385191250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_009600AG638547385571150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
69NC_009600TA638754387651250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
70NC_009600TC63914239152110 %50 %0 %50 %9 %149390439
71NC_009600AT939360393761750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
72NC_009600ATG441717417271133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149390441
73NC_009600AATG343210432211250 %25 %25 %0 %8 %149390442
74NC_009600CTA443280432911233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %149390442
75NC_009600ACC543293433061433.33 %0 %0 %66.67 %7 %149390442
76NC_009600ATG443941439511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149390442
77NC_009600TTCCT34491844931140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
78NC_009600TTA445218452291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_009600TCTT44632746342160 %75 %0 %25 %6 %149390443
80NC_009600TAT446731467421233.33 %66.67 %0 %0 %0 %149390443
81NC_009600CTTT34725947269110 %75 %0 %25 %9 %149390443
82NC_009600A18473114732818100 %0 %0 %0 %5 %149390443
83NC_009600A13475704758213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
84NC_009600TTTA348424484351225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_009600AGT448893489041233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149390444
86NC_009600TA649317493271150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
87NC_009600TAT749696497162133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_009600ATTAT349770497851640 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
89NC_009600A15499494996315100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
90NC_009600ATGA350175501871350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
91NC_009600TTGA350283502951325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
92NC_009600TAGA351264512751250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
93NC_009600TGCA351601516111125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
94NC_009600T145379953812140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
95NC_009600TCAG354309543191125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
96NC_009600ACCC354590546011225 %0 %0 %75 %8 %Non-Coding
97NC_009600T125498054991120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
98NC_009600TATCAA455321553442450 %33.33 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
99NC_009600CTTT35589355903110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
100NC_009600T155591655930150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
101NC_009600ATCCA358113581271540 %20 %0 %40 %6 %Non-Coding
102NC_009600T155831358327150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
103NC_009600AAAAT358482584951480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
104NC_009600GTTA360678606881125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
105NC_009600T136240662418130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_009600AATG365534655451250 %25 %25 %0 %0 %149390454
107NC_009600A13669146692613100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
108NC_009600A13673426735413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
109NC_009600T176746367479170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
110NC_009600CTT46757267584130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
111NC_009600T176825468270170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
112NC_009600T136929869310130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
113NC_009600CTTT36932869338110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
114NC_009600TAT469349693591133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
115NC_009600TTGAA369941699551540 %40 %20 %0 %6 %149390460
116NC_009600TCT47152271533120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
117NC_009600A13721897220113100 %0 %0 %0 %7 %149390464
118NC_009600A19722937231119100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
119NC_009600AAG474159741701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %149390502
120NC_009600A14741687418114100 %0 %0 %0 %7 %149390502
121NC_009600T277443774463270 %100 %0 %0 %3 %149390502
122NC_009600AATG376021760321250 %25 %25 %0 %8 %149390502
123NC_009600ATT476181761921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149390502
124NC_009600T157796777981150 %100 %0 %0 %6 %149390502
125NC_009600TATT380327803371125 %75 %0 %0 %9 %149390502
126NC_009600ATT481678816881133.33 %66.67 %0 %0 %9 %149390502
127NC_009600AAAT381774817861375 %25 %0 %0 %7 %149390502
128NC_009600TACG382914829261325 %25 %25 %25 %7 %149390502
129NC_009600T128357083581120 %100 %0 %0 %0 %149390502
130NC_009600T168444584460160 %100 %0 %0 %6 %149390502
131NC_009600ATT584467844801433.33 %66.67 %0 %0 %7 %149390502
