ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Barbarea verna chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009269AATA31291391175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_009269TACC35845941125 %25 %0 %50 %9 %139388074
3NC_009269TCT4698708110 %66.67 %0 %33.33 %9 %139388074
4NC_009269CAG49629731233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %139388074
5NC_009269T1222692280120 %100 %0 %0 %0 %139388075
6NC_009269TTTA3374737581225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_009269AT6378537961250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_009269T1540834097150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_009269GAAAA3449845121580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
10NC_009269ATA4466446761366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_009269AT14469747222650 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_009269TTCA3503750481225 %50 %0 %25 %8 %139388076
13NC_009269TCTCT352135226140 %60 %0 %40 %7 %139388076
14NC_009269ATTC3560056101125 %50 %0 %25 %9 %139388076
15NC_009269TGTA3635463651225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
16NC_009269TA9639564121850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
17NC_009269CA6646564751150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
18NC_009269TTC465346544110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_009269TTCT368846895120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
20NC_009269T1975127530190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
21NC_009269T1276057616120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
22NC_009269TTCT376797690120 %75 %0 %25 %8 %139388078
23NC_009269TTTAT3801380261420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_009269AT6804180511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_009269TA7807480871450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
26NC_009269TA8812681421750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
27NC_009269TTATT3919792101420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_009269AT6961096211250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_009269TA6977597871350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_009269T1398729884130 %100 %0 %0 %7 %139388079
31NC_009269TTTC31217612187120 %75 %0 %25 %8 %139388080
32NC_009269T131279912811130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_009269AAT412933129441266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
34NC_009269AAAT313480134911275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_009269A13135801359213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_009269ATA413594136051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_009269AT613663136731150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_009269TTC41372313735130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
39NC_009269GAAA313951139611175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
40NC_009269C121476314774120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
41NC_009269ATTT314937149491325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
42NC_009269GAT415166151781333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %139388083
43NC_009269T131599516007130 %100 %0 %0 %0 %139388084
44NC_009269T131789217904130 %100 %0 %0 %7 %139388084
45NC_009269TTCA322023220341225 %50 %0 %25 %8 %139388085
46NC_009269GTT42301523026120 %66.67 %33.33 %0 %8 %139388085
47NC_009269TCA425369253791133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %139388086
48NC_009269T122564225653120 %100 %0 %0 %8 %139388086
49NC_009269TAAG326805268161250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
50NC_009269TTA427194272051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_009269AT927313273301850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
52NC_009269A12273442735512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_009269TC62814528156120 %50 %0 %50 %8 %139388087
54NC_009269TAA428202282121166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_009269TTTA328841288511125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_009269AATA329073290841275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
57NC_009269ATTTT329462294771620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
58NC_009269A15297792979315100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
59NC_009269T122984829859120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
60NC_009269A13301303014213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_009269GAAA330257302681275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
62NC_009269AAAAAG330806308231883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
63NC_009269AAGA330913309241275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
64NC_009269CTA431247312591333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
65NC_009269AT931283313001850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
66NC_009269TAA631509315271966.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
67NC_009269AAT431583315941266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_009269TAT432106321161133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
69NC_009269GAAA334114341251275 %0 %25 %0 %8 %139388090
70NC_009269GCA435009350201233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %139388090
71NC_009269AG635264352741150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
72NC_009269TTAT335294353041125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
73NC_009269AT636239362501250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_009269AAAC336677366871175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
75NC_009269ATG438636386461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %139388093
76NC_009269GCA440534405451233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %139388094
77NC_009269TG64057140581110 %50 %50 %0 %9 %139388094
78NC_009269ATG440860408701133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %139388094
79NC_009269T154197141985150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
80NC_009269TAGA342183421941250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
81NC_009269A14423864239914100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
82NC_009269TTAA542799428182050 %50 %0 %0 %10 %157011961
83NC_009269AGA543972439851466.67 %0 %33.33 %0 %7 %157011961
84NC_009269TAG444071440811133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %157011961
85NC_009269AAT444285442961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %157011961
86NC_009269GTAA344314443241150 %25 %25 %0 %9 %157011961
87NC_009269ACAAA345709457231580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
88NC_009269TAAA346159461701275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
89NC_009269CTTTT34626646280150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
90NC_009269TAA446407464181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_009269A18464404645718100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
92NC_009269TAT449942499531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_009269GATT350493505041225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
94NC_009269TTAA350526505371250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_009269ATATTA350584506001750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
96NC_009269AGAA351154511651275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
97NC_009269TTA451288512991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
98NC_009269ATTT351437514471125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_009269CTTTT35221352226140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
100NC_009269T165225352268160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
101NC_009269T155455354567150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
102NC_009269TAT454716547271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_009269TTG45494754957110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
104NC_009269TTTTAT356805568231916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
105NC_009269T135689456906130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
106NC_009269AATT356915569261250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_009269TTACTT356931569471716.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
108NC_009269TA657219572291150 %50 %0 %0 %9 %139388103
109NC_009269T125743057441120 %100 %0 %0 %8 %139388103
110NC_009269ATAA358671586811175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
111NC_009269AT659110591201150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_009269TTA459596596061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_009269T126036360374120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_009269AT661702617121150 %50 %0 %0 %9 %139388107
115NC_009269TA663147631571150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_009269AT1263165631862250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
117NC_009269T196324663264190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
118NC_009269TAAA463282632971675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
119NC_009269T146459764610140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
120NC_009269AAAAT465093651132180 %20 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_009269CTT46575165762120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
122NC_009269TA666018660281150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
123NC_009269AAAG366046660561175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
124NC_009269AAAT466918669331675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
125NC_009269AGAAA367494675071480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
126NC_009269T156961169625150 %100 %0 %0 %6 %139388141
127NC_009269TGTC37064970659110 %50 %25 %25 %9 %139388141
128NC_009269AT670790708001150 %50 %0 %0 %9 %139388141
129NC_009269GCTG37246872480130 %25 %50 %25 %7 %139388141
130NC_009269AGAA372639726501275 %0 %25 %0 %8 %139388141
131NC_009269CTTT37298172992120 %75 %0 %25 %8 %139388141
132NC_009269A25759597598325100 %0 %0 %0 %8 %139388141
133NC_009269ATTAA376991770041460 %40 %0 %0 %7 %139388141
134NC_009269T167730177316160 %100 %0 %0 %6 %139388141
135NC_009269TCT47739077400110 %66.67 %0 %33.33 %9 %139388141
136NC_009269CTTTA478673786911920 %60 %0 %20 %10 %139388141
137NC_009269TTCA379141791521225 %50 %0 %25 %8 %139388141
