ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cuora aurocapitata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009509	CTAA	3	1457	1468	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009509	ACA	4	1846	1857	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009509	GTTC	3	2507	2518	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009509	TAA	4	2672	2684	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_009509	AACA	3	3289	3300	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	148543133
6	NC_009509	ACCA	3	4865	4876	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	148543134
7	NC_009509	GCAGGC	3	5758	5775	18	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	5 %	148543135
8	NC_009509	AGG	4	6069	6079	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	148543135
9	NC_009509	ATA	4	6796	6807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	148543135
10	NC_009509	TTA	4	7199	7209	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	148543136
11	NC_009509	GCA	4	8746	8757	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543143
12	NC_009509	ACT	4	9751	9762	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	148543139
13	NC_009509	TCATTA	3	9816	9832	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	148543139
14	NC_009509	TTCA	3	10119	10129	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	148543140
15	NC_009509	TAA	4	10255	10266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	148543140
16	NC_009509	ATA	4	10473	10484	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	148543144
17	NC_009509	ACAT	3	12421	12432	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	148543141
18	NC_009509	TCA	4	13240	13250	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	148543141
19	NC_009509	AACA	3	13691	13703	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	148543142
20	NC_009509	T	12	16021	16032	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009509	TAT	4	16395	16405	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009509	TAT	6	16411	16427	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_009509	TAT	6	16435	16451	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_009509	TAT	6	16459	16475	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_009509	TAT	6	16483	16499	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_009509	TAT	4	16507	16517	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009509	TAT	6	16523	16539	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_009509	TAT	6	16547	16563	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_009509	TAT	6	16571	16587	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_009509	TAT	6	16619	16635	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_009509	TAT	6	16643	16659	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_009509	TAT	6	16667	16683	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_009509	TAT	6	16691	16707	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_009509	TAT	6	16715	16731	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_009509	TAT	6	16739	16755	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_009509	TAT	6	16763	16779	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_009509	TAT	6	16787	16803	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_009509	TAT	5	16811	16824	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_009509	ATT	5	16828	16841	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_009509	TAT	6	16851	16867	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_009509	TAT	4	16875	16887	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cuora aurocapitata mitochondrion