ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ranunculus macranthus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008796	GAAAA	3	212	225	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008796	AAGT	3	1059	1069	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	122893970
3	NC_008796	TAA	4	1674	1684	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008796	GAA	4	2062	2073	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	122893971
5	NC_008796	GAA	4	2877	2888	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	122893971
6	NC_008796	GTTT	3	3671	3682	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008796	TTA	4	3854	3865	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008796	ATTT	3	4125	4135	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008796	TTAT	3	4147	4158	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008796	ATTT	3	4390	4401	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_008796	AT	6	4452	4462	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008796	AGAT	3	4464	4475	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008796	GAT	4	6401	6413	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_008796	CTAA	3	6646	6657	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008796	TTTA	3	6895	6906	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008796	A	14	7588	7601	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_008796	TCCAC	3	7693	7707	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
18	NC_008796	ATTTT	3	8102	8115	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_008796	TAGA	3	8379	8389	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_008796	CA	6	9065	9075	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_008796	TAT	4	9431	9441	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008796	GATTT	3	9683	9696	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_008796	CTT	4	9781	9792	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	122893975
24	NC_008796	ACA	4	11019	11030	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	122893975
25	NC_008796	AAAT	3	11278	11289	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008796	AAGA	3	13012	13023	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008796	A	12	13025	13036	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008796	AT	6	14797	14807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	122893978
29	NC_008796	T	15	15910	15924	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008796	TTAA	3	15983	15993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008796	AAT	4	17197	17207	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	122893980
32	NC_008796	T	16	18036	18051	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	122893980
33	NC_008796	TTCA	3	22161	22172	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	122893981
34	NC_008796	CA	6	22762	22772	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	122893981
35	NC_008796	GTT	4	23171	23182	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	122893981
36	NC_008796	T	12	25792	25803	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	122893982
37	NC_008796	AAAG	3	26886	26897	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_008796	TTA	4	27291	27302	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_008796	ATT	4	28187	28198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_008796	AGA	5	29693	29706	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_008796	TTTC	3	30690	30701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_008796	ATGT	3	31276	31287	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_008796	AT	6	31485	31498	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_008796	CTAT	3	32135	32145	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_008796	GAAA	3	34341	34352	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	193735623
46	NC_008796	TTG	4	34746	34756	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	193735623
47	NC_008796	AG	6	35493	35503	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_008796	TC	6	36111	36121	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	122893987
49	NC_008796	AAAT	3	36250	36260	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008796	AT	6	36434	36444	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_008796	TCT	4	36627	36637	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_008796	A	14	36724	36737	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008796	TTA	4	37296	37307	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_008796	CAC	4	40355	40366	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	122893990
55	NC_008796	GCA	4	40675	40686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	122893990
56	NC_008796	ATTA	3	42270	42280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_008796	TAA	4	42287	42301	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_008796	AG	6	42305	42316	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008796	AATTAT	3	42528	42546	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_008796	ATA	4	43809	43820	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	122893991
61	NC_008796	ATAA	3	44410	44421	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	122893991
62	NC_008796	GTA	4	44787	44797	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_008796	ATTT	3	44968	44979	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_008796	CAAAT	3	45625	45639	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008796	AATT	3	45664	45676	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_008796	TTTG	3	45849	45860	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_008796	TGAT	3	45943	45954	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	122893992
68	NC_008796	ATA	4	47020	47030	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_008796	ATTA	3	47046	47056	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_008796	AT	6	47096	47107	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_008796	TTGA	3	47686	47698	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_008796	T	12	47971	47982	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_008796	TTTC	3	49033	49043	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_008796	AT	7	49163	49178	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_008796	CTTT	3	49208	49218	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_008796	GTTT	3	51178	51188	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_008796	ATTT	3	51445	51456	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_008796	AATT	3	51508	51519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_008796	T	18	51548	51565	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_008796	TGA	4	51664	51674	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_008796	TATT	3	51698	51709	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_008796	AACA	3	51763	51775	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
83	NC_008796	TGTA	3	52013	52024	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008796	TAT	4	55401	55413	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_008796	ACA	4	55588	55599	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_008796	GTTA	3	57905	57915	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_008796	ATT	4	59739	59751	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_008796	TA	7	59762	59774	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_008796	AT	6	59822	59832	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_008796	TAT	4	60155	60166	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_008796	CAAA	3	60330	60341	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	122894000
92	NC_008796	AT	6	60580	60591	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_008796	GAAA	3	62897	62909	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	122894003
94	NC_008796	TTTA	3	63045	63055	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	122894003
95	NC_008796	ATTA	3	63603	63613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_008796	TAA	6	63644	63661	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_008796	ACCC	3	64739	64750	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
98	NC_008796	TTTAAT	3	65108	65126	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
99	NC_008796	TAAA	3	65448	65459	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_008796	AAATAG	3	65461	65479	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_008796	TCT	4	65763	65774	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_008796	A	16	65787	65802	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_008796	AT	6	66901	66912	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_008796	TA	6	66916	66926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_008796	ATT	4	67060	67072	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_008796	TTA	4	67492	67503	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_008796	TCTAAT	3	67884	67900	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
108	NC_008796	TTTC	4	68975	68990	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
109	NC_008796	TAT	4	70873	70885	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	122894014
110	NC_008796	AATT	3	71571	71582	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	122894014
111	NC_008796	TATTCT	3	74833	74851	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	122894014
112	NC_008796	TCT	4	78440	78451	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	122894014
113	NC_008796	ATTA	3	80176	80187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	122894014
114	NC_008796	T	15	81350	81364	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	122894014
115	NC_008796	TTCTT	3	81462	81475	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	122894014
116	NC_008796	AT	12	81978	82001	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	122894014
117	NC_008796	AT	6	82019	82029	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	122894014
118	NC_008796	AT	6	82069	82079	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	122894014
119	NC_008796	TAT	5	82095	82108	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	122894014
120	NC_008796	TTCT	3	82602	82613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	122894014
121	NC_008796	T	12	82697	82708	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	122894014
122	NC_008796	TATTGA	3	82985	83001	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	122894014
123	NC_008796	CAAT	3	83159	83169	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	122894014
124	NC_008796	AT	6	83510	83520	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	122894014
125	NC_008796	TTTA	3	83624	83635	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	122894014
126	NC_008796	GAT	4	86601	86611	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	122894014
127	NC_008796	TTCT	3	88296	88306	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	122894014
128	NC_008796	ATTT	4	88578	88593	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	122894014
129	NC_008796	CTTT	3	89456	89466	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	122894014
130	NC_008796	GAT	4	89611	89622	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	122894014
131	NC_008796	TCT	4	90732	90744	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	122894014
132	NC_008796	TGAT	3	91308	91320	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	122894014
133	NC_008796	TGA	4	91359	91370	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	122894014
134	NC_008796	AATA	3	92209	92221	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	122894014
135	NC_008796	GGA	4	93001	93012	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	122894014
136	NC_008796	TCT	4	95953	95963	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	122894014
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ranunculus macranthus chloroplast