138NC_009269ATC481053810631133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %139388141
139NC_009269TTTC48160981624160 %75 %0 %25 %6 %139388141
140NC_009269T178184981865170 %100 %0 %0 %5 %139388141
141NC_009269CAAT382161821711150 %25 %0 %25 %9 %139388141
142NC_009269AATT382493825031150 %50 %0 %0 %9 %139388141
143NC_009269TTTC38319183201110 %75 %0 %25 %9 %139388141
144NC_009269GAT484123841331133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %139388141
145NC_009269ATATG385469854831540 %40 %20 %0 %6 %139388141
146NC_009269TTCT38722187231110 %75 %0 %25 %9 %139388141
147NC_009269CTTT38843888448110 %75 %0 %25 %9 %139388141
148NC_009269AGA489276892861166.67 %0 %33.33 %0 %9 %139388141
149NC_009269TGAT390296903081325 %50 %25 %0 %7 %139388141
150NC_009269AATA391143911551375 %25 %0 %0 %7 %139388141
151NC_009269GAAGGA391929919461850 %0 %50 %0 %5 %139388141
152NC_009269TCCGG39401794031150 %20 %40 %40 %6 %139388141
153NC_009269AAT494609946191166.67 %33.33 %0 %0 %9 %139388141
154NC_009269TTTCG39660296615140 %60 %20 %20 %7 %139388141
155NC_009269TTTGTT39702097038190 %83.33 %16.67 %0 %10 %139388141
156NC_009269TTC49841998430120 %66.67 %0 %33.33 %8 %139388118
157NC_009269TTA499026990361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %139388118
158NC_009269ATTAGT399067990831733.33 %50 %16.67 %0 %5 %139388118
159NC_009269T139942699438130 %100 %0 %0 %0 %139388118
160NC_009269ATCC31023651023761225 %25 %0 %50 %8 %139388118
161NC_009269CTAT31027601027711225 %50 %0 %25 %8 %139388118
162NC_009269GAGG31056121056231225 %0 %75 %0 %8 %139388118
163NC_009269AGGT31058241058351225 %25 %50 %0 %8 %139388118
164NC_009269TAAG31069441069541150 %25 %25 %0 %9 %139388118
165NC_009269AT71080171080301450 %50 %0 %0 %7 %139388118
166NC_009269GAAA31098811098921275 %0 %25 %0 %8 %139388118
167NC_009269A1210991810992912100 %0 %0 %0 %8 %139388118
168NC_009269TCT4110691110701110 %66.67 %0 %33.33 %9 %139388118
169NC_009269AAAC31108611108711175 %0 %0 %25 %9 %139388118
170NC_009269ATAG31119631119741250 %25 %25 %0 %0 %139388118
171NC_009269ATTT31121741121841125 %75 %0 %0 %9 %139388118
172NC_009269TA71122071122201450 %50 %0 %0 %7 %139388118
173NC_009269T14112392112405140 %100 %0 %0 %7 %139388118
174NC_009269AATT31134361134471250 %50 %0 %0 %0 %139388118
175NC_009269ATA41135781135881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %139388118
176NC_009269T13113748113760130 %100 %0 %0 %7 %139388118
177NC_009269TTAA31139641139761350 %50 %0 %0 %7 %139388118
178NC_009269TATT31142581142691225 %75 %0 %0 %8 %139388118
179NC_009269A1411457111458414100 %0 %0 %0 %0 %139388118
180NC_009269ACA41149061149161166.67 %0 %0 %33.33 %9 %139388118
181NC_009269A1811529211530918100 %0 %0 %0 %5 %139388118
182NC_009269AAATA31153131153261480 %20 %0 %0 %7 %139388118
183NC_009269AATAA31170821170961580 %20 %0 %0 %6 %139388118
184NC_009269AT61189161189261150 %50 %0 %0 %9 %139388118
185NC_009269TCTT3119578119589120 %75 %0 %25 %8 %139388118
186NC_009269ATT41202741202851233.33 %66.67 %0 %0 %8 %139388118
187NC_009269TA61211681211791250 %50 %0 %0 %8 %139388118
188NC_009269CTTT3123313123323110 %75 %0 %25 %9 %139388118
189NC_009269TA61236601236701150 %50 %0 %0 %9 %139388118
190NC_009269T12123923123934120 %100 %0 %0 %0 %139388118
191NC_009269T12124089124100120 %100 %0 %0 %8 %139388118
192NC_009269TA61241551241651150 %50 %0 %0 %9 %139388118
193NC_009269TCAA31242021242121150 %25 %0 %25 %9 %139388118
194NC_009269CTTT3124656124666110 %75 %0 %25 %9 %139388118
195NC_009269TTTG3125217125227110 %75 %25 %0 %9 %139388118
196NC_009269T13125610125622130 %100 %0 %0 %7 %139388118
197NC_009269T26125661125686260 %100 %0 %0 %7 %139388118
198NC_009269TTG4125724125735120 %66.67 %33.33 %0 %8 %139388118
199NC_009269T22126831126852220 %100 %0 %0 %0 %139388118
200NC_009269TATC31269181269301325 %50 %0 %25 %7 %139388118
201NC_009269TCT4127353127363110 %66.67 %0 %33.33 %9 %139388118
202NC_009269T15128041128055150 %100 %0 %0 %6 %139388118
203NC_009269AT61299421299531250 %50 %0 %0 %8 %139388118
204NC_009269CTTA31310141310241125 %50 %0 %25 %9 %139388118
205NC_009269GGAT31355921356031225 %25 %50 %0 %8 %139388118
206NC_009269A1513853013854415100 %0 %0 %0 %6 %139388118
207NC_009269ACTAAT31388851389011750 %33.33 %0 %16.67 %5 %139388118
208NC_009269AAAT31395091395201275 %25 %0 %0 %8 %139388118
209NC_009269AATA31395211395321275 %25 %0 %0 %8 %139388118
210NC_009269GAA41395381395491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %139388118
211NC_009269CATA31406021406131250 %25 %0 %25 %8 %139388118
212NC_009269ACCGG31439361439501520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
213NC_009269ATATA31441751441901660 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
214NC_009269CATAC31451561451691440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
215NC_009269CTCCTT3146021146038180 %50 %0 %50 %5 %139388158
216NC_009269ATCA31477021477141350 %25 %0 %25 %7 %139388158
217NC_009269TGAT31477971478091325 %50 %25 %0 %7 %139388158
218NC_009269AGA41491421491531266.67 %0 %33.33 %0 %8 %139388158
219NC_009269AAAG31495201495301175 %0 %25 %0 %9 %139388158
220NC_009269TATT31506091506201225 %75 %0 %0 %8 %139388158
221NC_009269ATC41538351538451133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %139388160