ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora sojae mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009385	TAA	4	6	16	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009385	TTAA	3	2806	2817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009385	A	18	3302	3319	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	14593233
4	NC_009385	CATA	3	3355	3365	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	14593233
5	NC_009385	ATT	5	4032	4046	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	14593233
6	NC_009385	AATT	6	4431	4452	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009385	A	13	4808	4820	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	14593233
8	NC_009385	TAA	7	4812	4832	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593233
9	NC_009385	ATT	4	5089	5099	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593233
10	NC_009385	TAAA	3	5141	5151	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009385	TTA	4	5201	5211	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009385	AAT	4	6440	6451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_009385	AAATT	3	6941	6954	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009385	AATTTA	3	7003	7020	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_009385	TAT	5	7091	7106	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	14593233
16	NC_009385	T	13	7433	7445	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009385	TTTA	3	7501	7513	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009385	ATATTT	3	7534	7551	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_009385	AATT	3	7568	7579	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009385	AAAAT	3	7593	7606	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_009385	A	15	7822	7836	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	14593233
22	NC_009385	TAAA	3	8368	8378	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593233
23	NC_009385	TAT	5	8448	8461	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593233
24	NC_009385	AAAT	3	8475	8485	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593233
25	NC_009385	ATA	4	8535	8546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009385	TAT	4	8975	8986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593233
27	NC_009385	TTAG	3	9608	9619	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	14593233
28	NC_009385	AATT	3	10089	10099	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593233
29	NC_009385	TAAA	3	10159	10169	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_009385	AATATA	4	10233	10256	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
31	NC_009385	TTTA	3	10297	10307	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_009385	TTA	4	10371	10381	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_009385	ATT	4	10392	10402	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_009385	TATT	3	10576	10587	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_009385	TAT	4	10837	10847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_009385	AAT	4	10925	10936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_009385	TA	6	10962	10972	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_009385	AAATGA	3	11189	11206	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_009385	AAT	4	11221	11232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_009385	AAAT	3	11330	11340	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593233
41	NC_009385	TAA	4	11401	11412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593233
42	NC_009385	TAA	4	11500	11510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593233
43	NC_009385	ATAAAA	3	11671	11689	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	14593233
44	NC_009385	AAAG	3	12139	12149	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	14593233
45	NC_009385	AAAT	3	12436	12447	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_009385	A	12	12654	12665	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	14593233
47	NC_009385	TAAAA	3	12890	12903	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	14593233
48	NC_009385	ATA	4	13032	13042	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_009385	TTATA	3	13044	13057	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_009385	ATT	4	13427	13438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009385	ATA	4	13618	13628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_009385	TA	6	13666	13676	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_009385	TAAAA	3	14170	14183	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_009385	A	14	14774	14787	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	14593234
55	NC_009385	AAAT	3	14920	14931	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14593234
56	NC_009385	AAT	4	15197	15208	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593234
57	NC_009385	AT	6	15266	15276	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593234
58	NC_009385	ATA	4	15953	15964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593234
59	NC_009385	TTAA	3	15994	16005	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_009385	TTTAAA	3	16146	16163	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	14593234
61	NC_009385	TTTTA	3	16234	16247	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	14593234
62	NC_009385	T	14	16760	16773	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	14593234
63	NC_009385	ATTT	3	17302	17312	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593234
64	NC_009385	T	21	17341	17361	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	14593234
65	NC_009385	TAA	4	17485	17495	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_009385	TAAA	3	17754	17764	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593234
67	NC_009385	ATA	4	17902	17913	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593234
68	NC_009385	TATT	3	17916	17927	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14593234
69	NC_009385	AATA	3	17928	17940	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	14593234
70	NC_009385	ATTA	3	18418	18429	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14593234
71	NC_009385	ATA	4	18981	18991	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593234
72	NC_009385	TTCT	3	19485	19495	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	14593234
73	NC_009385	AAAC	3	20672	20682	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	14593234
74	NC_009385	AT	8	20740	20755	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	14593234
75	NC_009385	TA	6	20971	20981	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593234
76	NC_009385	TTA	4	21253	21263	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593234
77	NC_009385	AATTT	3	21409	21424	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	14593234
78	NC_009385	TTAT	3	21598	21608	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593234
79	NC_009385	CATT	3	21740	21750	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	14593234
80	NC_009385	TTA	4	22267	22279	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593234
81	NC_009385	TATT	3	22325	22336	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14593234
82	NC_009385	AT	6	22875	22885	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593235
83	NC_009385	TGT	6	23061	23078	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	14593235
84	NC_009385	TTAT	3	23648	23658	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593235
85	NC_009385	ACA	4	24094	24104	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	14593235
86	NC_009385	ATA	6	24387	24403	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	14593235
87	NC_009385	ATA	6	25014	25030	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
