ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fusarium graminearum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009493	AAG	4	1822	1833	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009493	ATA	4	2620	2631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009493	ATA	4	3579	3590	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
4	NC_009493	TAA	4	3874	3885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
5	NC_009493	TAT	4	9634	9645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009493	ATA	4	10326	10338	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835810
7	NC_009493	ATA	4	10386	10398	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835810
8	NC_009493	ATA	4	10438	10449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
9	NC_009493	ATA	4	10668	10679	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
10	NC_009493	GTA	4	11928	11939	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	14835810
11	NC_009493	ACA	4	18806	18817	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
12	NC_009493	AGA	4	19631	19642	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	14835809
13	NC_009493	TTA	4	20509	20519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
14	NC_009493	ATT	4	21292	21304	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14835809
15	NC_009493	TAT	4	22130	22141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
16	NC_009493	TAT	4	24593	24603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
17	NC_009493	TAA	4	25209	25221	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835809
18	NC_009493	ATT	4	25277	25288	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
19	NC_009493	TAT	5	30044	30057	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14835809
20	NC_009493	CTC	4	30313	30324	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009493	ATA	4	31000	31010	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14835809
22	NC_009493	ATT	4	33516	33526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
23	NC_009493	TAT	4	34102	34113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
24	NC_009493	TTA	4	35090	35101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
25	NC_009493	ATT	4	35663	35673	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
26	NC_009493	TAC	4	37509	37519	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	14835810
27	NC_009493	ATT	4	41255	41266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835810
28	NC_009493	TAT	4	43514	43524	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009493	AGG	4	45470	45481	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_009493	CTA	4	48004	48015	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
31	NC_009493	ATA	6	48447	48463	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	14835809
32	NC_009493	AGC	4	49198	49209	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	14835809
33	NC_009493	ATT	4	49330	49341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
34	NC_009493	TCT	4	52024	52036	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	14835809
35	NC_009493	TGT	4	55734	55745	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	14835809
36	NC_009493	TAT	4	57512	57522	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_009493	TAA	5	59204	59218	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14835809
38	NC_009493	TAA	4	59222	59233	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835809
39	NC_009493	TAT	5	60483	60497	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	14835809
40	NC_009493	TTA	4	62044	62055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
41	NC_009493	TTA	4	66470	66481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
42	NC_009493	TTA	4	74651	74662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
43	NC_009493	TAA	4	77070	77080	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_009493	TAT	5	77598	77612	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_009493	TTA	4	78372	78383	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
46	NC_009493	TAA	7	78915	78935	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14835809
47	NC_009493	ATT	4	82577	82588	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
48	NC_009493	TAT	4	82763	82774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_009493	ATA	8	84571	84594	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835808
50	NC_009493	GAG	4	87435	87445	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009493	TAA	4	89378	89389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	14835809
52	NC_009493	TAA	4	90283	90294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	14835809
53	NC_009493	CTA	4	91160	91171	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
54	NC_009493	CAT	4	92667	92678	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
55	NC_009493	CAT	4	93247	93258	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_009493	TAA	5	93890	93905	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14835810
57	NC_009493	TAT	4	94406	94417	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835810

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fusarium graminearum mitochondrion