Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhodomonas salina chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009573CTT425092521130 %66.67 %0 %33.33 %7 %149071968
2NC_009573GAT4323132421233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149071968
3NC_009573GCT471317142120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %149071971
4NC_009573CAA4961896281166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_009573TAA411781117931366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_009573AGA513431134441466.67 %0 %33.33 %0 %7 %149071973
7NC_009573TAA415091151011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %149072101
8NC_009573TAA415250152641566.67 %33.33 %0 %0 %6 %149072101
9NC_009573ATT415785157951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_009573CAG415867158781233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %171259323
11NC_009573CCA415996160061133.33 %0 %0 %66.67 %9 %171259323
12NC_009573ATA417956179701566.67 %33.33 %0 %0 %6 %149072099
13NC_009573ACA527148271611466.67 %0 %0 %33.33 %7 %149071978
14NC_009573CAT428690287001133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %149072095
15NC_009573ATA431092311021166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_009573GCT43299933009110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %149072092
17NC_009573TTC43391433926130 %66.67 %0 %33.33 %7 %149072090
18NC_009573TCA434399344101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %149072090
19NC_009573CAA436524365351266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_009573TCT43962839638110 %66.67 %0 %33.33 %9 %149072085
21NC_009573ATT446087460991333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_009573GAA446959469701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %149071982
23NC_009573TCT45016350173110 %66.67 %0 %33.33 %9 %149072084
24NC_009573GCT45213252143120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %149071985
25NC_009573TAT554702547161533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_009573ACC457615576251133.33 %0 %0 %66.67 %9 %149072081
27NC_009573TAT458973589841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_009573TAA460245602551166.67 %33.33 %0 %0 %9 %149072077
29NC_009573CTT46435364364120 %66.67 %0 %33.33 %8 %149072071
30NC_009573TCA466669666801233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
31NC_009573TAG469766697761133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149071991
32NC_009573GAA469803698141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %149071991
33NC_009573TAG470379703901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149071992
34NC_009573TTC47648476494110 %66.67 %0 %33.33 %9 %149072060
35NC_009573TAG479395794061233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %149072058
36NC_009573TCT47997679987120 %66.67 %0 %33.33 %8 %149072058
37NC_009573GTT48394383953110 %66.67 %33.33 %0 %9 %149072056
38NC_009573CTT48655986570120 %66.67 %0 %33.33 %8 %149072056
39NC_009573GTA487555875651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149071993
40NC_009573ATA41000601000711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_009573ATT41018371018481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149072048
42NC_009573ACC41035941036051233.33 %0 %0 %66.67 %8 %149072047
43NC_009573GGT4110398110408110 %33.33 %66.67 %0 %9 %149072010
44NC_009573TGG4111807111818120 %33.33 %66.67 %0 %8 %149072012
45NC_009573TAC41154901155011233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %149072021
46NC_009573AAG41166151166251166.67 %0 %33.33 %0 %9 %149072023
47NC_009573ATT41182831182941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149072026
48NC_009573TAC41223041223141133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %149072034
49NC_009573TAC51239201239341533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %149072036
50NC_009573TTA41256311256421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149072038
51NC_009573ATT41266921267031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %149072038
52NC_009573AAT41304291304391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_009573ACT51304761304901533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %149072042
54NC_009573TAA41308921309031266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_009573TCT4130977130988120 %66.67 %0 %33.33 %8 %149072041
56NC_009573ATG41311101311201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %149072041
57NC_009573ATC41318581318691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %149072041
58NC_009573TGG4134645134656120 %33.33 %66.67 %0 %8 %149071967