88	NC_009385	ATTTA	4	25090	25108	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_009385	AT	7	25129	25141	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_009385	TAT	4	25385	25395	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_009385	AAATAT	3	25402	25420	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
92	NC_009385	ATT	4	25574	25586	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593235
93	NC_009385	ATT	4	25974	25984	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593235
94	NC_009385	ATT	4	26486	26497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593235
95	NC_009385	ATTTT	3	27041	27056	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	14593235
96	NC_009385	TCAT	3	27311	27321	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	14593235
97	NC_009385	TAT	4	27371	27383	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593235
98	NC_009385	TA	7	27488	27500	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	14593235
99	NC_009385	TAT	4	27702	27713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593235
100	NC_009385	T	12	28045	28056	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	14593235
101	NC_009385	TAT	4	28066	28076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593235
102	NC_009385	A	12	28116	28127	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	14593235
103	NC_009385	AT	11	28441	28462	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_009385	GTT	4	28720	28731	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	14593235
105	NC_009385	TCT	4	29000	29010	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	14593235
106	NC_009385	GTA	4	29338	29349	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	14593235
107	NC_009385	GAAA	3	29645	29656	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	14593235
108	NC_009385	TTA	4	29658	29669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593235
109	NC_009385	TAT	4	29696	29707	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593235
110	NC_009385	TAA	4	30019	30029	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_009385	AAAT	3	30152	30164	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	14593235
112	NC_009385	AAAT	3	30287	30299	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	14593235
113	NC_009385	ATTT	3	30396	30406	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_009385	TTAT	3	30627	30638	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_009385	GTT	4	30785	30795	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_009385	TAAA	3	30823	30833	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_009385	AAAAT	3	31048	31061	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	14593235
118	NC_009385	ATA	5	31074	31088	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14593235
119	NC_009385	AAAT	3	31393	31404	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14593235
120	NC_009385	TTCAGC	3	31551	31568	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	14593235
121	NC_009385	TCT	4	32070	32080	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	14593235
122	NC_009385	TTA	4	32313	32324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593237
123	NC_009385	TTA	4	33258	33269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593237
124	NC_009385	TTA	4	33426	33437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593237
125	NC_009385	AAATT	3	34195	34209	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_009385	ATA	4	34414	34426	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_009385	TATT	4	35046	35061	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	14593236
128	NC_009385	T	17	35056	35072	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	14593236
129	NC_009385	ATT	4	35105	35117	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593236
130	NC_009385	ATTT	3	35125	35136	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14593236
131	NC_009385	TTTA	3	35188	35199	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	14593236
132	NC_009385	ATTT	3	35453	35463	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593236
133	NC_009385	TTTTA	3	35820	35833	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	14593236
134	NC_009385	T	17	36019	36035	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	14593236
135	NC_009385	ATA	4	36087	36098	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_009385	T	17	36102	36118	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	14593236
137	NC_009385	TAAAA	3	37314	37327	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	14593236
138	NC_009385	TTAA	3	37388	37399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	14593236
139	NC_009385	A	16	37573	37588	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	14593236
140	NC_009385	A	13	39012	39024	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	14593236
141	NC_009385	TAA	5	39064	39077	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	14593236
142	NC_009385	AT	6	39215	39225	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593236
143	NC_009385	TAA	4	39231	39241	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593236
144	NC_009385	A	13	39260	39272	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	14593236
145	NC_009385	ATA	4	39500	39511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593236
146	NC_009385	AATA	3	39588	39598	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593236
147	NC_009385	AAAAAT	3	39611	39628	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	14593236
148	NC_009385	A	14	39805	39818	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	14593236
149	NC_009385	ATT	4	39916	39928	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593236
150	NC_009385	TTTA	3	40036	40046	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593236
151	NC_009385	A	12	40846	40857	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	14593237
152	NC_009385	T	13	41057	41069	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	14593237
153	NC_009385	TAT	4	41363	41374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593237
154	NC_009385	TAG	4	41426	41436	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	14593237
155	NC_009385	A	14	41591	41604	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	14593237
156	NC_009385	TAA	4	41599	41610	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593237
157	NC_009385	AATA	3	41672	41683	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14593237
158	NC_009385	TTAAA	3	41763	41776	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	14593237
159	NC_009385	AAAAT	3	41967	41981	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	14593237
160	NC_009385	TTAA	3	41987	41997	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593237
161	NC_009385	TTAA	3	42169	42179	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	14593237
162	NC_009385	TTAAAA	3	42253	42270	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	14593237
163	NC_009385	TAAA	3	42572	42582	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593237
164	NC_009385	ATATT	3	42620	42633	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	14593237
165	NC_009385	TAAA	3	42636	42647	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	14593237
166	NC_009385	TAAAA	3	42673	42686	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	14593237
167	NC_009385	AAAT	3	42715	42725	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593237
168	NC_009385	AAAT	3	42745	42755	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	14593237
169	NC_009385	TTTA	3	42780	42790	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	14593237
170	NC_009385	AAAT	3	42841	42852	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	14593237
171	NC_009385	ATTTAA	3	42909	42926	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	14593237
172	NC_009385	A	16	42940	42955	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	14593237

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora sojae mitochondrion