ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lepidium virginicum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009273	TCT	4	601	611	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388890
2	NC_009273	CAG	4	865	876	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388890
3	NC_009273	TTC	4	6357	6367	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009273	AAT	4	12781	12792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009273	ATA	4	13442	13453	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009273	GAT	4	15006	15018	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139388899
7	NC_009273	GTT	4	22851	22862	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139388901
8	NC_009273	TCA	4	25205	25215	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388902
9	NC_009273	TTA	4	26910	26921	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_009273	TAC	4	28331	28342	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009273	TAT	4	28540	28551	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009273	TAA	6	31222	31240	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_009273	AAT	4	31692	31703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009273	TAT	4	31807	31817	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009273	GCA	4	34717	34728	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388906
16	NC_009273	ATA	5	35948	35963	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_009273	ATG	4	38374	38384	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388909
18	NC_009273	GCA	4	40272	40283	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388910
19	NC_009273	ATG	4	40598	40608	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388910
20	NC_009273	TAG	4	43888	43898	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011963
21	NC_009273	TAT	6	46260	46276	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_009273	TAT	4	49762	49773	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009273	TAT	4	50405	50416	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009273	TTA	4	51035	51046	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009273	TAT	4	54471	54482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009273	TTG	4	54702	54712	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009273	GAA	4	64627	64638	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_009273	ATA	7	64675	64696	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009273	CTT	4	66401	66412	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_009273	TAA	4	71030	71040	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139388957
31	NC_009273	TCT	4	78050	78060	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388957
32	NC_009273	TCA	4	81630	81640	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388957
33	NC_009273	GAT	4	84716	84726	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388957
34	NC_009273	AGA	4	89869	89879	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139388957
35	NC_009273	AAT	4	95196	95206	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139388957
36	NC_009273	TTC	4	99005	99016	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139388934
37	NC_009273	TCT	4	111149	111159	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388934
38	NC_009273	AAG	4	111751	111762	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139388934
39	NC_009273	ATT	4	113896	113906	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139388934
40	NC_009273	ATA	8	113961	113984	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	139388934
41	NC_009273	ACA	4	115361	115371	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	139388934
42	NC_009273	TAT	4	119410	119420	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139388934
43	NC_009273	TTC	4	124971	124982	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139388934
44	NC_009273	TTG	4	126104	126115	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139388934
45	NC_009273	TCT	4	127201	127212	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139388934
46	NC_009273	GAA	4	139763	139774	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139388934
47	NC_009273	AGA	4	149366	149377	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139388976
48	NC_009273	ATC	4	154053	154063	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388978

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lepidium virginicum chloroplast