ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chloranthus spicatus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009598	TCT	4	26	36	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009598	TCT	4	535	545	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	149390248
3	NC_009598	CAG	4	799	810	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	149390248
4	NC_009598	GAA	4	1931	1942	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390249
5	NC_009598	TCA	4	6309	6320	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009598	CAT	4	6712	6722	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009598	TAT	5	9252	9266	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_009598	ATT	5	14444	14459	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_009598	TCT	4	14599	14610	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_009598	TAT	8	15035	15057	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009598	TTA	5	16173	16188	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_009598	TTG	4	17250	17260	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	149390258
13	NC_009598	GTT	4	24205	24216	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	149390259
14	NC_009598	CAG	4	28760	28771	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009598	ATA	7	30248	30269	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_009598	TAA	4	32834	32845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009598	ATA	5	34123	34136	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009598	TAA	4	37648	37659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009598	CTT	4	37945	37955	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009598	ATG	4	40080	40090	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	149390267
21	NC_009598	GCA	4	41978	41989	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	149390268
22	NC_009598	TTG	4	45405	45415	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	149390269
23	NC_009598	ATA	4	45681	45692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	149390269
24	NC_009598	AGT	4	47351	47362	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390270
25	NC_009598	TCT	4	53228	53238	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009598	ACT	4	54874	54884	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009598	AGA	4	61759	61769	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009598	TTA	4	62400	62410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009598	ATG	4	63115	63125	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_009598	CTT	4	66228	66240	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_009598	TAT	4	66403	66414	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009598	TCT	4	70293	70304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_009598	GGA	4	82828	82840	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	149390333
34	NC_009598	TTA	4	85013	85024	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	149390333
35	NC_009598	CTT	4	87133	87144	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	149390333
36	NC_009598	TGA	4	93771	93782	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	149390333
37	NC_009598	ATA	4	114937	114949	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	149390332
38	NC_009598	GAA	4	116581	116592	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	149390332
39	NC_009598	AAT	4	116793	116805	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	149390332
40	NC_009598	TTG	4	124232	124242	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	149390332
41	NC_009598	TTA	4	128059	128070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	149390332
42	NC_009598	AAT	4	130869	130881	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	149390332
43	NC_009598	TTA	4	143315	143327	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	149390332

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chloranthus spicatus chloroplast