ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cydistomyia duplonotata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008756	ATT	4	63	73	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008756	ATTT	3	497	508	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	120944078
3	NC_008756	AATT	3	585	595	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	120944078
4	NC_008756	ATT	5	667	681	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	120944078
5	NC_008756	ACATT	3	1060	1073	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	120944078
6	NC_008756	TTAA	3	1247	1259	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_008756	TTA	4	1375	1386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008756	TAG	4	1781	1791	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	120944079
9	NC_008756	TAT	5	2017	2031	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	120944079
10	NC_008756	AGG	4	2108	2119	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	120944079
11	NC_008756	TAT	6	2836	2854	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	120944079
12	NC_008756	ATT	4	3295	3305	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	120944080
13	NC_008756	ATT	4	3851	3862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008756	ATT	5	3899	3913	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	120944081
15	NC_008756	TTTAAC	3	4327	4344	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	120944082
16	NC_008756	ATT	4	5545	5555	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008756	TTCA	3	5571	5581	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	120944084
18	NC_008756	TTA	4	5618	5628	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	120944084
19	NC_008756	AAT	4	5793	5804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	120944084
20	NC_008756	TAT	4	5850	5861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	120944084
21	NC_008756	ATTTAT	3	6175	6192	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_008756	ATT	4	6404	6414	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	120944085
23	NC_008756	AATT	3	6740	6751	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	120944085
24	NC_008756	TTA	4	7210	7221	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	120944085
25	NC_008756	TAA	4	7319	7330	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	120944085
26	NC_008756	TAA	4	7349	7360	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	120944085
27	NC_008756	AAG	4	7459	7470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	120944085
28	NC_008756	TAA	4	7753	7765	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	120944085
29	NC_008756	AAAT	3	8053	8064	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	120944085
30	NC_008756	TCTAAT	3	8719	8736	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	120944086
31	NC_008756	AAAT	3	9043	9053	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	120944086
32	NC_008756	AAAAT	3	9132	9145	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	120944086
33	NC_008756	ATA	5	9183	9197	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	120944086
34	NC_008756	AATT	3	9216	9228	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	120944086
35	NC_008756	TAA	5	9363	9378	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	120944086
36	NC_008756	TAAA	4	9618	9633	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	120944087
37	NC_008756	AAT	4	9634	9645	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	120944087
38	NC_008756	TATAA	3	9720	9733	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	120944087
39	NC_008756	AATA	3	9749	9760	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	120944087
40	NC_008756	GAAA	3	9839	9849	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_008756	TTAT	4	10192	10207	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	120944088
42	NC_008756	TAAT	3	10425	10436	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	120944088
43	NC_008756	ATTT	3	11024	11034	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	120944089
44	NC_008756	TAT	4	11133	11143	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	120944089
45	NC_008756	GTTATT	3	11425	11441	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	120944089
46	NC_008756	TAAAA	3	12264	12277	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	170675700
47	NC_008756	TAA	4	12551	12563	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	170675700
48	NC_008756	TAT	4	13111	13122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_008756	TAAA	3	13134	13144	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008756	ATT	4	13368	13380	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_008756	TTA	4	13405	13416	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_008756	ATT	4	13541	13553	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008756	TAT	4	13593	13604	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_008756	ATT	5	13716	13731	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_008756	ATT	4	14334	14345	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_008756	ACT	4	14482	14493	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008756	ATT	4	14566	14576	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008756	AATA	3	14769	14780	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008756	TAAT	3	14877	14892	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_008756	TTAA	4	14980	14995	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_008756	ATTA	4	15039	15053	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_008756	TTAA	4	15055	15070	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_008756	ATAA	5	15105	15125	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_008756	ATT	4	15263	15274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_008756	TAA	4	15350	15360	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_008756	TTTA	3	15441	15452	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_008756	ATT	4	15454	15465	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_008756	T	19	15510	15528	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008756	TA	6	15565	15576	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_008756	TA	7	15638	15650	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_008756	ATT	4	15667	15677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_008756	AT	6	15710	15720	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_008756	AT	8	15723	15737	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_008756	TA	7	15751	15764	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_008756	AT	8	15781	15796	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_008756	AT	6	15825	15835	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_008756	TA	6	15844	15854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_008756	TAT	5	15876	15891	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_008756	AT	6	15886	15898	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_008756	TAT	4	16140	16152	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cydistomyia duplonotata mitochondrion