ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Reticulitermes virginicus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009500	ACTT	3	820	831	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	148368766
2	NC_009500	ACT	4	1811	1821	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	148368767
3	NC_009500	CAA	4	1980	1992	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	148368767
4	NC_009500	ACT	4	2102	2112	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	148368767
5	NC_009500	CAT	4	2836	2846	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	148368767
6	NC_009500	ACACTA	3	4393	4410	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	148368770
7	NC_009500	ACGA	3	5719	5729	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	148368772
8	NC_009500	TAA	4	6156	6166	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_009500	ATA	4	6647	6659	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	148368773
10	NC_009500	CAAA	3	6716	6727	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	148368773
11	NC_009500	AAG	4	7501	7511	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	148368773
12	NC_009500	ACA	4	8261	8271	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	148368774
13	NC_009500	ATAA	3	9051	9062	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	148368774
14	NC_009500	AATA	3	9106	9117	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	148368774
15	NC_009500	AC	6	9488	9498	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	148368774
16	NC_009500	TAAAA	3	9504	9517	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	148368774
17	NC_009500	TAAA	3	9635	9645	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	148368775
18	NC_009500	AAC	4	10314	10325	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	148368776
19	NC_009500	AAT	4	10326	10338	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	148368776
20	NC_009500	AAT	4	10350	10361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	148368776
21	NC_009500	CAAA	3	11809	11820	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	148368778
22	NC_009500	AATA	4	13467	13482	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_009500	AAATAA	4	13617	13640	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009500	ACA	4	13926	13937	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009500	AAAC	3	14865	14876	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009500	AGA	4	15542	15553	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009500	AAT	5	15616	15629	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_009500	TA	6	15840	15850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009500	AGA	4	16092	16103	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009500	AAT	5	16166	16179	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_009500	TA	6	16390	16400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Reticulitermes virginicus mitochondrion