ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olimarabidopsis pumila chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009267	TCT	4	4730	4740	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009267	TAA	4	4899	4910	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009267	TTC	4	6462	6472	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009267	AAT	4	12853	12864	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009267	ATA	4	13515	13526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009267	TTA	4	22516	22527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139389409
7	NC_009267	GTT	4	22965	22976	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389409
8	NC_009267	TCA	4	25319	25329	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389410
9	NC_009267	TCT	4	27788	27800	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_009267	TAT	4	28790	28801	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009267	TAA	6	31464	31482	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_009267	TAT	4	31845	31855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_009267	TTA	5	32138	32152	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_009267	ATG	4	38385	38395	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389417
15	NC_009267	GCA	4	40283	40294	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139389418
16	NC_009267	ATG	4	40609	40619	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389418
17	NC_009267	AGA	5	43757	43770	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009267	TAG	4	43856	43866	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009267	TAA	4	46313	46324	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009267	TAT	4	49665	49676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009267	ATT	6	50293	50310	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_009267	TTA	4	50937	50948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009267	TTA	4	54171	54183	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_009267	TTG	4	54592	54602	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009267	ATA	4	62833	62843	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009267	TAA	4	62981	62992	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_009267	ATA	7	64613	64633	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009267	CTT	4	66233	66244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009267	TCT	4	77853	77863	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389464
30	NC_009267	ATC	4	81511	81521	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389464
31	NC_009267	GAT	4	84564	84574	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139389464
32	NC_009267	AGA	4	89718	89728	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139389464
33	NC_009267	AAT	4	95066	95076	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139389464
34	NC_009267	TTC	4	98875	98886	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389442
35	NC_009267	TCT	4	111125	111135	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389442
36	NC_009267	AAG	4	111727	111738	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389442
37	NC_009267	TAT	4	119181	119191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139389442
38	NC_009267	AGA	4	125270	125280	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139389442
39	NC_009267	TTG	4	125928	125939	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139389442
40	NC_009267	TTC	4	127030	127041	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139389442
41	NC_009267	TCT	4	127569	127579	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139389442
42	NC_009267	GAA	4	139735	139746	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139389442
43	NC_009267	ATC	4	154047	154057	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139389482

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olimarabidopsis pumila chloroplast