ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Lepidium virginicum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009273TCTCT350475060140 %60 %0 %40 %7 %139388892
2NC_009273ATTTT326534265471420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_009273ATTTT329152291671620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_009273GAAAA441949419671980 %0 %20 %0 %10 %Non-Coding
5NC_009273AAATA344093441061480 %20 %0 %0 %7 %157011963
6NC_009273ACAAA345514455281580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
7NC_009273CTTTT34627846291140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
8NC_009273TAATA450388504061960 %40 %0 %0 %10 %Non-Coding
9NC_009273AATTT350587506011540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
10NC_009273TTTTA456557565751920 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
11NC_009273AAATC379726797391460 %20 %0 %20 %7 %139388957
12NC_009273ATATG386062860761540 %40 %20 %0 %6 %139388957
13NC_009273TCCGG39459994613150 %20 %40 %40 %6 %139388957
14NC_009273TTTCG39718897201140 %60 %20 %20 %7 %139388957
15NC_009273AATAA31175441175571480 %20 %0 %0 %7 %139388934
16NC_009273TGTTA31212411212551520 %60 %20 %0 %6 %139388934
17NC_009273ACCGG31441651441791520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
18NC_009273CATAC31453831453961440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding