ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Buxus microphylla chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009599	ATT	4	109	120	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009599	CAG	4	909	920	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	149390520
3	NC_009599	GAA	4	2805	2816	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390521
4	NC_009599	TAG	4	5034	5045	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009599	TAT	4	9792	9803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009599	TAA	4	10653	10664	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009599	TAT	7	13280	13301	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	149390526
8	NC_009599	TGT	5	17736	17749	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	149390530
9	NC_009599	TAA	4	24281	24291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	149390531
10	NC_009599	GTT	4	24713	24724	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	149390531
11	NC_009599	TAG	4	29418	29429	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009599	CTA	4	42959	42970	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	149390540
13	NC_009599	GCA	4	43294	43305	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	149390540
14	NC_009599	GTA	4	47384	47394	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009599	AAT	4	47974	47984	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_009599	ATA	5	49589	49602	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009599	AGA	4	49853	49863	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009599	TAA	4	53807	53819	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_009599	AGA	4	54288	54299	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009599	ATA	5	57856	57869	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	149390547
21	NC_009599	TAT	4	58322	58332	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009599	ATT	4	62128	62138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_009599	AAT	5	62529	62544	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_009599	CTT	4	64144	64154	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009599	TTA	4	69393	69404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009599	TTA	4	71289	71300	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_009599	TCT	4	71374	71385	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_009599	TAT	5	74706	74721	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	149390586
29	NC_009599	TCT	4	74748	74760	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	149390586
30	NC_009599	ATT	4	76238	76249	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	149390586
31	NC_009599	CTT	4	88262	88273	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	149390586
32	NC_009599	GAT	4	90107	90117	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	149390586
33	NC_009599	TGA	4	94875	94886	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390586
34	NC_009599	ATT	4	115407	115419	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	149390600
35	NC_009599	AAG	4	116055	116066	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390600
36	NC_009599	ATA	4	116902	116912	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	149390600
37	NC_009599	AAT	4	124747	124758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	149390600
38	NC_009599	TGA	4	127269	127280	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390600
39	NC_009599	AAT	4	129481	129491	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	149390600
40	NC_009599	TTA	6	130121	130138	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	149390600
41	NC_009599	CTT	4	131739	131750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	149390600
42	NC_009599	ATC	4	157038	157048	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_009599	GAA	5	158881	158895	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	149390605

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Buxus microphylla chloroplast