ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chlorokybus atmophyticus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008822TAT47928031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %124112128
2NC_008822TAA4137813881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_008822CTA4344034511233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %124112081
4NC_008822TCT482438253110 %66.67 %0 %33.33 %9 %124112079
5NC_008822ATA415535155451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_008822AAC419251192621266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_008822TAA419477194871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_008822TTA420377203871133.33 %66.67 %0 %0 %9 %124112107
9NC_008822TTG42213422145120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
10NC_008822AAT422509225191166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_008822GCA423101231121233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
12NC_008822GAA423413234251366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
13NC_008822CTT42722327233110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
14NC_008822TTC43350033511120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
15NC_008822TAA433745337551166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_008822AAG436025360351166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
17NC_008822CTT43874238753120 %66.67 %0 %33.33 %8 %124112040
18NC_008822TAA439220392311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_008822TTC44102441035120 %66.67 %0 %33.33 %8 %124112042
20NC_008822ATA441142411531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %124112042
21NC_008822TTA448281482911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %124112109
22NC_008822TCT54884448858150 %66.67 %0 %33.33 %6 %124112109
23NC_008822CTT44910049111120 %66.67 %0 %33.33 %8 %124112109
24NC_008822TAA562082620961566.67 %33.33 %0 %0 %6 %124112136
25NC_008822CTT46600266014130 %66.67 %0 %33.33 %7 %124112113
26NC_008822GTT46647766487110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
27NC_008822ATT467239672491133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_008822GCA468858688691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %124112068
29NC_008822ATA470482704941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %124112132
30NC_008822AGA472640726511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %124112067
31NC_008822GAA476393764041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %124112052
32NC_008822TTC47709677107120 %66.67 %0 %33.33 %8 %124112052
33NC_008822TAG477899779101233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
34NC_008822TCC47884978860120 %33.33 %0 %66.67 %8 %124112140
35NC_008822CTT47924579255110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
36NC_008822TAT484743847551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %124112058
37NC_008822TAT485778857881133.33 %66.67 %0 %0 %9 %124112090
38NC_008822CGA488549885591133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %124112116
39NC_008822CAA589045890581466.67 %0 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
40NC_008822TTC48910789117110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
41NC_008822ATA490588905991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_008822TGC4100555100566120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %124112046
43NC_008822GAA41006461006571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %124112046
44NC_008822TAG41039151039261233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %124112038
45NC_008822CTT4105433105445130 %66.67 %0 %33.33 %7 %124112145
46NC_008822TGA41113181113291233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
47NC_008822TTG4111551111562120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
48NC_008822TTA41163421163531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %124112146
49NC_008822GTT5118905118919150 %66.67 %33.33 %0 %6 %124112056
50NC_008822ATA41253591253701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_008822AAT41302321302421166.67 %33.33 %0 %0 %9 %124112063
52NC_008822TTA41304451304561233.33 %66.67 %0 %0 %8 %124112063
53NC_008822GTT4135746135757120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
54NC_008822TAA41366541366661366.67 %33.33 %0 %0 %7 %124112051
55NC_008822CTT4138928138939120 %66.67 %0 %33.33 %8 %124112048
56NC_008822TAA41450001450111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %124112149
57NC_008822ATA41454321454441366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
58NC_008822CAA41497911498021266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
59NC_008822TCA41500241500351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding