ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aethionema cordifolium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009265	TCT	4	638	648	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390329
2	NC_009265	TAT	4	4601	4611	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009265	ATT	4	7123	7134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009265	TTA	4	7980	7990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009265	AAT	4	12746	12757	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009265	TAA	4	12868	12878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009265	ATA	4	13405	13416	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_009265	GAT	4	14973	14985	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	139390337
9	NC_009265	GTT	4	22783	22794	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139390339
10	NC_009265	TCA	4	25140	25150	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139390340
11	NC_009265	TTA	4	26972	26982	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009265	TAC	4	28400	28411	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009265	ATT	4	31260	31270	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_009265	TAT	4	31769	31779	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009265	TAA	4	35748	35759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009265	ATA	4	36852	36863	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009265	ATG	4	38333	38343	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390347
18	NC_009265	GCA	4	40231	40242	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	139390348
19	NC_009265	ATG	4	40557	40567	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390348
20	NC_009265	AGA	5	43536	43551	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	157011977
21	NC_009265	TAG	4	43639	43649	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	157011977
22	NC_009265	ATT	4	45395	45406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009265	TAT	4	46062	46073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009265	TTA	4	50491	50502	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009265	CTT	4	51420	51431	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009265	ATT	4	57959	57971	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_009265	TTA	4	58658	58668	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009265	TGT	4	64155	64165	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_009265	ATA	4	70947	70957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139390394
30	NC_009265	TCT	4	73061	73071	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390394
31	NC_009265	ATA	4	74750	74760	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139390394
32	NC_009265	TCT	4	77398	77408	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390394
33	NC_009265	ATT	8	79822	79845	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139390394
34	NC_009265	ATC	4	81072	81082	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139390394
35	NC_009265	GAT	4	84098	84108	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	139390394
36	NC_009265	AGA	4	89257	89267	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139390394
37	NC_009265	AAT	4	94618	94628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139390394
38	NC_009265	TTC	4	98435	98446	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139390372
39	NC_009265	ATT	4	110557	110569	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139390372
40	NC_009265	TAT	4	111205	111216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139390372
41	NC_009265	AAG	4	111262	111273	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390372
42	NC_009265	TAA	5	112466	112479	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	139390372
43	NC_009265	TAT	4	118528	118538	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139390372
44	NC_009265	ATT	4	118598	118608	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139390372
45	NC_009265	ATT	4	123430	123441	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139390372
46	NC_009265	TCT	4	126978	126988	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	139390372
47	NC_009265	GAA	4	139139	139150	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390372
48	NC_009265	AGA	4	148778	148789	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139390410
49	NC_009265	ATC	4	153477	153487	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139390412

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aethionema cordifolium chloroplast