ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lobularia maritima chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009274	TCT	4	692	702	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390133
2	NC_009274	CAG	4	956	967	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139390133
3	NC_009274	AAT	4	4914	4925	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009274	CTT	4	6615	6626	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009274	AAT	4	12135	12146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009274	ATT	4	12811	12821	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009274	GAT	4	14387	14399	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_009274	GTT	4	22235	22246	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139390143
9	NC_009274	TCA	4	24589	24599	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139390144
10	NC_009274	TAT	4	27242	27253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009274	TAC	4	27849	27859	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009274	AAT	4	28871	28882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_009274	TAA	4	30362	30374	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009274	TAT	4	30753	30763	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009274	ATG	4	37297	37307	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390151
16	NC_009274	GCA	4	39195	39206	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139390152
17	NC_009274	ATG	4	39521	39531	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390152
18	NC_009274	AGA	4	42684	42696	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	157011971
19	NC_009274	TAG	4	42784	42794	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011971
20	NC_009274	TAT	4	45158	45169	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009274	TTA	4	49474	49485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_009274	TAT	4	52870	52881	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009274	TTG	4	53101	53111	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_009274	AAT	4	55813	55824	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	139390161
25	NC_009274	TAT	4	57825	57836	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009274	CTT	4	69555	69566	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139390199
27	NC_009274	TCT	4	76359	76369	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390199
28	NC_009274	TAT	7	78842	78861	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	139390199
29	NC_009274	GAT	4	83080	83090	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390199
30	NC_009274	AGA	4	88229	88239	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139390199
31	NC_009274	AAT	4	93589	93599	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139390199
32	NC_009274	TTC	4	97407	97418	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139390176
33	NC_009274	TCT	4	109449	109459	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390176
34	NC_009274	TAT	4	117340	117350	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139390176
35	NC_009274	GCA	4	119690	119702	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	139390176
36	NC_009274	ATT	4	123137	123149	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139390176
37	NC_009274	TTG	4	124051	124062	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139390176
38	NC_009274	TCT	4	125686	125696	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390176
39	NC_009274	GAA	4	137641	137652	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390176
40	NC_009274	AGA	4	147280	147291	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390218
41	NC_009274	ATC	4	151969	151979	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139390220

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lobularia maritima chloroplast