ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Placozoan sp. BZ49 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008833	C	12	128	139	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008833	GTTT	3	1335	1346	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	124359011
3	NC_008833	ATT	4	3411	3422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254032050
4	NC_008833	TTA	4	3441	3451	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254032050
5	NC_008833	G	12	4487	4498	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008833	GC	6	4509	4520	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008833	AAAG	3	4542	4552	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008833	AGG	4	4736	4747	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008833	TCTTTT	3	6153	6170	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	254032053
10	NC_008833	TTA	4	6204	6214	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254032053
11	NC_008833	TATT	3	6632	6643	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	254032053
12	NC_008833	AGGGG	3	7329	7343	15	20 %	0 %	80 %	0 %	6 %	254032053
13	NC_008833	T	12	8115	8126	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	254032053
14	NC_008833	AT	7	8730	8742	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	254032053
15	NC_008833	T	12	9348	9359	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	254032053
16	NC_008833	TACA	3	10236	10246	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	254032053
17	NC_008833	TCCC	3	11292	11303	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	254032053
18	NC_008833	TTG	4	12218	12229	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	254032053
19	NC_008833	C	12	12610	12621	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	254032053
20	NC_008833	AGA	4	12639	12649	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	254032053
21	NC_008833	ATT	4	14478	14489	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254032053
22	NC_008833	AGAA	3	14730	14741	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	254032053
23	NC_008833	TAA	4	15014	15025	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	254032053
24	NC_008833	G	13	15447	15459	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	254032053
25	NC_008833	AT	6	15651	15662	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	254032053
26	NC_008833	TGAG	3	16058	16069	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	254032053
27	NC_008833	G	12	16243	16254	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	254032053
28	NC_008833	CTT	4	17076	17087	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	254032053
29	NC_008833	TA	6	17314	17327	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	254032053
30	NC_008833	TTA	4	17328	17339	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254032053
31	NC_008833	TAT	4	17338	17348	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254032053
32	NC_008833	CTAA	3	18028	18038	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	254032053
33	NC_008833	G	15	18045	18059	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	254032053
34	NC_008833	G	13	18792	18804	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	254032053
35	NC_008833	GGGA	3	19775	19786	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	254032053
36	NC_008833	GGGC	3	20276	20286	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	254032053
37	NC_008833	ACTA	3	22415	22425	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	254032053
38	NC_008833	TAT	4	22466	22477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254032053
39	NC_008833	TA	6	22706	22716	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	254032053
40	NC_008833	ATA	4	22879	22890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	254032053
41	NC_008833	AAAT	3	23213	23223	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	254032053
42	NC_008833	ATA	5	24222	24236	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	254032053
43	NC_008833	AAAT	3	24254	24266	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	254032053
44	NC_008833	GGAA	3	25133	25144	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	254032053
45	NC_008833	TAAA	3	25194	25204	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	254032053
46	NC_008833	TAAA	4	25930	25944	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	254032053
47	NC_008833	CAT	4	26896	26907	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	254032053
48	NC_008833	GAGCC	3	26981	26994	14	20 %	0 %	40 %	40 %	7 %	254032053
49	NC_008833	TTTA	3	27821	27831	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	254032053
50	NC_008833	CTTTT	3	28260	28273	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	254032053
51	NC_008833	CCCG	3	28836	28847	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	254032053
52	NC_008833	TATT	3	28918	28929	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	254032053
53	NC_008833	G	12	29095	29106	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	254032053
54	NC_008833	ATA	4	29706	29717	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	254032053
55	NC_008833	A	14	30199	30212	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	254032053
56	NC_008833	ATA	5	30607	30620	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	254032053
57	NC_008833	TCCC	3	31975	31986	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	254032053
58	NC_008833	ATGC	3	32465	32476	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	254032053
59	NC_008833	AATA	3	32588	32599	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	254032053
60	NC_008833	GC	7	32792	32804	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	254032053
61	NC_008833	TAA	4	33433	33444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	254032053
62	NC_008833	C	14	33985	33998	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	254032053
63	NC_008833	CTA	4	34803	34814	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	254032053
64	NC_008833	AAT	6	35292	35309	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	254032053
65	NC_008833	TCTT	3	35603	35615	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	254032053
66	NC_008833	GAGCC	4	35900	35919	20	20 %	0 %	40 %	40 %	0 %	254032053
67	NC_008833	TCCC	3	36388	36398	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
68	NC_008833	G	12	36560	36571	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Placozoan sp. BZ49 mitochondrion