ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Draba nemorosa chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009272	TCT	4	780	791	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389931
2	NC_009272	CAG	4	1042	1053	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389931
3	NC_009272	ATA	4	4755	4767	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_009272	TTC	4	5801	5811	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009272	TAT	4	9026	9036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_009272	AAT	6	12333	12350	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009272	ATT	5	13010	13024	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_009272	AAT	4	13026	13037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009272	GAT	4	14535	14547	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139389939
10	NC_009272	GTT	4	22407	22418	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389941
11	NC_009272	TCA	4	24761	24771	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389942
12	NC_009272	TAT	4	26089	26100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_009272	TAA	4	30607	30618	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009272	TAT	4	31284	31294	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009272	GGA	4	33373	33384	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	139389946
16	NC_009272	TAT	5	35311	35325	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_009272	GAT	4	37739	37749	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389949
18	NC_009272	GCA	4	39638	39649	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389950
19	NC_009272	ATG	4	39964	39974	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389950
20	NC_009272	AGA	4	43108	43120	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	157011970
21	NC_009272	AAT	4	43420	43431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157011970
22	NC_009272	TAT	5	45539	45553	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_009272	ATA	4	45685	45696	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009272	TAA	4	45813	45823	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009272	ATT	4	53623	53633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009272	TTG	4	53857	53867	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009272	TTA	4	65423	65434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_009272	ATA	4	68226	68236	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389997
29	NC_009272	TCT	4	76387	76397	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389997
30	NC_009272	ATT	7	78830	78849	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	139389997
31	NC_009272	ATC	4	80109	80119	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389997
32	NC_009272	AGA	4	88243	88253	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139389997
33	NC_009272	AAT	4	93589	93599	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389997
34	NC_009272	TTC	4	97393	97404	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389974
35	NC_009272	AAG	4	110174	110185	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389974
36	NC_009272	ATA	4	112398	112408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389974
37	NC_009272	ATT	4	113682	113692	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139389974
38	NC_009272	ACA	4	113733	113743	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	139389974
39	NC_009272	ATT	4	117733	117744	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139389974
40	NC_009272	TTC	5	118907	118921	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	139389974
41	NC_009272	GAA	4	138359	138370	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389974
42	NC_009272	AGA	4	147922	147933	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390014

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Draba nemorosa chloroplast