ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Lobularia maritima chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009274AATA31331431175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_009274TACC35785881125 %25 %0 %50 %9 %139390133
3NC_009274CAAA3433243421175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
4NC_009274ATGA3464146511150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
5NC_009274TTCT362466257120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_009274TTCT370517062120 %75 %0 %25 %8 %139390136
7NC_009274CTTT380398050120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
8NC_009274AGAA3841184221275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
9NC_009274GTTT391859196120 %75 %25 %0 %8 %139390137
10NC_009274AAAT312695127061275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_009274TTCA321242212531225 %50 %0 %25 %8 %139390143
12NC_009274TAAG326011260221250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
13NC_009274AAAT326430264411275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_009274AATT326895269071350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
15NC_009274CAAA327631276421275 %0 %0 %25 %0 %Non-Coding
16NC_009274TTTA328671286811125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_009274AAGA329477294881275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
18NC_009274TTTC32982429834110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
19NC_009274TTCT52983529853190 %75 %0 %25 %10 %Non-Coding
20NC_009274ATTT329878298891225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_009274AAAG330973309841275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
22NC_009274GAAA332770327811275 %0 %25 %0 %8 %139390148
23NC_009274TTAT333945339551125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_009274AAAC335331353421275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
25NC_009274AATA336943369531175 %25 %0 %0 %9 %139390151
26NC_009274TAGA340867408781250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
27NC_009274GTAA343027430371150 %25 %25 %0 %9 %157011971
28NC_009274CTAA347617476281250 %25 %0 %25 %8 %139390156
29NC_009274GATT348879488901225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
30NC_009274ACTT348910489201125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
31NC_009274CTTT45270052715160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
32NC_009274ATTT358585585961225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_009274TAAA461487615021675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
34NC_009274CAGC362289623001225 %0 %25 %50 %8 %139390168
35NC_009274TAGA363499635091150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
36NC_009274TCTT36364663657120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
37NC_009274TATT367991680011125 %75 %0 %0 %9 %139390199
38NC_009274TTGA369358693691225 %50 %25 %0 %8 %139390199
39NC_009274TGTC36959569605110 %50 %25 %25 %9 %139390199
40NC_009274AGAA371627716381275 %0 %25 %0 %8 %139390199
41NC_009274TTTA377123771341225 %75 %0 %0 %0 %139390199
42NC_009274TTCA378168781791225 %50 %0 %25 %8 %139390199
43NC_009274TTTC48059280607160 %75 %0 %25 %6 %139390199
44NC_009274CAAT381110811201150 %25 %0 %25 %9 %139390199
45NC_009274AATT381442814521150 %50 %0 %0 %9 %139390199
46NC_009274TTCT38616886178110 %75 %0 %25 %9 %139390199
47NC_009274CTTT38739187401110 %75 %0 %25 %9 %139390199
48NC_009274TGAT389258892701325 %50 %25 %0 %7 %139390199
49NC_009274AATA390105901171375 %25 %0 %0 %7 %139390199
50NC_009274AAAT391872918821175 %25 %0 %0 %9 %139390199
51NC_009274ATTT395434954441125 %75 %0 %0 %9 %139390199
52NC_009274ATCC31011391011501225 %25 %0 %50 %8 %139390176
53NC_009274CTAT31015341015451225 %50 %0 %25 %8 %139390176
54NC_009274GAGG31043941044051225 %0 %75 %0 %8 %139390176
55NC_009274AGGT31046061046171225 %25 %50 %0 %8 %139390176
56NC_009274TAAG31057261057361150 %25 %25 %0 %9 %139390176
57NC_009274GAAA31086391086501275 %0 %25 %0 %8 %139390176
58NC_009274ATAG31107211107321250 %25 %25 %0 %0 %139390176
59NC_009274ATTT31109321109421125 %75 %0 %0 %9 %139390176
60NC_009274AATT31119141119251250 %50 %0 %0 %8 %139390176
61NC_009274TATT31126141126251225 %75 %0 %0 %8 %139390176
62NC_009274AAAT51153981154161975 %25 %0 %0 %10 %139390176
63NC_009274TCTT3117966117977120 %75 %0 %25 %8 %139390176
64NC_009274TAAA31190301190401175 %25 %0 %0 %9 %139390176
65NC_009274CTTT3121692121702110 %75 %0 %25 %9 %139390176
66NC_009274TTAA31218311218411150 %50 %0 %0 %9 %139390176
67NC_009274ATAG31226191226291150 %25 %25 %0 %9 %139390176
68NC_009274TTTG3123544123554110 %75 %25 %0 %9 %139390176
69NC_009274TATC31252601252721325 %50 %0 %25 %7 %139390176
70NC_009274CTTA31293231293331125 %50 %0 %25 %9 %139390176
71NC_009274GGAT31339091339201225 %25 %50 %0 %8 %139390176
72NC_009274AAAT31376121376231275 %25 %0 %0 %8 %139390176
73NC_009274AATA31376241376351275 %25 %0 %0 %8 %139390176
74NC_009274CATA31387051387161250 %25 %0 %25 %8 %139390176
75NC_009274AAAT31396151396251175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
76NC_009274TATT31431761431861125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
77NC_009274ATCA31458311458431350 %25 %0 %25 %7 %139390218
78NC_009274TGAT31459261459381325 %50 %25 %0 %7 %139390218
79NC_009274AAAG31476581476681175 %0 %25 %0 %9 %139390218
80NC_009274TATT31487531487641225 %75 %0 %0 %8 %139390218