ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phaseolus vulgaris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009259	TTG	4	2491	2502	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139387433
2	NC_009259	ATG	4	2614	2625	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	139387433
3	NC_009259	AAG	4	5703	5714	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139387435
4	NC_009259	ATA	4	13234	13245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009259	TAT	4	15208	15220	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_009259	AAT	4	18557	18569	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	139387442
7	NC_009259	TAG	4	23485	23496	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	139387444
8	NC_009259	AGA	4	26606	26616	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	139387446
9	NC_009259	TAT	5	27435	27450	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_009259	AAT	4	28470	28481	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009259	TCT	4	34687	34698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009259	AAC	4	39821	39832	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	139387453
13	NC_009259	GAA	4	41334	41346	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	139387453
14	NC_009259	TAA	4	44419	44429	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	139387454
15	NC_009259	AAT	4	48155	48166	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009259	GTT	5	48806	48820	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	139387456
17	NC_009259	TGT	4	52115	52126	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	139387459
18	NC_009259	ATT	4	55837	55847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009259	TAA	4	56336	56346	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009259	TAT	4	59018	59028	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139387462
21	NC_009259	TAA	4	59381	59391	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_009259	TAA	4	59898	59909	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009259	TAA	4	64433	64444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_009259	TTG	4	64589	64600	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_009259	CTG	4	69026	69037	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	146216964
26	NC_009259	TAT	5	80262	80277	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	146216964
27	NC_009259	ACG	4	80738	80749	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	146216964
28	NC_009259	CTT	4	80781	80792	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	146216964
29	NC_009259	GAT	4	81249	81259	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	146216964
30	NC_009259	GAT	4	82616	82626	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	146216964
31	NC_009259	AGA	4	95294	95305	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139387503
32	NC_009259	TTA	4	96258	96269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	139387503
33	NC_009259	AAG	4	107668	107679	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	139387503
34	NC_009259	ATT	4	108656	108668	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139387503
35	NC_009259	TAT	4	108794	108807	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139387503
36	NC_009259	ATT	4	109277	109287	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	139387503
37	NC_009259	TCT	4	130550	130561	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139387503
38	NC_009259	ATT	5	133119	133132	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	139387503
39	NC_009259	TAA	4	133840	133851	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	139387503
40	NC_009259	TCT	4	134804	134815	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	139387503
41	NC_009259	ACC	4	142701	142711	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	146216970
42	NC_009259	ATC	4	147483	147493	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_009259	ATC	4	148850	148860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	139387506
44	NC_009259	GAA	5	149316	149330	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	139387506
45	NC_009259	AAT	5	149838	149851	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phaseolus vulgaris chloroplast