ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Romanomermis culicivorax mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008640	TAT	4	1480	1491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008640	TAA	4	1802	1812	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119360180
3	NC_008640	ATA	4	2034	2045	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119360180
4	NC_008640	AGA	4	2194	2205	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	119360180
5	NC_008640	AAT	4	2277	2288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119360180
6	NC_008640	TAA	5	2686	2701	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	119360181
7	NC_008640	AAT	4	3669	3680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008640	TAT	6	4516	4534	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	119360182
9	NC_008640	CCT	4	4824	4835	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	119360182
10	NC_008640	TAT	5	5231	5244	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	119360182
11	NC_008640	AGA	4	5634	5645	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_008640	AAT	4	5814	5825	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008640	TAA	4	5938	5949	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008640	ATA	4	7538	7549	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008640	ATT	4	8102	8113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119360183
16	NC_008640	AGA	4	8666	8677	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_008640	AAT	4	8846	8857	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008640	TAA	4	8970	8981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008640	ATA	4	10570	10581	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_008640	ATT	4	11134	11145	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119360184
21	NC_008640	AGA	4	11699	11710	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008640	AAT	4	11879	11890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008640	TAA	4	12003	12014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008640	ATT	4	13897	13908	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119360185
25	NC_008640	TAT	4	15598	15609	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119360187
26	NC_008640	ATA	4	16035	16046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119360187
27	NC_008640	TAA	4	16047	16058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119360187
28	NC_008640	TTA	4	17602	17612	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	119360188
29	NC_008640	AAG	4	18637	18648	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	119360188
30	NC_008640	CTC	4	19296	19308	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
31	NC_008640	TAT	4	19928	19939	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_008640	TTA	4	21521	21531	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_008640	TCT	4	21825	21836	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_008640	TAA	4	22385	22396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	119360189
35	NC_008640	TAT	4	22953	22964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_008640	ATA	4	23805	23815	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	119360190
37	NC_008640	TTA	4	23817	23828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	119360190
38	NC_008640	TTA	4	25684	25694	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_008640	TCT	4	25988	25999	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Romanomermis culicivorax mitochondrion