ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora ramorum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009384	ATA	4	3106	3117	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009384	ATT	5	3982	3996	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	14593242
3	NC_009384	ACA	12	6616	6651	36	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009384	TAA	4	6667	6678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009384	ATA	4	6886	6897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009384	TAT	5	7885	7898	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593242
7	NC_009384	TAT	4	8405	8416	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593242
8	NC_009384	ATT	5	9531	9544	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593242
9	NC_009384	TAT	5	9739	9752	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_009384	ATT	4	10343	10354	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593243
11	NC_009384	CTC	4	10391	10402	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	14593243
12	NC_009384	TAA	4	10833	10844	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593243
13	NC_009384	TAA	4	10932	10942	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593243
14	NC_009384	TAA	4	11238	11249	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593243
15	NC_009384	ATT	5	12559	12572	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_009384	AAT	4	13476	13486	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009384	ATA	4	13974	13984	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593243
18	NC_009384	ACC	4	14270	14280	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	14593243
19	NC_009384	ATA	4	14638	14649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593243
20	NC_009384	ATA	4	15161	15172	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593243
21	NC_009384	TAA	4	16699	16710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_009384	TAA	4	16882	16892	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593243
23	NC_009384	ATA	4	18198	18209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593243
24	NC_009384	TTA	4	21216	21228	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593244
25	NC_009384	TGT	4	22003	22014	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	14593244
26	NC_009384	ATT	4	24006	24016	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593244
27	NC_009384	ATT	4	25314	25324	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593244
28	NC_009384	TAT	4	25403	25415	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593244
29	NC_009384	TAA	4	25459	25469	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593244
30	NC_009384	ATT	4	25667	25679	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14593244
31	NC_009384	GAG	4	26460	26471	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	14593244
32	NC_009384	ATA	4	26509	26520	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593244
33	NC_009384	ATA	5	27110	27123	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_009384	ATA	5	27467	27481	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14593244
35	NC_009384	TCT	4	28460	28470	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	14593244
36	NC_009384	TTA	4	30546	30556	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14593244
37	NC_009384	AAT	4	31521	31532	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	14593245
38	NC_009384	TGG	4	33603	33614	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	14593245
39	NC_009384	TAA	5	34247	34261	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	14593245
40	NC_009384	TAA	4	35566	35576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14593245
41	NC_009384	TAT	4	37689	37700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	14593246
42	NC_009384	TAA	4	37923	37934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	14593246

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phytophthora ramorum mitochondrion