132NC_009600AATA384501845111175 %25 %0 %0 %9 %149390502
133NC_009600T208499285011200 %100 %0 %0 %0 %149390502
134NC_009600GAAA385042850521175 %0 %25 %0 %9 %149390502
135NC_009600T148508985102140 %100 %0 %0 %7 %149390502
136NC_009600ATCT385713857241225 %50 %0 %25 %8 %149390502
137NC_009600GTTC38598785998120 %50 %25 %25 %8 %149390502
138NC_009600ATT486133861431133.33 %66.67 %0 %0 %9 %149390502
139NC_009600AAAT386611866211175 %25 %0 %0 %9 %149390502
140NC_009600CATT386683866931125 %50 %0 %25 %9 %149390502
141NC_009600CTT48823688247120 %66.67 %0 %33.33 %8 %149390502
142NC_009600TTTA388637886471125 %75 %0 %0 %9 %149390502
143NC_009600TTATAT390557905741833.33 %66.67 %0 %0 %0 %149390502
144NC_009600TTCT39172291732110 %75 %0 %25 %9 %149390502
145NC_009600A17923309234617100 %0 %0 %0 %5 %149390502
146NC_009600GAT493037930481233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149390502
147NC_009600A12934489345912100 %0 %0 %0 %0 %149390502
148NC_009600AAAT393961939721275 %25 %0 %0 %8 %149390502
149NC_009600TGAT394767947791325 %50 %25 %0 %7 %149390502
150NC_009600TGA494818948291233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149390502
151NC_009600AATA395632956441375 %25 %0 %0 %7 %149390502
152NC_009600TTTC39569495705120 %75 %0 %25 %8 %149390502
153NC_009600TCCGG39792497938150 %20 %40 %40 %6 %149390502
154NC_009600TTTC39824098251120 %75 %0 %25 %8 %149390502
155NC_009600TTTGTT3100961100979190 %83.33 %16.67 %0 %10 %149390502
156NC_009600TAC41018411018521233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %149390502
157NC_009600AAAT31032331032441275 %25 %0 %0 %8 %149390502
158NC_009600A1310370810372013100 %0 %0 %0 %7 %149390502
159NC_009600ATCC31062011062121225 %25 %0 %50 %8 %149390502
160NC_009600TCTA31065891066001225 %50 %0 %25 %8 %149390502
161NC_009600AAGG31067281067381150 %0 %50 %0 %9 %149390502
162NC_009600TTAACG41079791080022433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %0 %149390502
163NC_009600GAGG31094581094691225 %0 %75 %0 %8 %149390502
164NC_009600AGGT31096701096811225 %25 %50 %0 %8 %149390502
165NC_009600TAAG31107901108001150 %25 %25 %0 %9 %149390502
166NC_009600A1411142511143814100 %0 %0 %0 %0 %149390502
167NC_009600ATTT41118501118661725 %75 %0 %0 %5 %149390502
168NC_009600GGAA31129071129171150 %0 %50 %0 %9 %149390502
169NC_009600TAAA31131701131811275 %25 %0 %0 %8 %149390502
170NC_009600GAAT31135321135421150 %25 %25 %0 %9 %149390502
171NC_009600AAG41145701145811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %149390502
172NC_009600T14115430115443140 %100 %0 %0 %7 %149390502
173NC_009600A1511551011552415100 %0 %0 %0 %6 %149390502
174NC_009600A1511603811605215100 %0 %0 %0 %0 %149390502
175NC_009600A1411645311646614100 %0 %0 %0 %7 %149390502
176NC_009600ATTTAT31177971178141833.33 %66.67 %0 %0 %5 %149390502
177NC_009600TAC41182431182531133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %149390502
178NC_009600TAT41184081184181133.33 %66.67 %0 %0 %9 %149390502
179NC_009600T12118581118592120 %100 %0 %0 %0 %149390502
180NC_009600CAA41213191213291166.67 %0 %0 %33.33 %9 %149390502
181NC_009600A1212319012320112100 %0 %0 %0 %0 %149390502
182NC_009600ATCC31248681248801325 %25 %0 %50 %7 %149390502
183NC_009600GTTC3125114125124110 %50 %25 %25 %9 %149390502
184NC_009600GAAT31255971256071150 %25 %25 %0 %9 %149390502
185NC_009600TATTC31256231256361420 %60 %0 %20 %7 %149390502
186NC_009600TC6127014127025120 %50 %0 %50 %8 %149390502
187NC_009600ATCAA41279541279721960 %20 %0 %20 %10 %149390502
188NC_009600T18127982127999180 %100 %0 %0 %5 %149390502
189NC_009600AT61282251282361250 %50 %0 %0 %8 %149390502
190NC_009600TAAT31298101298211250 %50 %0 %0 %8 %149390502
191NC_009600CATT31299901300011225 %50 %0 %25 %0 %149390502
192NC_009600ATT41302111302221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149390502
193NC_009600CTTT3130597130609130 %75 %0 %25 %7 %149390502
194NC_009600T13130834130846130 %100 %0 %0 %7 %149390502
195NC_009600TCTTT3131073131086140 %80 %0 %20 %7 %149390502
196NC_009600AGTATT41317801318032433.33 %50 %16.67 %0 %8 %149390502
197NC_009600TTCC3133693133703110 %50 %0 %50 %9 %149390502
198NC_009600AATT31344951345051150 %50 %0 %0 %9 %149390502
199NC_009600AAAT41347441347601775 %25 %0 %0 %5 %149390502
200NC_009600T19135172135190190 %100 %0 %0 %5 %149390502
201NC_009600CTTA31358101358201125 %50 %0 %25 %9 %149390502
202NC_009600CGTTAA41386091386322433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %0 %149390502
203NC_009600CCTT3139873139883110 %50 %0 %50 %9 %149390502
204NC_009600GGAT31403991404101225 %25 %50 %0 %8 %149390502
205NC_009600ACTAAT31436791436951750 %33.33 %0 %16.67 %5 %149390502
206NC_009600TAAA41442481442631675 %25 %0 %0 %6 %149390502
207NC_009600GTA41447591447701233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149390502