ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nasturtium officinale chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009275	TCT	4	705	715	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389076
2	NC_009275	CAG	4	969	980	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389076
3	NC_009275	ATA	4	4680	4692	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_009275	TAT	5	8091	8106	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_009275	AAT	4	13078	13089	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009275	ATA	4	13741	13752	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009275	GAT	4	15317	15329	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139389085
8	NC_009275	GTT	4	23170	23181	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389087
9	NC_009275	TCA	4	25524	25534	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389088
10	NC_009275	TAT	4	28188	28198	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009275	TAA	6	31291	31309	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_009275	TAT	4	31882	31892	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_009275	ATA	5	35986	36001	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_009275	ATA	4	36921	36932	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009275	ATG	4	38402	38412	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389095
16	NC_009275	GCA	4	40300	40311	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389096
17	NC_009275	ATG	4	40626	40636	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389096
18	NC_009275	AGA	5	43787	43802	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157011964
19	NC_009275	TTG	4	43828	43838	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	157011964
20	NC_009275	TAG	4	43890	43900	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011964
21	NC_009275	TAT	6	46165	46181	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_009275	TAA	4	46324	46336	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_009275	TAT	5	49846	49860	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_009275	CTA	4	50462	50473	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009275	TTA	4	51168	51179	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009275	TAT	4	54593	54603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009275	TTG	4	54823	54833	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009275	CTT	4	66555	66566	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009275	AAG	4	66862	66874	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_009275	TCT	4	78244	78254	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389143
31	NC_009275	ATC	4	81894	81904	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389143
32	NC_009275	GAT	4	84963	84973	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389143
33	NC_009275	AGA	4	90116	90126	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139389143
34	NC_009275	AAT	4	95458	95468	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389143
35	NC_009275	TTC	4	99268	99279	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389120
36	NC_009275	TTA	4	99874	99884	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139389120
37	NC_009275	TCT	4	111528	111538	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389120
38	NC_009275	GTT	4	114405	114415	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	139389120
39	NC_009275	ACA	4	115476	115486	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	139389120
40	NC_009275	TAT	4	119547	119558	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139389120
41	NC_009275	TTG	4	126282	126293	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389120
42	NC_009275	TCT	4	127929	127939	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389120
43	NC_009275	GAA	4	140102	140113	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389120
44	NC_009275	AGA	4	149715	149726	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389160
45	NC_009275	ATC	4	154408	154418	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389162

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nasturtium officinale chloroplast