ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Metaseiulus occidentalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009093	TTA	4	1533	1544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	129566156
2	NC_009093	TAA	4	3729	3739	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009093	ATA	4	4664	4675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566159
4	NC_009093	TAT	4	4937	4949	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	129566159
5	NC_009093	ATA	4	5153	5164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566159
6	NC_009093	TTG	4	5420	5431	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	129566159
7	NC_009093	CTT	4	5927	5937	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	129566160
8	NC_009093	GAG	4	6199	6210	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	129566160
9	NC_009093	CTA	4	7277	7287	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	129566161
10	NC_009093	ATA	4	9041	9051	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
11	NC_009093	ATA	4	9112	9124	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566162
12	NC_009093	ATA	4	9133	9143	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
13	NC_009093	ATA	4	9172	9182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
14	NC_009093	TAC	4	9314	9325	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	129566163
15	NC_009093	ATT	4	9500	9511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009093	TAA	4	11304	11316	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009093	AAT	4	11334	11344	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009093	ATA	4	12623	12633	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009093	TAA	7	12639	12658	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_009093	TTA	4	12761	12773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_009093	TAA	5	13526	13540	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	129566164
22	NC_009093	AAT	5	14330	14343	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566164
23	NC_009093	TAT	4	14481	14491	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_009093	TTA	4	16573	16584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	129566167
25	NC_009093	TAA	4	18769	18779	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009093	ATA	4	19704	19715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566170
27	NC_009093	TAT	4	19977	19989	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	129566170
28	NC_009093	ATA	4	20193	20204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566170
29	NC_009093	TTG	4	20460	20471	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	129566170
30	NC_009093	CTT	4	20967	20977	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	129566171
31	NC_009093	GAG	4	21239	21250	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	129566171
32	NC_009093	CTA	4	22317	22327	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	129566172
33	NC_009093	ATA	4	24081	24091	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
34	NC_009093	ATA	4	24152	24164	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566173
35	NC_009093	ATA	4	24173	24183	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
36	NC_009093	ATA	4	24212	24222	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
37	NC_009093	TAC	4	24354	24365	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	129566174
38	NC_009093	ATT	4	24540	24551	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Metaseiulus occidentalis mitochondrion