ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Romanomermis iyengari mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008693	TAA	4	257	268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119655303
2	NC_008693	TAA	4	697	707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119655304
3	NC_008693	ATA	5	926	941	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	119655304
4	NC_008693	AAT	4	1053	1064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008693	TAT	4	1062	1073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008693	AATTA	3	1294	1308	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_008693	ATTT	3	1503	1514	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008693	TTAAA	4	1748	1766	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_008693	TTTTA	3	2349	2362	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	119655305
10	NC_008693	T	13	2899	2911	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	119655305
11	NC_008693	ATTT	4	2966	2982	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	119655305
12	NC_008693	AAAAT	3	3663	3676	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_008693	TAT	4	3965	3975	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008693	TAATTT	3	4446	4463	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	119655306
15	NC_008693	TA	6	4795	4805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_008693	AAAAT	3	5380	5393	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_008693	TAT	4	5682	5692	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008693	ATTTTT	3	5925	5942	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	119655307
19	NC_008693	TAATTT	3	6163	6180	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	119655307
20	NC_008693	TAA	5	6419	6432	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_008693	TA	6	6691	6701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008693	AAAAT	3	7277	7290	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_008693	AATTT	4	7485	7504	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_008693	TTTA	3	7904	7914	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_008693	TAAAAA	3	7942	7959	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_008693	AATT	3	8103	8113	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008693	TAA	5	8204	8219	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_008693	AATT	3	8555	8565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	119655308
29	NC_008693	TAG	4	8604	8615	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	119655308
30	NC_008693	TTC	4	8720	8731	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	119655308
31	NC_008693	ACT	4	9157	9167	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	119655308
32	NC_008693	TAA	4	9252	9262	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119655308
33	NC_008693	TAAA	3	9429	9440	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	119655308
34	NC_008693	TAT	4	9743	9753	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008693	AATTT	4	9962	9981	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_008693	TTTA	3	10242	10252	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_008693	TAAAAA	3	10280	10297	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_008693	AATT	3	10441	10451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_008693	AT	8	10475	10491	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_008693	TTTAT	3	11418	11431	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_008693	TA	6	12005	12015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_008693	TAA	4	12248	12259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	119655310
43	NC_008693	TCT	4	12566	12577	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119655310
44	NC_008693	TAAA	3	12602	12614	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	119655310
45	NC_008693	TAA	4	13067	13077	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119655310
46	NC_008693	ATA	4	13144	13154	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119655310
47	NC_008693	TAA	4	14666	14677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119655312
48	NC_008693	ACTAA	3	14714	14727	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	119655312
49	NC_008693	TTA	5	15099	15113	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	119655313
50	NC_008693	A	12	16251	16262	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	119655311
51	NC_008693	TAA	4	16272	16283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119655311
52	NC_008693	TTAC	3	16874	16884	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	119655314
53	NC_008693	TATTT	3	16979	16992	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	119655314
54	NC_008693	T	15	17391	17405	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	119655314
55	NC_008693	AATT	3	17903	17913	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	119655314
56	NC_008693	TAA	4	17951	17961	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119655314
57	NC_008693	TAT	4	18012	18023	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119655314
58	NC_008693	TTAA	3	18241	18251	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	119655315
59	NC_008693	TTA	5	18310	18324	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	119655315

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Romanomermis iyengari mitochondrion