ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phaseolus vulgaris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009259	AT	6	247	257	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	139387431
2	NC_009259	GATT	3	691	702	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009259	ATTT	3	764	775	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009259	TAAA	3	793	803	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009259	AGAAA	3	872	886	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	146216961
6	NC_009259	TAAA	3	987	998	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	146216961
7	NC_009259	AAAG	3	1036	1046	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	146216961
8	NC_009259	AAGA	3	1280	1290	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	146216961
9	NC_009259	TAGA	3	1742	1753	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	146216961
10	NC_009259	TTG	4	2491	2502	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139387433
11	NC_009259	ATG	4	2614	2625	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	139387433
12	NC_009259	TTTC	3	2879	2890	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_009259	TA	6	2925	2936	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009259	CTTT	3	3072	3083	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009259	AAGT	3	3952	3962	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	171259253
16	NC_009259	AT	7	4570	4582	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009259	AT	8	4587	4601	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_009259	AAG	4	5703	5714	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139387435
19	NC_009259	TTTC	3	5754	5764	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	139387435
20	NC_009259	AAAT	4	6925	6939	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_009259	TA	7	7451	7464	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_009259	AT	7	7747	7760	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_009259	AT	6	8009	8020	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009259	TGAA	3	8021	8031	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_009259	TCTT	3	9732	9743	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009259	AGAA	3	10039	10050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_009259	AAAG	3	12222	12232	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009259	AGAA	3	12241	12252	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009259	AAGA	3	13058	13068	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_009259	ATA	4	13234	13245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_009259	TAAA	3	13292	13302	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_009259	TAT	4	15208	15220	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_009259	TAGATA	3	15622	15639	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_009259	TAAA	3	15715	15726	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_009259	TA	6	16131	16142	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_009259	TTTC	3	16767	16778	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_009259	GAAA	3	17257	17269	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_009259	AT	6	17441	17451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_009259	AAAT	3	17789	17799	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_009259	TA	6	17952	17962	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_009259	AAT	4	18557	18569	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	139387442
42	NC_009259	AATTA	3	19177	19190	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_009259	AAAG	3	20638	20649	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	139387443
44	NC_009259	AT	7	20722	20734	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	139387443
45	NC_009259	TA	7	20740	20752	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	139387443
46	NC_009259	TTTA	3	20879	20889	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	139387443
47	NC_009259	T	14	21216	21229	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_009259	TAG	4	23485	23496	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	139387444
49	NC_009259	TCTT	3	23954	23965	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	139387444
50	NC_009259	AGA	4	26606	26616	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139387446
51	NC_009259	AT	7	27364	27376	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_009259	TAT	5	27435	27450	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_009259	TCTA	3	27456	27467	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_009259	AAGA	3	27514	27524	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_009259	TATT	3	27738	27750	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_009259	TATAAG	3	27773	27791	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_009259	AAT	4	28470	28481	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_009259	AT	7	28485	28497	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_009259	CT	6	28594	28604	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_009259	AAGC	3	29360	29370	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	139387448
61	NC_009259	TC	6	31331	31342	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
62	NC_009259	AT	6	31350	31361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_009259	TCTT	3	32193	32205	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
64	NC_009259	AAATG	4	32424	32442	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
65	NC_009259	A	13	32536	32548	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_009259	ATTTTT	3	32732	32748	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_009259	TTTTC	3	33481	33495	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
68	NC_009259	TTCA	3	33604	33615	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_009259	AAAG	3	33910	33920	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_009259	AAAG	3	34022	34033	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_009259	TGTT	3	34061	34072	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_009259	T	13	34505	34517	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009259	AT	7	34606	34619	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_009259	TCT	4	34687	34698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_009259	TAGG	3	38901	38911	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	139387452
76	NC_009259	AAC	4	39821	39832	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	139387453
77	NC_009259	TTTTC	3	40706	40720	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	139387453
78	NC_009259	GAA	4	41334	41346	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	139387453
79	NC_009259	TACACG	3	43978	43994	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	139387454
80	NC_009259	TAA	4	44419	44429	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139387454
81	NC_009259	ATTC	3	44593	44603	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	139387454
82	NC_009259	A	13	45008	45020	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	139387454
83	NC_009259	GAAA	3	47218	47230	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_009259	ATTC	3	47889	47901	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	139387455
85	NC_009259	AAT	4	48155	48166	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_009259	TACT	3	48321	48331	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	139387456
87	NC_009259	GTT	5	48806	48820	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	139387456
88	NC_009259	ATCT	3	49028	49039	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009259	ATAGAT	4	49040	49063	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_009259	ATTCA	3	49143	49158	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
91	NC_009259	GAAA	3	49758	49768	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_009259	TGT	4	52115	52126	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139387459
93	NC_009259	TA	6	53509	53519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_009259	AATA	3	53772	53784	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_009259	GAATA	3	53837	53851	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_009259	AAGA	3	53927	53937	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_009259	CTTTT	3	54155	54168	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
98	NC_009259	TAAA	3	54621	54631	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_009259	AAAT	3	54770	54781	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_009259	ATTT	3	54876	54887	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_009259	TA	6	54898	54909	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_009259	A	13	55207	55219	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_009259	ATAA	3	55228	55238	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_009259	AT	6	55795	55805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_009259	ATT	4	55837	55847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_009259	AAAT	3	55850	55860	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_009259	CTTAT	3	56041	56055	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
108	NC_009259	AAAG	3	56170	56180	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	139387461
109	NC_009259	TAA	4	56336	56346	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_009259	T	12	56359	56370	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009259	TA	6	56562	56572	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_009259	CTAT	3	56617	56628	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009259	A	15	57611	57625	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_009259	ATTT	3	57875	57887	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_009259	TAT	4	59018	59028	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139387462
116	NC_009259	AAAT	3	59350	59360	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_009259	TAA	4	59381	59391	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_009259	AT	6	59434	59444	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_009259	AAAG	3	59838	59849	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_009259	TAA	4	59898	59909	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_009259	ATAAA	3	60214	60227	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	139387464
122	NC_009259	TTCT	3	60819	60829	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_009259	AT	6	62906	62918	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_009259	A	13	63140	63152	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_009259	AT	6	63554	63564	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_009259	TTTC	3	64331	64341	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_009259	TAA	4	64433	64444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_009259	TTG	4	64589	64600	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_009259	AATAA	3	64642	64656	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
130	NC_009259	AT	9	65651	65669	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_009259	TAAA	3	65958	65968	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_009259	AAAG	3	66240	66250	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_009259	AAAAAT	3	67193	67211	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	139387474
134	NC_009259	A	18	68012	68029	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_009259	TA	7	68781	68794	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	146216964
136	NC_009259	CTG	4	69026	69037	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	146216964
137	NC_009259	AAAG	3	69493	69503	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	146216964
138	NC_009259	TAAA	3	69542	69552	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	146216964
139	NC_009259	CTTT	4	69568	69582	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	146216964
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145	NC_009259	TAAA	3	73515	73526	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	146216964
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228	NC_009259	A	20	139932	139951	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
229	NC_009259	T	12	140131	140142	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	146216970
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232	NC_009259	AAAG	3	144333	144343	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	146216970
233	NC_009259	ATC	4	147483	147493	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
234	NC_009259	ATC	4	148850	148860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139387506
235	NC_009259	GAA	5	149316	149330	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	139387506
236	NC_009259	AAT	5	149838	149851	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
237	NC_009259	AATTC	3	149867	149880	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phaseolus vulgaris chloroplast