ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Fusarium graminearum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009493	GTAA	3	1522	1533	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009493	AAG	4	1822	1833	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009493	ATA	4	2620	2631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009493	GCTA	3	2734	2745	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009493	A	12	2971	2982	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009493	TA	11	3422	3442	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009493	ATA	4	3579	3590	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
8	NC_009493	AAAG	3	3668	3679	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	14835810
9	NC_009493	TAA	4	3874	3885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
10	NC_009493	A	12	3931	3942	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	14835810
11	NC_009493	TTAT	3	3988	3998	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14835810
12	NC_009493	AT	7	5152	5166	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_009493	AATAA	3	5268	5281	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009493	A	13	6115	6127	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_009493	A	12	6733	6744	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009493	AAAC	3	7808	7820	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009493	TAGTA	3	8687	8701	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009493	ATAA	3	9134	9144	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009493	TAT	4	9634	9645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009493	ATA	4	10326	10338	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835810
21	NC_009493	ATA	4	10386	10398	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835810
22	NC_009493	ATA	4	10438	10449	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
23	NC_009493	ATA	4	10668	10679	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835810
24	NC_009493	GTA	4	11928	11939	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	14835810
25	NC_009493	CAAC	3	13611	13621	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	14835810
26	NC_009493	ATTA	3	16936	16946	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009493	A	13	17011	17023	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009493	A	12	17130	17141	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009493	ATTT	3	18525	18537	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	14835809
30	NC_009493	AAAT	3	18757	18767	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14835809
31	NC_009493	ACA	4	18806	18817	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
32	NC_009493	AGA	4	19631	19642	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	14835809
33	NC_009493	TA	6	20320	20330	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
34	NC_009493	TA	6	20457	20467	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
35	NC_009493	TTA	4	20509	20519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
36	NC_009493	ATT	4	21292	21304	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14835809
37	NC_009493	TCAA	3	21703	21714	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	14835809
38	NC_009493	TAT	4	22130	22141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
39	NC_009493	ATCA	3	22587	22598	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	14835809
40	NC_009493	TTTA	3	24303	24313	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14835809
41	NC_009493	TAT	4	24593	24603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
42	NC_009493	TAA	4	25209	25221	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14835809
43	NC_009493	ATT	4	25277	25288	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
44	NC_009493	ATTA	3	26158	26168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
45	NC_009493	AAAT	3	26316	26327	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14835809
46	NC_009493	GCAC	3	27686	27697	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	14835809
47	NC_009493	AT	6	29040	29050	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
48	NC_009493	TAT	5	30044	30057	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14835809
49	NC_009493	G	18	30273	30290	18	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_009493	CTC	4	30313	30324	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
51	NC_009493	AAGCTA	3	30383	30401	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
52	NC_009493	ATA	4	31000	31010	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14835809
53	NC_009493	TA	7	32150	32163	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	14835809
54	NC_009493	TA	6	33389	33400	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14835809
55	NC_009493	ATT	4	33516	33526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
56	NC_009493	TAT	4	34102	34113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
57	NC_009493	TTA	4	35090	35101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
58	NC_009493	ATTA	3	35328	35338	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
59	NC_009493	ATTA	3	35488	35498	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
60	NC_009493	ATT	4	35663	35673	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14835809
61	NC_009493	T	14	36107	36120	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_009493	AATAA	3	36562	36576	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_009493	CTAT	3	37237	37247	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	14835810
64	NC_009493	TCAA	3	37430	37441	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	14835810
65	NC_009493	TAC	4	37509	37519	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	14835810
66	NC_009493	TAGC	3	38486	38497	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	14835810
67	NC_009493	TTTA	3	39572	39583	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14835810
68	NC_009493	TTAT	3	39628	39639	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14835810
69	NC_009493	ATT	4	41255	41266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835810
70	NC_009493	TTAA	4	42418	42433	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_009493	TTAT	3	42737	42748	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009493	TAGCAC	3	42794	42811	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
73	NC_009493	TGCT	4	42889	42904	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
74	NC_009493	TAT	4	43514	43524	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_009493	AGG	4	45470	45481	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_009493	TA	6	45765	45776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_009493	AT	7	45779	45791	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_009493	AG	6	46731	46741	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	14835809
79	NC_009493	ATAA	3	47584	47595	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14835809
80	NC_009493	CTA	4	48004	48015	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14835809
81	NC_009493	ATA	6	48447	48463	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	14835809
82	NC_009493	AGC	4	49198	49209	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	14835809
83	NC_009493	ATT	4	49330	49341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
84	NC_009493	AAAT	3	50110	50121	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14835809
85	NC_009493	AT	6	50261	50271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
86	NC_009493	TA	6	51127	51137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
87	NC_009493	TTTA	3	51205	51216	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	14835809
88	NC_009493	TTTA	3	51679	51690	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14835809
89	NC_009493	TTTA	3	51779	51789	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14835809
90	NC_009493	TCT	4	52024	52036	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	14835809
91	NC_009493	TTAA	3	52215	52226	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14835809
92	NC_009493	AT	6	52269	52279	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
93	NC_009493	ATAA	3	52889	52900	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14835809
94	NC_009493	TA	6	53863	53873	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
95	NC_009493	TGAG	3	54221	54233	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	14835809
96	NC_009493	TGT	4	55734	55745	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	14835809
97	NC_009493	TGGC	3	56341	56352	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	14835809
98	NC_009493	A	14	56981	56994	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_009493	T	13	57005	57017	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_009493	CTAGCA	3	57240	57257	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009493	TAT	4	57512	57522	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_009493	AAGC	3	57814	57824	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_009493	GCAA	3	58085	58096	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_009493	TAAT	3	58724	58734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009493	TAA	5	59204	59218	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14835809
106	NC_009493	TAA	4	59222	59233	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14835809
107	NC_009493	TA	6	59665	59676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14835809
108	NC_009493	TA	6	59695	59705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
109	NC_009493	TAT	5	60483	60497	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	14835809
110	NC_009493	TTA	4	62044	62055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
111	NC_009493	AATT	3	62511	62522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14835809
112	NC_009493	GATT	4	62594	62609	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	14835809
113	NC_009493	TTAA	3	63214	63225	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	14835809
114	NC_009493	AATT	4	64262	64277	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	14835809
115	NC_009493	TAATT	3	66204	66217	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	14835809
116	NC_009493	AAATT	3	66417	66431	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	14835809
117	NC_009493	TTA	4	66470	66481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
118	NC_009493	CTTA	3	66639	66650	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	14835809
119	NC_009493	ATTAAT	3	66860	66878	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	14835809
120	NC_009493	TTAAA	3	68137	68151	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	14835809
121	NC_009493	TTTA	3	68751	68761	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14835809
122	NC_009493	TA	6	69839	69849	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14835809
123	NC_009493	ATTAAT	3	71757	71775	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	14835809
124	NC_009493	ATTATA	3	73659	73677	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	14835809
125	NC_009493	AAAG	3	74529	74539	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	14835809
126	NC_009493	TTAT	3	74576	74587	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14835809
127	NC_009493	TTA	4	74651	74662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
128	NC_009493	TAAA	3	75308	75319	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14835809
129	NC_009493	TAA	4	77070	77080	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_009493	TAT	5	77598	77612	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_009493	AAACA	4	77619	77638	20	80 %	0 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
132	NC_009493	TTA	4	78372	78383	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14835809
133	NC_009493	TAA	7	78915	78935	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14835809
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Fusarium graminearum mitochondrion