Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium barbadense chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008641ATT5489849121533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_008641TGT449654975110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_008641GTT450625072110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_008641TAA4669167021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_008641AAT4670967201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_008641TAT4843084411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_008641ATA413604136151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_008641TTA417257172681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_008641ATG418307183181233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %119368489
10NC_008641TAA423998240081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %119368490
11NC_008641GTT42443024441120 %66.67 %33.33 %0 %8 %119368490
12NC_008641GAA427876278871266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_008641TAT428557285671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_008641TTA437142371531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_008641ATA538313383281666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_008641ATA538372383871666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_008641TAA438456384661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_008641ATA444957449691366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_008641TAG446630466401133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %119368500
20NC_008641AAT448520485301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_008641TAA449735497471366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_008641ATT550427504401433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_008641TTA453459534701233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_008641CAA453964539741166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_008641CTT45575455765120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_008641ATT562570625841533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_008641CTT46564565656120 %66.67 %0 %33.33 %8 %119368511
28NC_008641AAT467596676071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_008641TCT46924969261130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
30NC_008641ATT671582716001933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
31NC_008641ATA572158721711466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_008641CTT47821578225110 %66.67 %0 %33.33 %9 %119368545
33NC_008641ATA488552885631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %119368545
34NC_008641CTT48895088961120 %66.67 %0 %33.33 %8 %119368545
35NC_008641GAT489422894321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %119368545
36NC_008641GAT490809908191133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %119368545
37NC_008641AGA494528945381166.67 %0 %33.33 %0 %9 %119368545
38NC_008641TTC4103821103832120 %66.67 %0 %33.33 %8 %119368523
39NC_008641TAT41144631144741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %119368523
40NC_008641TAA41144951145051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %119368523
41NC_008641ATT51171151171301633.33 %66.67 %0 %0 %6 %119368523
42NC_008641ATA41174111174211166.67 %33.33 %0 %0 %9 %119368523
43NC_008641ATA41183991184111366.67 %33.33 %0 %0 %7 %119368523
44NC_008641TAA41287971288081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %119368523
45NC_008641TTA41291941292051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %119368523
46NC_008641GAA41339341339451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %119368523
47NC_008641TTC6134637134655190 %66.67 %0 %33.33 %10 %119368523
48NC_008641GAA41453271453381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %119368523
49NC_008641ACC41538211538311133.33 %0 %0 %66.67 %9 %119368560
50NC_008641TTC4154620154630110 %66.67 %0 %33.33 %9 %119368560
51NC_008641ATC41583401583501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
52NC_008641ATC41597271597371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %119368562
53NC_008641GAA51601971602111566.67 %0 %33.33 %0 %6 %119368562