ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Metaseiulus occidentalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009093	ATTT	3	952	962	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	129566154
2	NC_009093	TTA	4	1533	1544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	129566156
3	NC_009093	TGTA	3	2202	2213	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	129566157
4	NC_009093	AAAAAT	3	2255	2271	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	129566157
5	NC_009093	TAAA	3	2403	2414	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566157
6	NC_009093	ACTT	3	2654	2664	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	129566157
7	NC_009093	AATA	4	2973	2988	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	129566157
8	NC_009093	ATAA	5	3107	3125	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	129566157
9	NC_009093	A	15	3172	3186	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	129566157
10	NC_009093	TAAAAT	3	3685	3703	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_009093	TAA	4	3729	3739	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009093	A	13	3887	3899	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	129566158
13	NC_009093	CT	7	3972	3985	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	129566158
14	NC_009093	ATA	4	4664	4675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566159
15	NC_009093	TAT	4	4937	4949	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	129566159
16	NC_009093	ATA	4	5153	5164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566159
17	NC_009093	TTG	4	5420	5431	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	129566159
18	NC_009093	TTAA	3	5471	5482	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	129566159
19	NC_009093	AAAT	3	5505	5516	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_009093	CTT	4	5927	5937	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	129566160
21	NC_009093	GAG	4	6199	6210	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	129566160
22	NC_009093	CTA	4	7277	7287	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	129566161
23	NC_009093	TAAA	3	8116	8127	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566162
24	NC_009093	ATAAA	3	8245	8260	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	129566162
25	NC_009093	CAAT	3	8442	8452	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	129566162
26	NC_009093	TAAA	3	8692	8703	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566162
27	NC_009093	AATA	3	8798	8809	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566162
28	NC_009093	AACA	3	8947	8958	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	129566162
29	NC_009093	TAAA	3	9018	9029	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	129566162
30	NC_009093	ATA	4	9041	9051	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
31	NC_009093	ATA	4	9112	9124	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566162
32	NC_009093	ATA	4	9133	9143	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
33	NC_009093	ATA	4	9172	9182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566162
34	NC_009093	TAC	4	9314	9325	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	129566163
35	NC_009093	A	12	9439	9450	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	129566163
36	NC_009093	ATT	4	9500	9511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_009093	TAAT	3	9815	9826	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_009093	CAAA	3	10205	10216	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_009093	AT	12	10236	10258	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_009093	AAAC	3	10331	10342	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_009093	TAAT	3	10881	10892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_009093	TAAA	3	11132	11142	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_009093	TAA	4	11304	11316	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_009093	AAT	4	11334	11344	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_009093	AAAAC	3	12190	12204	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
46	NC_009093	TAAAA	3	12494	12508	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009093	ATA	4	12623	12633	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_009093	TAA	7	12639	12658	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_009093	TTA	4	12761	12773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_009093	TATT	3	12882	12892	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009093	TAAAAA	3	12894	12911	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_009093	AT	6	13419	13430	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	129566164
53	NC_009093	TAAA	3	13493	13504	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566164
54	NC_009093	TAA	5	13526	13540	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	129566164
55	NC_009093	ATAA	3	13728	13739	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	129566164
56	NC_009093	AAAAC	3	14102	14115	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	129566164
57	NC_009093	A	12	14242	14253	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	129566164
58	NC_009093	TAAA	3	14284	14295	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566164
59	NC_009093	AAT	5	14330	14343	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566164
60	NC_009093	TAT	4	14481	14491	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_009093	AATT	3	14594	14604	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_009093	TAAT	3	14934	14945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_009093	ATTT	3	15992	16002	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	129566165
64	NC_009093	TTA	4	16573	16584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	129566167
65	NC_009093	TGTA	3	17242	17253	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	129566168
66	NC_009093	AAAAAT	3	17295	17311	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	129566168
67	NC_009093	TAAA	3	17443	17454	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566168
68	NC_009093	ACTT	3	17694	17704	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	129566168
69	NC_009093	AATA	4	18013	18028	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	129566168
70	NC_009093	ATAA	5	18147	18165	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	129566168
71	NC_009093	A	15	18212	18226	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	129566168
72	NC_009093	TAAAAT	3	18725	18743	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_009093	TAA	4	18769	18779	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_009093	A	13	18927	18939	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	129566169
75	NC_009093	CT	7	19012	19025	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	129566169
76	NC_009093	ATA	4	19704	19715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566170
77	NC_009093	TAT	4	19977	19989	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	129566170
78	NC_009093	ATA	4	20193	20204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	129566170
79	NC_009093	TTG	4	20460	20471	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	129566170
80	NC_009093	TTAA	3	20511	20522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	129566170
81	NC_009093	AAAT	3	20545	20556	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_009093	CTT	4	20967	20977	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	129566171
83	NC_009093	GAG	4	21239	21250	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	129566171
84	NC_009093	CTA	4	22317	22327	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	129566172
85	NC_009093	TAAA	3	23156	23167	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566173
86	NC_009093	ATAAA	3	23285	23300	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	129566173
87	NC_009093	CAAT	3	23482	23492	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	129566173
88	NC_009093	TAAA	3	23732	23743	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566173
89	NC_009093	AATA	3	23838	23849	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	129566173
90	NC_009093	AACA	3	23987	23998	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	129566173
91	NC_009093	TAAA	3	24058	24069	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	129566173
92	NC_009093	ATA	4	24081	24091	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
93	NC_009093	ATA	4	24152	24164	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	129566173
94	NC_009093	ATA	4	24173	24183	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
95	NC_009093	ATA	4	24212	24222	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	129566173
96	NC_009093	TAC	4	24354	24365	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	129566174
97	NC_009093	A	12	24479	24490	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	129566174
98	NC_009093	ATT	4	24540	24551	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_009093	TAAT	3	24855	24866	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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