ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Draba nemorosa chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009272	A	19	295	313	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_009272	TACC	3	664	674	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	139389931
3	NC_009272	TCT	4	780	791	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389931
4	NC_009272	CAG	4	1042	1053	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389931
5	NC_009272	A	13	1861	1873	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009272	T	12	2392	2403	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	139389932
7	NC_009272	TTTA	3	3870	3881	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_009272	T	12	4120	4131	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009272	GAAAA	3	4605	4619	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_009272	ATGA	3	4731	4741	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009272	ATA	4	4755	4767	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_009272	AT	7	4801	4815	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_009272	CA	6	5731	5741	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_009272	TTC	4	5801	5811	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009272	T	21	6796	6816	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
16	NC_009272	T	12	6893	6904	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009272	TTCT	3	6977	6988	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	139389934
18	NC_009272	TA	6	7365	7376	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009272	TA	13	7454	7478	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009272	AT	6	7487	7497	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_009272	ATAA	3	7620	7631	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009272	T	12	8853	8864	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009272	AT	7	8973	8987	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_009272	TAT	4	9026	9036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009272	TTTA	3	9059	9070	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009272	TA	7	9160	9176	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_009272	TA	6	9194	9205	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_009272	T	16	9278	9293	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	139389935
29	NC_009272	GTTT	3	9406	9417	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	139389935
30	NC_009272	A	13	10842	10854	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_009272	AT	7	11490	11503	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	139389936
32	NC_009272	AAT	6	12333	12350	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009272	AAAT	3	12897	12908	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_009272	ATT	5	13010	13024	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_009272	AAT	4	13026	13037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009272	ATTT	3	14306	14318	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_009272	GAT	4	14535	14547	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139389939
38	NC_009272	T	13	17289	17301	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	139389940
39	NC_009272	TTCA	3	21415	21426	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	139389941
40	NC_009272	T	13	21809	21821	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	139389941
41	NC_009272	GTT	4	22407	22418	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389941
42	NC_009272	TTTA	3	24744	24754	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	139389942
43	NC_009272	TCA	4	24761	24771	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389942
44	NC_009272	T	12	25034	25045	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	139389942
45	NC_009272	TAT	4	26089	26100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_009272	A	12	26584	26595	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_009272	TC	6	27369	27380	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	139389943
48	NC_009272	CAAA	3	27644	27655	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009272	TTTA	3	28059	28069	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_009272	TATT	3	28299	28310	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009272	ATTTT	3	28670	28685	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_009272	GAAA	3	28973	28983	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_009272	AATA	3	29357	29367	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_009272	ATTT	3	29925	29936	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_009272	A	13	30094	30106	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_009272	AT	11	30439	30459	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_009272	TTTAC	3	30577	30590	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
58	NC_009272	TAA	4	30607	30618	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_009272	AATG	3	30751	30761	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_009272	TTTC	3	30800	30810	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_009272	AG	6	31034	31045	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_009272	TAT	4	31284	31294	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_009272	GAAA	3	33171	33182	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	139389946
64	NC_009272	GGA	4	33373	33384	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	139389946
65	NC_009272	AG	6	34346	34356	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_009272	TTAT	3	34376	34386	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_009272	ATTCAA	3	35032	35050	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
68	NC_009272	AT	7	35289	35302	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_009272	TAT	5	35311	35325	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_009272	AT	17	35322	35352	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_009272	TTAAT	3	35363	35377	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009272	AAAC	3	35769	35780	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_009272	GAT	4	37739	37749	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389949
74	NC_009272	GCA	4	39638	39649	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389950
75	NC_009272	TG	6	39675	39685	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	139389950
76	NC_009272	ATG	4	39964	39974	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389950
77	NC_009272	ATTT	3	40936	40947	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_009272	GAAAA	4	41315	41334	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
79	NC_009272	AT	6	41342	41353	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_009272	ATTT	3	41430	41441	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009272	TAAT	5	41944	41963	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	157011970
82	NC_009272	AAAT	3	42950	42960	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	157011970
83	NC_009272	AGA	4	43108	43120	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	157011970
84	NC_009272	AAT	4	43420	43431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157011970
85	NC_009272	GTAA	3	43455	43465	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	157011970
86	NC_009272	T	12	44132	44143	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009272	ACAAA	3	44789	44803	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
88	NC_009272	TAT	5	45539	45553	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_009272	ATA	4	45685	45696	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_009272	A	17	45725	45741	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_009272	AT	9	45795	45811	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_009272	TAA	4	45813	45823	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_009272	AAAT	3	45838	45849	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_009272	ATTT	3	46642	46653	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_009272	T	17	48896	48912	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_009272	ATTGG	3	49344	49358	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_009272	GATT	3	49453	49464	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_009272	A	13	49854	49866	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009272	AAATT	3	49877	49890	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_009272	A	13	50310	50322	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_009272	TA	6	51175	51186	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_009272	AT	6	53328	53341	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_009272	ATT	4	53623	53633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_009272	TTG	4	53857	53867	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009272	A	13	55511	55523	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_009272	TTACTT	3	55888	55904	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
107	NC_009272	TA	6	56183	56193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	139389959
108	NC_009272	T	12	56394	56405	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	139389959
109	NC_009272	CAAATT	3	57609	57626	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
110	NC_009272	TA	6	58030	58040	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_009272	AAAG	3	59809	59819	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	139389962
112	NC_009272	ATTT	3	60468	60478	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_009272	AT	6	60644	60654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	139389963
114	NC_009272	TA	9	62040	62056	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_009272	TTTATT	3	62109	62126	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_009272	CAGC	3	62896	62907	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	139389966
117	NC_009272	ATTT	5	63404	63423	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_009272	TAAA	3	63555	63567	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_009272	GAAAA	3	64044	64058	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_009272	AT	7	64740	64752	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_009272	AAAG	3	64990	65000	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_009272	T	14	65217	65230	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009272	TTA	4	65423	65434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_009272	ATAAAA	3	66410	66427	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
125	NC_009272	AT	7	67894	67907	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	139389997
126	NC_009272	ATA	4	68226	68236	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389997
127	NC_009272	T	13	68530	68542	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	139389997
128	NC_009272	TTGA	3	69336	69347	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	139389997
129	NC_009272	T	12	69531	69542	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	139389997
130	NC_009272	TGTC	3	69561	69571	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	139389997
131	NC_009272	AGAA	3	71605	71616	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	139389997
132	NC_009272	TAAACA	3	72238	72254	17	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	139389997
133	NC_009272	AGAT	3	72555	72566	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	139389997
134	NC_009272	GTCT	3	73102	73112	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	139389997
135	NC_009272	T	13	73346	73358	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	139389997
136	NC_009272	ATTAA	3	75316	75330	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	139389997
137	NC_009272	ATTA	5	75983	76003	21	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	139389997
138	NC_009272	T	16	76298	76313	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	139389997
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221	NC_009272	GAA	4	138359	138370	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389974
222	NC_009272	CATA	3	139423	139434	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	139389974
223	NC_009272	ACCGG	3	142756	142770	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
224	NC_009272	AT	6	143000	143011	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
225	NC_009272	CATAC	3	143976	143989	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
226	NC_009272	CTCCTT	3	144840	144857	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	139390014
227	NC_009272	ATCA	3	146521	146533	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	139390014
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229	NC_009272	AAAG	3	148300	148310	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	139390014
230	NC_009272	TATT	3	149371	149382	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	139390014

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Draba nemorosa chloroplast