ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Clupea harengus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009577GTTC325722583120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
2NC_009577TC647864796110 %50 %0 %50 %9 %148922532
3NC_009577CTA4580158121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %148922533
4NC_009577TTC460516062120 %66.67 %0 %33.33 %8 %148922533
5NC_009577CCCT369676977110 %25 %0 %75 %9 %148922533
6NC_009577TACCCC3819782131716.67 %16.67 %0 %66.67 %5 %148922536
7NC_009577CTTAA3834383571540 %40 %0 %20 %6 %148922536
8NC_009577TTA4853185421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %148922536
9NC_009577CCT41167411685120 %33.33 %0 %66.67 %8 %148922540
10NC_009577TCC41169411705120 %33.33 %0 %66.67 %8 %148922540
11NC_009577TCC41273412745120 %33.33 %0 %66.67 %8 %148922541
12NC_009577CTAT313945139551125 %50 %0 %25 %9 %148922542
13NC_009577CCA414243142541233.33 %0 %0 %66.67 %8 %148922542
14NC_009577TTC41463814649120 %66.67 %0 %33.33 %8 %148922543
15NC_009577CCATTT314916149341916.67 %50 %0 %33.33 %10 %148922543
16NC_009577ATT415453154641233.33 %66.67 %0 %0 %8 %148922543
17NC_009577CCCG31566815678110 %0 %25 %75 %9 %Non-Coding
18NC_009577TAT415848158601333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_009577ATAA316029160411375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_009577AACC316117161281250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
21NC_009577GT71665816670130 %50 %50 %0 %7 %Non-Coding