ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arabis hirsuta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009268	TCT	4	841	852	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389623
2	NC_009268	CAG	4	1103	1114	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389623
3	NC_009268	TTC	4	6591	6601	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009268	TAT	4	8309	8321	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_009268	TAT	4	9844	9855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009268	AAT	4	13142	13153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009268	ATT	5	13801	13815	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_009268	GTT	4	23147	23158	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389633
9	NC_009268	TCA	4	25501	25511	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389634
10	NC_009268	TTA	4	27195	27205	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_009268	TAT	4	28797	28808	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009268	AAT	4	29616	29627	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_009268	TAA	6	31144	31162	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_009268	TAT	4	31529	31539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009268	GGA	4	33619	33630	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	139389638
16	NC_009268	GAT	4	37969	37979	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389641
17	NC_009268	GCA	4	39868	39879	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389642
18	NC_009268	ATG	4	40194	40204	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389642
19	NC_009268	AGA	4	43363	43375	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	157011966
20	NC_009268	TAG	4	43464	43474	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011966
21	NC_009268	TAT	4	45860	45874	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_009268	AAT	6	46003	46023	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_009268	ATT	4	49917	49929	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_009268	TTA	4	50235	50246	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009268	TTG	4	53935	53945	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009268	ATA	4	66264	66274	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009268	TCT	4	76735	76745	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389689
28	NC_009268	TTG	6	78183	78200	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	139389689
29	NC_009268	ATC	4	80413	80423	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389689
30	NC_009268	AAT	4	86530	86542	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	139389689
31	NC_009268	AGA	4	88657	88667	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139389689
32	NC_009268	AAT	4	94013	94023	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389689
33	NC_009268	TTC	4	97826	97837	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389666
34	NC_009268	TTG	4	108089	108100	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389666
35	NC_009268	TTC	4	109989	110001	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	139389666
36	NC_009268	AAG	4	110592	110603	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389666
37	NC_009268	TTA	4	111899	111910	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139389666
38	NC_009268	TAT	5	111989	112004	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	139389666
39	NC_009268	ATA	4	112799	112809	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389666
40	NC_009268	ACA	4	114123	114133	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	139389666
41	NC_009268	TTG	4	124948	124959	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389666
42	NC_009268	TTA	4	126537	126548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139389666
43	NC_009268	TCT	4	126589	126599	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389666
44	NC_009268	CAA	4	128409	128420	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	139389666
45	NC_009268	GAA	4	138672	138683	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389666
46	NC_009268	AGA	4	148302	148313	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389706
47	NC_009268	ATT	4	149967	149979	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139389706

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arabis hirsuta chloroplast