ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Barbarea verna chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009269	TCT	4	698	708	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388074
2	NC_009269	CAG	4	962	973	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388074
3	NC_009269	ATA	4	4664	4676	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_009269	TTC	4	6534	6544	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009269	AAT	4	12933	12944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009269	ATA	4	13594	13605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009269	TTC	4	13723	13735	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_009269	GAT	4	15166	15178	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139388083
9	NC_009269	GTT	4	23015	23026	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139388085
10	NC_009269	TCA	4	25369	25379	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388086
11	NC_009269	TTA	4	27194	27205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009269	TAA	4	28202	28212	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_009269	CTA	4	31247	31259	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_009269	TAA	6	31509	31527	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_009269	AAT	4	31583	31594	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009269	TAT	4	32106	32116	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009269	GCA	4	35009	35020	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388090
18	NC_009269	ATG	4	38636	38646	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388093
19	NC_009269	GCA	4	40534	40545	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139388094
20	NC_009269	ATG	4	40860	40870	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388094
21	NC_009269	AGA	5	43972	43985	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	157011961
22	NC_009269	TAG	4	44071	44081	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011961
23	NC_009269	AAT	4	44285	44296	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	157011961
24	NC_009269	TAA	4	46407	46418	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009269	TAT	4	49942	49953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009269	TTA	4	51288	51299	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_009269	TAT	4	54716	54727	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_009269	TTG	4	54947	54957	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009269	TTA	4	59596	59606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_009269	CTT	4	65751	65762	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_009269	TCT	4	77390	77400	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388141
32	NC_009269	ATC	4	81053	81063	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388141
33	NC_009269	GAT	4	84123	84133	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139388141
34	NC_009269	AGA	4	89276	89286	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139388141
35	NC_009269	AAT	4	94609	94619	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139388141
36	NC_009269	TTC	4	98419	98430	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139388118
37	NC_009269	TTA	4	99026	99036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139388118
38	NC_009269	TCT	4	110691	110701	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388118
39	NC_009269	ATA	4	113578	113588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139388118
40	NC_009269	ACA	4	114906	114916	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	139388118
41	NC_009269	ATT	4	120274	120285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139388118
42	NC_009269	TTG	4	125724	125735	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139388118
43	NC_009269	TCT	4	127353	127363	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139388118
44	NC_009269	GAA	4	139538	139549	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139388118
45	NC_009269	AGA	4	149142	149153	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139388158
46	NC_009269	ATC	4	153835	153845	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139388160

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Barbarea verna chloroplast